ghmm非常好的hmm实现，支持鉴别训练.gz

【实例简介】
hmm的开源实现，实现简洁，支持鉴别训练
【实例截图】
【核心代码】
4744302543341878984.gz
└── ghmm-0.9-rc1
├── acinclude.m4
├── aclocal.m4
├── AUTHORS
├── autogen.sh
├── ChangeLog
├── config.guess
├── config.h.in
├── config.sub
├── configure
├── configure.in
├── COPYING
├── COPYRIGHT.txt
├── depcomp
├── dist_hook.mak
├── doc
│   ├── ghmm.dtd.1.0
│   ├── xml_cont_example.xml
│   ├── xml_data_structure.fig
│   ├── xml_example.xml
│   ├── xml_mix_cont_example.xml
│   └── xml_switching-example.xml
├── ghmm
│   ├── cluster.c
│   ├── cluster.h
│   ├── discrime.c
│   ├── discrime.h
│   ├── foba.c
│   ├── foba.h
│   ├── gauss_tail.c
│   ├── ghmmconfig.h
│   ├── ghmmconfig.h.in
│   ├── ghmm.h
│   ├── ghmm_internals.c
│   ├── ghmm_internals.h
│   ├── gradescent.c
│   ├── gradescent.h
│   ├── kbest.c
│   ├── kbest.h
│   ├── linkedlist.c
│   ├── Makefile.am
│   ├── Makefile.in
│   ├── matrix.c
│   ├── matrix.h
│   ├── matrixop.c
│   ├── matrixop.h
│   ├── mes.c
│   ├── mes.h
│   ├── model.c
│   ├── model.h
│   ├── modelutil.c
│   ├── mprintf.c
│   ├── mprintf.h
│   ├── mt19937ar.c
│   ├── obsolete.h
│   ├── pmodel.c
│   ├── pmodel.h
│   ├── psequence.c
│   ├── psequence.h
│   ├── pviterbi.c
│   ├── pviterbi.h
│   ├── pviterbi_propagate.c
│   ├── pviterbi_propagate.h
│   ├── randvar.c
│   ├── randvar.h
│   ├── reestimate.c
│   ├── reestimate.h
│   ├── rng.c
│   ├── rng.h
│   ├── root_finder.c
│   ├── scanner.c
│   ├── scanner.h
│   ├── scluster.c
│   ├── scluster.h
│   ├── sdfoba.c
│   ├── sdfoba.h
│   ├── sdmodel.c
│   ├── sdmodel.h
│   ├── sdviterbi.c
│   ├── sequence.c
│   ├── sequence.h
│   ├── sfoba.c
│   ├── sfoba.h
│   ├── sgenerate.c
│   ├── sgenerate.h
│   ├── smap_classify.c
│   ├── smap_classify.h
│   ├── smixturehmm.c
│   ├── smixturehmm.h
│   ├── smodel.c
│   ├── smodel.h
│   ├── sreestimate.c
│   ├── sreestimate.h
│   ├── sviterbi.c
│   ├── sviterbi.h
│   ├── unsupported.h
│   ├── vector.c
│   ├── vector.h
│   ├── viterbi.c
│   ├── viterbi.h
│   ├── xmlreader.c
│   ├── xmlreader.h
│   ├── xmlwriter.c
│   └── xmlwriter.h
├── ghmmwrapper
│   ├── class_change.py
│   ├── ghmm_gato
│   │   ├── DataStructures.py
│   │   ├── EditObjectAttributesDialog.py
│   │   ├── GatoGlobals.py
│   │   ├── Graph.py
│   │   ├── GraphUtil.py
│   │   ├── HMMEd.py
│   │   ├── __init__.py
│   │   └── xmlutil.py
│   ├── ghmmhelper.py
│   ├── ghmm.py
│   ├── ghmmunittests.py
│   ├── ghmmwrapper.i
│   ├── gql.c
│   ├── INSTALL
│   ├── Makefile.am
│   ├── Makefile.in
│   ├── mixture.py
│   ├── modhmmer.py
│   ├── pclasschange.c
│   ├── pclasschange.h
│   ├── sclass_change.c
│   ├── sclass_change.h
│   ├── sdclass_change.c
│   ├── sdclass_change.h
│   ├── setup.py
│   ├── testdata
│   │   ├── discrete.xml
│   │   ├── d_seq.sqd
│   │   ├── es_discrete_testwrite.seq
│   │   ├── model_label.xml
│   │   ├── multexon-4.xml
│   │   ├── multiple_hmmer.hmm
│   │   ├── test10.sqd
│   │   ├── test2.xml
│   │   ├── tiny.smo
│   │   ├── tiny.txt.sqd
│   │   ├── tk.hmm
│   │   └── xml_cont_multiple.xml
│   ├── wrapper_alphabet.i
│   ├── wrapper_arrays.i
│   ├── wrapper_cmodel.i
│   ├── wrapper_cseq.i
│   ├── wrapper_dmodel.i
│   ├── wrapper_dpmodel.i
│   ├── wrapper_dpseq.i
│   ├── wrapper_dseq.i
│   └── wrapper_xmlfile.i
├── GPL.txt
├── HMMEd
│   ├── EditingContext.py
│   ├── HMMEd
│   ├── HMMEditingContext.py
│   ├── HMMEditor.py
│   ├── Makefile.am
│   ├── Makefile.in
│   ├── ObjectHMM.py
│   └── setup.py
├── INSTALL
├── install-sh
├── LGPL.txt
├── ltmain.sh
├── Makefile.am
├── Makefile.in
├── missing
├── NEWS
├── README
├── tests
│   ├── chmm.c
│   ├── chmm_test.c
│   ├── coin_toss_test.c
│   ├── data
│   │   ├── Makefile.am
│   │   ├── Makefile.in
│   │   ├── test100.sqd
│   │   ├── test10.sqd
│   │   ├── test.smo
│   │   └── viterbi.sh
│   ├── label_higher_order_test.c
│   ├── libxml-test.c
│   ├── Makefile.am
│   ├── Makefile.in
│   ├── randvar_test.c
│   ├── read_fa.c
│   ├── root_finder_test.c
│   ├── sequences_old_format.c
│   ├── sequences_test.c
│   ├── shmm_viterbi_test.c
│   ├── test_gsl_ran_gaussian_tail.c
│   └── two_states_three_symbols.c
├── ToDo
├── tools
│   ├── cluster.c
│   ├── ghmm-config.in
│   ├── Makefile.am
│   ├── Makefile.in
│   ├── probdist.c
│   ├── scluster.c
│   ├── smix_hmm.c
│   └── smo2xml.c
└── version.m4

10 directories, 197 files