GROMACS windows双精度5.11版

【实例简介】
GROMACS windows双精度5.11版 在cmd下使用，非常方便，适合做能量优化和其他一些小计算量工作 MD最好还是在服务器上运行
【实例截图】
【核心代码】
d62c9138-d91e-445b-90eb-d2ed95d8d944
└── GMX-5.1.1win版
├── bin
│   ├── 1AKI.pdb
│   ├── demux.pl
│   ├── gmx-completion.bash
│   ├── gmx-completion-gmx_d.bash
│   ├── gmx.exe
│   ├── GMXRC
│   ├── GMXRC.bash
│   ├── GMXRC.csh
│   ├── GMXRC.zsh
│   ├── libiomp5md.dll
│   └── xplor2gmx.pl
└── share
├── 1AKI.pdb
└── gromacs
├── 1AKI.pdb
├── COPYING
├── README_FreeEnergyModifications.txt
├── README.tutor
└── top
├── 1AKI.pdb
├── amber03.ff
│   ├── aminoacids.arn
│   ├── aminoacids.c.tdb
│   ├── aminoacids.hdb
│   ├── aminoacids.n.tdb
│   ├── aminoacids.r2b
│   ├── aminoacids.rtp
│   ├── aminoacids.vsd
│   ├── atomtypes.atp
│   ├── dna.arn
│   ├── dna.hdb
│   ├── dna.r2b
│   ├── dna.rtp
│   ├── ffbonded.itp
│   ├── ffnonbonded.itp
│   ├── forcefield.doc
│   ├── forcefield.itp
│   ├── gbsa.itp
│   ├── ions.itp
│   ├── rna.arn
│   ├── rna.hdb
│   ├── rna.r2b
│   ├── rna.rtp
│   ├── spce.itp
│   ├── spc.itp
│   ├── tip3p.itp
│   ├── tip4pew.itp
│   ├── tip4p.itp
│   ├── tip5p.itp
│   ├── urea.itp
│   └── watermodels.dat
├── amber94.ff
│   ├── aminoacids.arn
│   ├── aminoacids.c.tdb
│   ├── aminoacids.hdb
│   ├── aminoacids.n.tdb
│   ├── aminoacids.r2b
│   ├── aminoacids.rtp
│   ├── aminoacids.vsd
│   ├── atomtypes.atp
│   ├── dna.arn
│   ├── dna.hdb
│   ├── dna.r2b
│   ├── dna.rtp
│   ├── ffbonded.itp
│   ├── ffnonbonded.itp
│   ├── forcefield.doc
│   ├── forcefield.itp
│   ├── gbsa.itp
│   ├── ions.itp
│   ├── rna.arn
│   ├── rna.hdb
│   ├── rna.r2b
│   ├── rna.rtp
│   ├── spce.itp
│   ├── spc.itp
│   ├── tip3p.itp
│   ├── tip4pew.itp
│   ├── tip4p.itp
│   ├── tip5p.itp
│   ├── urea.itp
│   └── watermodels.dat
├── amber96.ff
│   ├── aminoacids.arn
│   ├── aminoacids.c.tdb
│   ├── aminoacids.hdb
│   ├── aminoacids.n.tdb
│   ├── aminoacids.r2b
│   ├── aminoacids.rtp
│   ├── aminoacids.vsd
│   ├── atomtypes.atp
│   ├── dna.arn
│   ├── dna.hdb
│   ├── dna.r2b
│   ├── dna.rtp
│   ├── ffbonded.itp
│   ├── ffnonbonded.itp
│   ├── forcefield.doc
│   ├── forcefield.itp
│   ├── gbsa.itp
│   ├── ions.itp
│   ├── rna.arn
│   ├── rna.hdb
│   ├── rna.r2b
│   ├── rna.rtp
│   ├── spce.itp
│   ├── spc.itp
│   ├── tip3p.itp
│   ├── tip4pew.itp
│   ├── tip4p.itp
│   ├── tip5p.itp
│   ├── urea.itp
│   └── watermodels.dat
├── amber99.ff
│   ├── aminoacids.arn
│   ├── aminoacids.c.tdb
│   ├── aminoacids.hdb
│   ├── aminoacids.n.tdb
│   ├── aminoacids.r2b
│   ├── aminoacids.rtp
│   ├── aminoacids.vsd
│   ├── atomtypes.atp
│   ├── dna.arn
│   ├── dna.hdb
│   ├── dna.r2b
│   ├── dna.rtp
│   ├── ffbonded.itp
│   ├── ffnonbonded.itp
│   ├── forcefield.doc
│   ├── forcefield.itp
│   ├── gbsa.itp
│   ├── ions.itp
│   ├── rna.arn
│   ├── rna.hdb
│   ├── rna.r2b
│   ├── rna.rtp
│   ├── spce.itp
│   ├── spc.itp
│   ├── tip3p.itp
│   ├── tip4pew.itp
│   ├── tip4p.itp
│   ├── tip5p.itp
│   ├── urea.itp
│   └── watermodels.dat
├── amber99sb.ff
│   ├── aminoacids.arn
│   ├── aminoacids.c.tdb
│   ├── aminoacids.hdb
│   ├── aminoacids.n.tdb
│   ├── aminoacids.r2b
│   ├── aminoacids.rtp
│   ├── aminoacids.vsd
│   ├── atomtypes.atp
│   ├── dna.arn
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│   ├── dna.r2b
│   ├── dna.rtp
│   ├── ffbonded.itp
│   ├── ffnonbonded.itp
│   ├── forcefield.doc
│   ├── forcefield.itp
│   ├── gbsa.itp
│   ├── ions.itp
│   ├── rna.arn
│   ├── rna.hdb
│   ├── rna.r2b
│   ├── rna.rtp
│   ├── spce.itp
│   ├── spc.itp
│   ├── tip3p.itp
│   ├── tip4pew.itp
│   ├── tip4p.itp
│   ├── tip5p.itp
│   ├── urea.itp
│   └── watermodels.dat
├── amber99sb-ildn.ff
│   ├── aminoacids.arn
│   ├── aminoacids.c.tdb
│   ├── aminoacids.hdb
│   ├── aminoacids.n.tdb
│   ├── aminoacids.r2b
│   ├── aminoacids.rtp
│   ├── aminoacids.vsd
│   ├── atomtypes.atp
│   ├── dna.arn
│   ├── dna.hdb
│   ├── dna.r2b
│   ├── dna.rtp
│   ├── ffbonded.itp
│   ├── ffnonbonded.itp
│   ├── forcefield.doc
│   ├── forcefield.itp
│   ├── gbsa.itp
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│   ├── rna.arn
│   ├── rna.hdb
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│   ├── rna.rtp
│   ├── spce.itp
│   ├── spc.itp
│   ├── tip3p.itp
│   ├── tip4pew.itp
│   ├── tip4p.itp
│   ├── tip5p.itp
│   ├── urea.itp
│   └── watermodels.dat
├── amberGS.ff
│   ├── aminoacids.arn
│   ├── aminoacids.c.tdb
│   ├── aminoacids.hdb
│   ├── aminoacids.n.tdb
│   ├── aminoacids.r2b
│   ├── aminoacids.rtp
│   ├── aminoacids.vsd
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│   ├── dna.arn
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│   ├── ffnonbonded.itp
│   ├── forcefield.doc
│   ├── forcefield.itp
│   ├── gbsa.itp
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│   ├── spce.itp
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│   ├── tip3p.itp
│   ├── tip4pew.itp
│   ├── tip4p.itp
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│   ├── urea.itp
│   └── watermodels.dat
├── atommass.dat
├── atom_nom.tbl
├── bonds.dlg
├── bromacs.dat
├── ca-shift.dat
├── cb-shift.dat
├── charmm27.ff
│   ├── aminoacids.arn
│   ├── aminoacids.c.tdb
│   ├── aminoacids.hdb
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│   ├── aminoacids.r2b
│   ├── aminoacids.rtp
│   ├── aminoacids.vsd
│   ├── atomtypes.atp
│   ├── cmap.itp
│   ├── dna.arn
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│   ├── dna.n.tdb
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│   ├── ffbonded.itp
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│   ├── ffnanonbonded.itp
│   ├── ffnonbonded.itp
│   ├── forcefield.doc
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│   ├── gb.itp
│   ├── ions.itp
│   ├── lipids.hdb
│   ├── lipids.rtp
│   ├── rna.arn
│   ├── rna.c.tdb
│   ├── rna.hdb
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│   ├── rna.r2b
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│   ├── spce.itp
│   ├── spc.itp
│   ├── tip3p.itp
│   ├── tip4p.itp
│   ├── tip5p.itp
│   ├── tips3p.itp
│   └── watermodels.dat
├── co-shift.dat
├── defselection.dat
├── dgsolv.dat
├── edissoc.dat
├── electroneg.dat
├── elements.dat
├── export.dlg
├── ffG43a1.itp
├── ffG43a2.itp
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├── ffG53a5.itp
├── ffG53a6.itp
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├── flexspce.itp
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│   ├── ff_dum.itp
│   ├── ffnonbonded.itp
│   ├── forcefield.doc
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│   ├── methanol216.gro
│   ├── methanol.itp
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│   ├── spc.itp
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│   ├── tip4p.itp
│   └── watermodels.dat
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│   ├── tip4p.itp
│   └── watermodels.dat
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│   ├── ff_dum.itp
│   ├── ffnonbonded.itp
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│   └── watermodels.dat
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│   ├── 1propanol.itp
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│   ├── atomtypes.atp
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│   ├── ffbonded.itp
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│   ├── tip4p.itp
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│   ├── tip5p.itp
│   └── watermodels.dat
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├── random.dat
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├── refi_aa.dat
├── residues.dtd
├── residues.xml
├── residuetypes.dat
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├── spc216.gro
├── spce.itp
├── spc.itp
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├── ss.map
├── surface.dat
├── sw.itp
├── table6-10.xvg
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├── tip3p.itp
├── tip4p.gro
├── tip4p.itp
├── tip5p.gro
├── vdw-msms.dat
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└── xlateat.dat

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