实例介绍
【实例简介】
创建你的第一个贝叶斯网络 手工创建一个模型 从一个文件加载一个模型 使用 GUI 创建一个模型 推断 处理边缘分布 处理联合分布 虚拟证据 最或然率解释 条件概率分布 列表（多项式）节点 Noisy-or 节点 其它（噪音）确定性节点 Softmax（多项式 分对数）节点 神经网络节点 根节点 高斯节点 广义线性模型节点 分类 / 回归树节点 其它连续分布 CPD 类型摘要 模型举例 高斯混合模型 PCA、ICA等 专家系统的混合 专家系统的分等级混合 QMR 条件高斯模型 其它混合模型 参数学习 从一个文件里加载数据 从完整的数据中进行最大似然参数估计 先验参数 从完整的数据中（连续）更新贝
【实例截图】
【核心代码】
贝叶斯网络工具包
└── 贝叶斯网络工具包
├── BNT_SLP
│ ├── add_SLP.m
│ ├── chi_square.asv
│ ├── chi_square.m
│ ├── cond_indep_fisher_ztest.m
│ ├── contents.m
│ ├── datas
│ │ ├── Networks_to_gener_data
│ │ │ ├── alarm.m
│ │ │ ├── asia.m
│ │ │ ├── car.m
│ │ │ ├── hailfinder.bif
│ │ │ ├── hailfinder.m
│ │ │ ├── insur.m
│ │ │ ├── jouet1.m
│ │ │ ├── jouet2.m
│ │ │ ├── jouet3.m
│ │ │ ├── jouet4.m
│ │ │ ├── jouet5.m
│ │ │ ├── s1.m
│ │ │ ├── s2.m
│ │ │ ├── s3.m
│ │ │ └── s4.m
│ │ ├── SPECT.names
│ │ ├── SPECTD.m
│ │ ├── abalone
│ │ ├── abalone.names
│ │ ├── abaloneD.m
│ │ ├── alarm.mat
│ │ ├── alarm5000.mat
│ │ ├── alarmdag.mat
│ │ ├── asia1000.mat
│ │ ├── asia10000.mat
│ │ ├── asia2000.mat
│ │ ├── asia20000.mat
│ │ ├── asia500.mat
│ │ ├── asia5000.mat
│ │ ├── austr
│ │ ├── australian
│ │ ├── australian.doc
│ │ ├── australianD.m
│ │ ├── car
│ │ ├── car.names
│ │ ├── carD.m
│ │ ├── cheng.mat
│ │ ├── contracep.names
│ │ ├── contrasep
│ │ ├── contrasepD.m
│ │ ├── diabetes
│ │ ├── diabetes.names
│ │ ├── diabetesD.m
│ │ ├── german
│ │ ├── german.doc
│ │ ├── germanD.m
│ │ ├── heart
│ │ ├── heart.doc
│ │ ├── heart2
│ │ ├── heart2.mat
│ │ ├── heartD.m
│ │ ├── hepatitis.dat
│ │ ├── hepatitisL.m
│ │ ├── horse.dat
│ │ ├── horseD
│ │ ├── horseL.m
│ │ ├── horseTD
│ │ ├── horse_test.dat
│ │ ├── house.dat
│ │ ├── houseL.m
│ │ ├── letterD.data
│ │ ├── letterD.m
│ │ ├── letterD.names
│ │ ├── letter_A
│ │ ├── letter_T
│ │ ├── monks.names
│ │ ├── monks1.dat
│ │ ├── monks1D.m
│ │ ├── monks2.dat
│ │ ├── monks2D.m
│ │ ├── monks3.dat
│ │ ├── monks3D.m
│ │ ├── monks_A1
│ │ ├── monks_A2
│ │ ├── monks_A3
│ │ ├── monks_T
│ │ ├── monks_test.dat
│ │ ├── mushrooms.dat
│ │ ├── mushroomsL.m
│ │ ├── nursery
│ │ ├── nursery.names
│ │ ├── nurseryD.m
│ │ ├── penD.m
│ │ ├── pen_A
│ │ ├── pen_T
│ │ ├── pendigits.names
│ │ ├── segment
│ │ ├── segment.doc
│ │ ├── segmentD.m
│ │ ├── soybean.dat
│ │ ├── soybeanL.m
│ │ ├── soybean_test.dat
│ │ ├── spect_a
│ │ ├── spect_t
│ │ ├── tae
│ │ ├── tae.names
│ │ ├── taeD.m
│ │ ├── thyroidL.m
│ │ ├── thyroid_app.mat
│ │ ├── thyroid_test.mat
│ │ ├── wine
│ │ ├── wine.names
│ │ ├── wineD.m
│ │ ├── zoo
│ │ ├── zoo.names
│ │ └── zooD.m
│ ├── documentation
│ │ └── SLP_doc.pdf
│ ├── examples
│ │ ├── demo_hist_ic.m
│ │ ├── mk_alarm_bnet.m
│ │ ├── mk_asia_bnet.m
│ │ ├── mk_insur_bnet.m
│ │ ├── test_bnpc.m
│ │ ├── test_bnpc_asia.m
│ │ ├── test_bnpc_asia2.m
│ │ ├── test_cache.m
│ │ ├── test_chisquare.m
│ │ ├── test_cpdag.m
│ │ ├── test_data_generation.m
│ │ ├── test_ges.m
│ │ ├── test_gs2.m
│ │ ├── test_kldiv.m
│ │ ├── test_knn.m
│ │ ├── test_mwst.m
│ │ ├── test_netica_export.m
│ │ ├── test_pc.m
│ │ ├── test_sem1.m
│ │ ├── test_sem2.m
│ │ ├── test_sem3.m
│ │ └── test_structure.m
│ ├── examples_bnclassification.asv
│ ├── examples_bnclassification.m
│ ├── learning
│ │ ├── @jtree_inf_engine2
│ │ │ ├── cliques_from_engine.m
│ │ │ ├── clq_containing_nodes.m
│ │ │ ├── collect_evidence.m
│ │ │ ├── disp.m
│ │ │ ├── display.m
│ │ │ ├── distribute_evidence.m
│ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ ├── enter_soft_evidence.m
│ │ │ ├── find_max_config.m
│ │ │ ├── find_mpe.m
│ │ │ ├── get.m
│ │ │ ├── init_pot.m
│ │ │ ├── jtree_inf_engine2.m
│ │ │ ├── marginal_family.m
│ │ │ ├── marginal_nodes.m
│ │ │ ├── set.m
│ │ │ └── set_fields.m
│ │ ├── learn_struct_EM.m
│ │ ├── learn_struct_bnpc.m
│ │ ├── learn_struct_ges.m
│ │ ├── learn_struct_ges_EM.m
│ │ ├── learn_struct_gs.m
│ │ ├── learn_struct_gs2.m
│ │ ├── learn_struct_hc.m
│ │ ├── learn_struct_mcmc.m
│ │ ├── learn_struct_mwst.m
│ │ ├── learn_struct_mwst_EM.m
│ │ ├── learn_struct_pdag_pc_mod.m
│ │ ├── learn_struct_tan.m
│ │ ├── learn_struct_tan_EM.m
│ │ └── mk_naive_struct.m
│ ├── license.gpl
│ ├── misc
│ │ ├── CPT_from_bnet.m
│ │ ├── Markov_equivalent_dags.m
│ │ ├── bnt_to_mat.m
│ │ ├── chi2_table.m
│ │ ├── classification_evaluation.m
│ │ ├── complete_pattern.m
│ │ ├── compute_bnet_nparams.m
│ │ ├── confiance.m
│ │ ├── cpdag_to_dag.m
│ │ ├── cpdag_to_dag2.m
│ │ ├── dag_to_cpdag.m
│ │ ├── dag_to_cpdag1.m
│ │ ├── discretization.m
│ │ ├── editing_dist.m
│ │ ├── export_cases.m
│ │ ├── export_dnet.m
│ │ ├── exportfig.m
│ │ ├── find_nodes_in_undirected_component.m
│ │ ├── foptions.m
│ │ ├── gener_MAR_net.m
│ │ ├── gener_MCAR_net.m
│ │ ├── gener_data_from_bnet_miss.m
│ │ ├── gener_discrete_dist.m
│ │ ├── gener_empty_cache.m
│ │ ├── hist_ic.m
│ │ ├── histc_ic.m
│ │ ├── inference.m
│ │ ├── isdag.m
│ │ ├── ismemberclique.m
│ │ ├── knn.m
│ │ ├── mat_to_bnt.m
│ │ ├── mk_nbrs_of_dag_topo.m
│ │ ├── mk_nbrs_of_pdag_add.m
│ │ ├── mk_nbrs_of_pdag_del.m
│ │ ├── multiply_one_marginal.c
│ │ ├── multiply_one_marginal.dll
│ │ ├── multiply_one_marginal.mexa64
│ │ ├── multiply_one_marginal.mexglx
│ │ ├── pdag_to_all_dags.m
│ │ ├── pdag_to_dag.m
│ │ ├── pdag_unsigned_to_signed.m
│ │ └── subsets1.m
│ ├── scoring
│ │ ├── calculate_mutual_information_array.m
│ │ ├── cond_indep_chisquare.asv
│ │ ├── cond_indep_chisquare.m
│ │ ├── cond_mutual_info_score.m
│ │ ├── kl_divergence.m
│ │ ├── kl_divergence2.m
│ │ ├── mutual_info_score.m
│ │ ├── score_add_to_cache.m
│ │ ├── score_dags.m
│ │ ├── score_family.m
│ │ ├── score_family0.m
│ │ ├── score_find_in_cache.m
│ │ └── score_init_cache.m
│ └── working
│ ├── LinkStrength_orig
│ │ ├── AUX_CPT_value.m
│ │ ├── AUX_graph_gray_scale_factor.m
│ │ ├── AUX_graph_main.m
│ │ ├── AUX_graph_write_arcs.m
│ │ ├── AUX_graph_write_header.m
│ │ ├── AUX_graph_write_nodes.m
│ │ ├── AUX_increment_state.m
│ │ ├── AUX_lin_index.m
│ │ ├── AUX_set_epsilon.m
│ │ ├── BNT_LinkStrength_Package.pdf
│ │ ├── README
│ │ ├── SAMPLE_USE_GRAPHS.m
│ │ ├── SAMPLE_USE_SCREEN_OUTPUT.m
│ │ ├── calc_entropy.m
│ │ ├── calc_link_strength.m
│ │ ├── calc_mutual_information.m
│ │ ├── dotguide.pdf
│ │ ├── get_key.m
│ │ ├── graph_plain_to_dot.m
│ │ ├── graph_with_entropy_to_dot.m
│ │ ├── graph_with_link_strength_to_dot.m
│ │ ├── graph_with_mutual_info_to_dot.m
│ │ ├── mk_asia_bnet_with_names.m
│ │ ├── print_DAG_structure.m
│ │ ├── print_all_entropy.m
│ │ ├── print_all_link_strength.m
│ │ └── print_all_mutual_information.m
│ ├── chisquare_lucky.m
│ ├── compute_prob.m
│ ├── cs_score.m
│ ├── elr
│ │ ├── beta2theta.m
│ │ ├── bnet_pak.m
│ │ ├── bnet_unpak.m
│ │ ├── cpt_size.m
│ │ ├── elr.m
│ │ ├── global_nLCL.m
│ │ ├── grad_LCL.m
│ │ ├── grad_global_nLCL.m
│ │ ├── learn_params_elr.m
│ │ └── shufflemulticlass.m
│ ├── espected_BIC.m
│ ├── espected_BICi.m
│ ├── fill_in_by_inference.m
│ ├── gener_NMAR_data.m
│ ├── get_BIC.m
│ ├── get_espected_counts.m
│ ├── learn_struct_bnpc0.m
│ ├── learn_struct_fan.m
│ ├── learn_struct_fan_EM.m
│ ├── learn_struct_ges_new.m
│ ├── learn_struct_gs2_limited.m
│ ├── learn_struct_pdag_pc1.m
│ ├── learn_struct_pdag_pc_constrain.m
│ ├── log_prob_node.m
│ ├── minimum_spanning_forest.m
│ ├── mk_nbrs_of_dag_topo_limited.m
│ ├── mk_nbrs_of_digraph_limited.m
│ ├── mk_nbrs_of_pdag_add_limited.m
│ ├── mk_nbrs_of_pdag_add_new_avoiraveclimited.m
│ ├── modded_LinkStrength
│ │ ├── AUX_CPT_value.m
│ │ ├── AUX_graph_gray_scale_factor.m
│ │ ├── AUX_graph_main.m
│ │ ├── AUX_graph_write_arcs.m
│ │ ├── AUX_graph_write_header.m
│ │ ├── AUX_graph_write_nodes.m
│ │ ├── AUX_increment_state.m
│ │ ├── AUX_lin_index.m
│ │ ├── AUX_set_epsilon.m
│ │ ├── README
│ │ ├── SAMPLE_USE_GRAPHS.m
│ │ ├── SAMPLE_USE_SCREEN_OUTPUT.m
│ │ ├── calc_entropy.m
│ │ ├── calc_link_strength.m
│ │ ├── calc_mutual_information.m
│ │ ├── get_key.m
│ │ ├── graph_plain_to_dot.m
│ │ ├── graph_with_entropy_to_dot.m
│ │ ├── graph_with_link_strength_to_dot.m
│ │ ├── graph_with_link_strength_to_dot2.m
│ │ ├── graph_with_mutual_info_to_dot.m
│ │ ├── mk_asia_bnet_with_names.m
│ │ ├── print_DAG_structure.m
│ │ ├── print_all_entropy.m
│ │ ├── print_all_link_strength.m
│ │ └── print_all_mutual_information.m
│ ├── partialconnected.m
│ ├── score_BIC_from_params.m
│ ├── score_dag.c
│ │ ├── learn_struct_gs_dtab.m
│ │ ├── learn_struct_gs_dtab_INFO.txt
│ │ ├── learn_struct_gs_dtabx.m
│ │ ├── learn_struct_gs_dtabxx.m
│ │ ├── score_dag_x.c
│ │ ├── score_family_x.c
│ │ ├── score_x.c
│ │ └── score_x.h
│ ├── test_MI.m
│ ├── test_MWSTEM.m
│ ├── test_bnpc.m
│ ├── test_cheng_alarm.m
│ ├── test_cs_score.m
│ ├── test_ess.m
│ ├── test_forest.m
│ ├── test_forest_miss.m
│ ├── test_gener.m
│ ├── test_ges_em.m
│ ├── test_prob_inf.m
│ ├── testalarm.m
│ └── testaustr.m
├── FullBNT-1.0.4
│ └── FullBNT-1.0.4
│ ├── #ChangeLog.txt#
│ ├── BNT
│ │ ├── @assocarray
│ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ └── Root
│ │ │ ├── assocarray.m
│ │ │ └── subsref.m
│ │ ├── CPDs
│ │ │ ├── @boolean_CPD
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ └── boolean_CPD.m
│ │ │ ├── @deterministic_CPD
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ └── deterministic_CPD.m
│ │ │ ├── @discrete_CPD
│ │ │ │ ├── CPD_to_lambda_msg.m
│ │ │ │ ├── CPD_to_pi.m
│ │ │ │ ├── CPD_to_scgpot.m
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── convert_to_pot.m
│ │ │ │ │ ├── convert_to_table.m
│ │ │ │ │ ├── prob_CPD.m
│ │ │ │ │ └── prob_node.m
│ │ │ │ ├── README
│ │ │ │ ├── convert_CPD_to_table_hidden_ps.m
│ │ │ │ ├── convert_obs_CPD_to_table.m
│ │ │ │ ├── convert_to_pot.m
│ │ │ │ ├── convert_to_sparse_table.c
│ │ │ │ ├── convert_to_table.m
│ │ │ │ ├── discrete_CPD.m
│ │ │ │ ├── dom_sizes.m
│ │ │ │ ├── log_prob_node.m
│ │ │ │ ├── private
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ └── prod_CPT_and_pi_msgs.m
│ │ │ │ ├── prob_node.m
│ │ │ │ └── sample_node.m
│ │ │ ├── @gaussian_CPD
│ │ │ │ ├── CPD_to_lambda_msg.m
│ │ │ │ ├── CPD_to_pi.m
│ │ │ │ ├── CPD_to_scgpot.m
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ ├── CPD_to_lambda_msg.m
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── gaussian_CPD.m
│ │ │ │ │ ├── log_prob_node.m
│ │ │ │ │ ├── maximize_params.m
│ │ │ │ │ ├── update_ess.m
│ │ │ │ │ └── update_tied_ess.m
│ │ │ │ ├── adjustable_CPD.m
│ │ │ │ ├── convert_CPD_to_table_hidden_ps.m
│ │ │ │ ├── convert_to_pot.m
│ │ │ │ ├── convert_to_table.m
│ │ │ │ ├── display.m
│ │ │ │ ├── gaussian_CPD.m
│ │ │ │ ├── gaussian_CPD_params_given_dps.m
│ │ │ │ ├── get_field.m
│ │ │ │ ├── learn_params.m
│ │ │ │ ├── log_prob_node.m
│ │ │ │ ├── maximize_params.m
│ │ │ │ ├── maximize_params_debug.m
│ │ │ │ ├── private
│ │ │ │ │ ├── CPD_to_linear_gaussian.m
│ │ │ │ │ └── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── reset_ess.m
│ │ │ │ ├── sample_node.m
│ │ │ │ ├── set_fields.m
│ │ │ │ └── update_ess.m
│ │ │ ├── @generic_CPD
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ ├── BIC_score_CPD.m
│ │ │ │ │ ├── CPD_to_dpots.m
│ │ │ │ │ └── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── README
│ │ │ │ ├── adjustable_CPD.m
│ │ │ │ ├── display.m
│ │ │ │ ├── generic_CPD.m
│ │ │ │ ├── learn_params.m
│ │ │ │ ├── log_prior.m
│ │ │ │ └── set_clamped.m
│ │ │ ├── @gmux_CPD
│ │ │ │ ├── CPD_to_lambda_msg.m
│ │ │ │ ├── CPD_to_pi.m
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ └── gmux_CPD.m
│ │ │ │ ├── convert_to_pot.m
│ │ │ │ ├── display.m
│ │ │ │ ├── gmux_CPD.m
│ │ │ │ └── sample_node.m
│ │ │ ├── @hhmm2Q_CPD
│ │ │ │ ├── CPD_to_CPT.m
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── hhmm2Q_CPD.m
│ │ │ │ ├── maximize_params.m
│ │ │ │ ├── reset_ess.m
│ │ │ │ └── update_ess.m
│ │ │ ├── @hhmmF_CPD
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── hhmmF_CPD.m
│ │ │ │ │ ├── log_prior.m
│ │ │ │ │ ├── maximize_params.m
│ │ │ │ │ ├── reset_ess.m
│ │ │ │ │ ├── update_CPT.m
│ │ │ │ │ └── update_ess.m
│ │ │ │ ├── hhmmF_CPD.m
│ │ │ │ ├── log_prior.m
│ │ │ │ ├── maximize_params.m
│ │ │ │ ├── reset_ess.m
│ │ │ │ ├── update_CPT.m
│ │ │ │ └── update_ess.m
│ │ │ ├── @hhmmQ_CPD
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── hhmmQ_CPD.m
│ │ │ │ │ ├── log_prior.m
│ │ │ │ │ ├── maximize_params.m
│ │ │ │ │ ├── reset_ess.m
│ │ │ │ │ ├── update_CPT.m
│ │ │ │ │ ├── update_ess.m
│ │ │ │ │ ├── update_ess2.m
│ │ │ │ │ ├── update_ess3.m
│ │ │ │ │ └── update_ess4.m
│ │ │ │ ├── hhmmQ_CPD.m
│ │ │ │ ├── log_prior.m
│ │ │ │ ├── maximize_params.m
│ │ │ │ ├── reset_ess.m
│ │ │ │ ├── update_CPT.m
│ │ │ │ └── update_ess.m
│ │ │ ├── @mlp_CPD
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── convert_to_table.m
│ │ │ │ ├── maximize_params.m
│ │ │ │ ├── mlp_CPD.m
│ │ │ │ ├── reset_ess.m
│ │ │ │ └── update_ess.m
│ │ │ ├── @noisyor_CPD
│ │ │ │ ├── CPD_to_CPT.m
│ │ │ │ ├── CPD_to_CPT.m~
│ │ │ │ ├── CPD_to_lambda_msg.m
│ │ │ │ ├── CPD_to_pi.m
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── noisyor_CPD.m
│ │ │ │ └── private
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ └── sum_prod_CPD_and_pi_msgs.m
│ │ │ ├── @root_CPD
│ │ │ │ ├── CPD_to_pi.m
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ ├── CPD_to_CPT.m
│ │ │ │ │ └── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── convert_to_pot.m
│ │ │ │ ├── log_marg_prob_node.m
│ │ │ │ ├── log_prob_node.m
│ │ │ │ ├── root_CPD.m
│ │ │ │ └── sample_node.m
│ │ │ ├── @softmax_CPD
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── convert_to_pot.m
│ │ │ │ ├── convert_to_table.m
│ │ │ │ ├── display.m
│ │ │ │ ├── get_field.m
│ │ │ │ ├── maximize_params.m
│ │ │ │ ├── private
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ └── extract_params.m
│ │ │ │ ├── reset_ess.m
│ │ │ │ ├── sample_node.m
│ │ │ │ ├── set_fields.m
│ │ │ │ ├── softmax_CPD.m
│ │ │ │ └── update_ess.m
│ │ │ ├── @tabular_CPD
│ │ │ │ ├── CPD_to_CPT.m
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ ├── BIC_score_CPD.m
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── bayesian_score_CPD.m
│ │ │ │ │ ├── log_marg_prob_node_case.m
│ │ │ │ │ ├── mult_CPD_and_pi_msgs.m
│ │ │ │ │ ├── prob_CPT.m
│ │ │ │ │ ├── prob_node.m
│ │ │ │ │ ├── sample_node.m
│ │ │ │ │ ├── sample_node_single_case.m
│ │ │ │ │ ├── tabular_CPD.m
│ │ │ │ │ └── update_params.m
│ │ │ │ ├── bayes_update_params.m
│ │ │ │ ├── display.m
│ │ │ │ ├── get_field.m
│ │ │ │ ├── learn_params.m
│ │ │ │ ├── log_marg_prob_node.m
│ │ │ │ ├── log_nextcase_prob_node.m
│ │ │ │ ├── log_prior.m
│ │ │ │ ├── maximize_params.m
│ │ │ │ ├── reset_ess.m
│ │ │ │ ├── set_fields.m
│ │ │ │ ├── tabular_CPD.m
│ │ │ │ ├── update_ess.m
│ │ │ │ └── update_ess_simple.m
│ │ │ ├── @tabular_decision_node
│ │ │ │ ├── CPD_to_CPT.m
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ └── tabular_decision_node.m
│ │ │ │ ├── display.m
│ │ │ │ ├── get_field.m
│ │ │ │ ├── set_fields.m
│ │ │ │ └── tabular_decision_node.m
│ │ │ ├── @tabular_kernel
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ └── tabular_kernel.m
│ │ │ │ ├── convert_to_pot.m
│ │ │ │ ├── convert_to_table.m
│ │ │ │ ├── get_field.m
│ │ │ │ ├── set_fields.m
│ │ │ │ └── tabular_kernel.m
│ │ │ ├── @tabular_utility_node
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── convert_to_pot.m
│ │ │ │ ├── display.m
│ │ │ │ └── tabular_utility_node.m
│ │ │ ├── @tree_CPD
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── display.m
│ │ │ │ ├── evaluate_tree_performance.m
│ │ │ │ ├── get_field.m
│ │ │ │ ├── learn_params.m
│ │ │ │ ├── readme.txt
│ │ │ │ ├── set_fields.m
│ │ │ │ └── tree_CPD.m
│ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ └── Root
│ │ │ ├── Old
│ │ │ │ ├── @linear_gaussian_CPD
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── linear_gaussian_CPD.m
│ │ │ │ │ ├── log_marg_prob_node.m
│ │ │ │ │ └── update_params_complete.m
│ │ │ │ ├── @root_gaussian_CPD
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── log_marg_prob_node.m
│ │ │ │ │ ├── root_gaussian_CPD.m
│ │ │ │ │ └── update_params_complete.m
│ │ │ │ ├── @tabular_chance_node
│ │ │ │ │ ├── CPD_to_upot.m
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ └── tabular_chance_node.m
│ │ │ │ └── CVS
│ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ └── Root
│ │ │ └── mk_isolated_tabular_CPD.m
│ │ ├── CVS
│ │ │ ├── Entries
│ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ ├── Repository
│ │ │ └── Root
│ │ ├── README.txt
│ │ ├── copyright.txt
│ │ ├── examples
│ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ └── Root
│ │ │ ├── dummy
│ │ │ ├── dynamic
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── HHMM
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── Map
│ │ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ │ │ └── mk_map_hhmm.m
│ │ │ │ │ │ ├── disp_map_hhmm.m
│ │ │ │ │ │ ├── learn_map.m
│ │ │ │ │ │ ├── mk_map_hhmm.m
│ │ │ │ │ │ ├── mk_rnd_map_hhmm.m
│ │ │ │ │ │ └── sample_from_map.m
│ │ │ │ │ ├── Mgram
│ │ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ │ │ └── mgram2.m
│ │ │ │ │ │ ├── letter2num.m
│ │ │ │ │ │ ├── mgram1.m
│ │ │ │ │ │ ├── mgram2.m
│ │ │ │ │ │ ├── mgram3.m
│ │ │ │ │ │ └── num2letter.m
│ │ │ │ │ ├── Motif
│ │ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ │ ├── fixed_args_mk_motif_hhmm.m
│ │ │ │ │ │ ├── learn_motif_hhmm.m
│ │ │ │ │ │ ├── mk_motif_hhmm.m
│ │ │ │ │ │ └── sample_motif_hhmm.m
│ │ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ │ ├── mk_abcd_hhmm.m
│ │ │ │ │ │ ├── mk_arrow_alpha_hhmm3.m
│ │ │ │ │ │ ├── mk_hhmm2.m
│ │ │ │ │ │ ├── mk_hhmm3.m
│ │ │ │ │ │ ├── mk_hhmm3_args.m
│ │ │ │ │ │ ├── motif_hhmm.m
│ │ │ │ │ │ └── remove_hhmm_end_state.m
│ │ │ │ │ ├── Square
│ │ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ │ │ ├── learn_square_hhmm.m
│ │ │ │ │ │ │ ├── mk_square_hhmm.m
│ │ │ │ │ │ │ ├── plot_square_hhmm.m
│ │ │ │ │ │ │ └── sample_square_hhmm.m
│ │ │ │ │ │ ├── get_square_data.m
│ │ │ │ │ │ ├── hhmm_inference.m
│ │ │ │ │ │ ├── is_F2_true_D3.m
│ │ │ │ │ │ ├── learn_square_hhmm_cts.m
│ │ │ │ │ │ ├── learn_square_hhmm_discrete.m
│ │ │ │ │ │ ├── mk_square_hhmm.m
│ │ │ │ │ │ ├── plot_square_hhmm.m
│ │ │ │ │ │ ├── sample_square_hhmm_cts.m
│ │ │ │ │ │ ├── sample_square_hhmm_discrete.m
│ │ │ │ │ │ ├── square4.mat
│ │ │ │ │ │ ├── square4_cases.mat
│ │ │ │ │ │ ├── test_square_fig.m
│ │ │ │ │ │ └── test_square_fig.mat
│ │ │ │ │ ├── abcd_hhmm.m
│ │ │ │ │ ├── add_hhmm_end_state.m
│ │ │ │ │ ├── hhmm_jtree_clqs.m
│ │ │ │ │ ├── mk_hhmm.m
│ │ │ │ │ ├── mk_hhmm_topo.m
│ │ │ │ │ ├── mk_hhmm_topo_F1.m
│ │ │ │ │ ├── pretty_print_hhmm_parse.m
│ │ │ │ │ └── remove_hhmm_end_state.m
│ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── chmm1.m
│ │ │ │ │ ├── cmp_inference.m
│ │ │ │ │ ├── kalman1.m
│ │ │ │ │ ├── old.water1.m
│ │ │ │ │ ├── online1.m
│ │ │ │ │ ├── online2.m
│ │ │ │ │ └── scg_dbn.m
│ │ │ │ ├── SLAM
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ │ ├── offline_loopy_slam.m
│ │ │ │ │ │ ├── paskin1.m
│ │ │ │ │ │ ├── skf_data_assoc_gmux2.m
│ │ │ │ │ │ └── slam_kf.m
│ │ │ │ │ ├── mk_gmux_robot_dbn.m
│ │ │ │ │ ├── mk_linear_slam.m
│ │ │ │ │ ├── slam_kf.m
│ │ │ │ │ ├── slam_offline_loopy.m
│ │ │ │ │ ├── slam_partial_kf.m
│ │ │ │ │ └── slam_stationary_loopy.m
│ │ │ │ ├── arhmm1.m
│ │ │ │ ├── bat1.m
│ │ │ │ ├── bkff1.m
│ │ │ │ ├── chmm1.m
│ │ │ │ ├── cmp_inference_dbn.m
│ │ │ │ ├── cmp_learning_dbn.m
│ │ │ │ ├── cmp_online_inference.m
│ │ │ │ ├── dhmm1.m
│ │ │ │ ├── ehmm1.m
│ │ │ │ ├── fhmm_infer.m
│ │ │ │ ├── filter_test1.m
│ │ │ │ ├── ghmm1.m
│ │ │ │ ├── ho1.m
│ │ │ │ ├── jtree_clq_test.m
│ │ │ │ ├── jtree_clq_test2.m
│ │ │ │ ├── kalman1.m
│ │ │ │ ├── kjaerulff1.m
│ │ │ │ ├── loopy_dbn1.m
│ │ │ │ ├── mhmm1.m
│ │ │ │ ├── mildew1.m
│ │ │ │ ├── mk_bat_dbn.m
│ │ │ │ ├── mk_chmm.m
│ │ │ │ ├── mk_collage_from_clqs.m
│ │ │ │ ├── mk_fhmm.m
│ │ │ │ ├── mk_mildew_dbn.m
│ │ │ │ ├── mk_orig_bat_dbn.m
│ │ │ │ ├── mk_orig_water_dbn.m
│ │ │ │ ├── mk_ps_from_clqs.m
│ │ │ │ ├── mk_uffe_dbn.m
│ │ │ │ ├── mk_water_dbn.m
│ │ │ │ ├── orig_water1.m
│ │ │ │ ├── reveal1.m
│ │ │ │ ├── scg_dbn.m
│ │ │ │ ├── skf_data_assoc_gmux.m
│ │ │ │ ├── viterbi1.m
│ │ │ │ ├── water1.m
│ │ │ │ └── water2.m
│ │ │ ├── limids
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── amnio.m
│ │ │ │ ├── asia_dt1.m
│ │ │ │ ├── id1.m
│ │ │ │ ├── oil1.m
│ │ │ │ └── pigs1.m
│ │ │ └── static
│ │ │ ├── Belprop
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── belprop_loop1_discrete.m
│ │ │ │ ├── belprop_loop1_gauss.m
│ │ │ │ ├── belprop_loopy_cg.m
│ │ │ │ ├── belprop_loopy_discrete.m
│ │ │ │ ├── belprop_loopy_gauss.m
│ │ │ │ ├── belprop_polytree_cg.m
│ │ │ │ ├── belprop_polytree_discrete.m
│ │ │ │ ├── belprop_polytree_gauss.m
│ │ │ │ ├── bp1.m
│ │ │ │ └── gmux1.m
│ │ │ ├── Brutti
│ │ │ │ ├── Belief_IOhmm.m
│ │ │ │ ├── Belief_hmdt.m
│ │ │ │ ├── Belief_hme.m
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ └── Sigmoid_Belief.m
│ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ └── Root
│ │ │ ├── HME
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── HMEforMatlab.jpg
│ │ │ │ ├── README
│ │ │ │ ├── fhme.m
│ │ │ │ ├── gen_data.m
│ │ │ │ ├── hme_class_plot.m
│ │ │ │ ├── hme_reg_plot.m
│ │ │ │ ├── hme_topobuilder.m
│ │ │ │ ├── hmemenu.asv
│ │ │ │ ├── hmemenu.m
│ │ │ │ ├── test_data_class.mat
│ │ │ │ ├── test_data_class2.mat
│ │ │ │ ├── test_data_reg.mat
│ │ │ │ ├── train_data_class.mat
│ │ │ │ └── train_data_reg.mat
│ │ │ ├── Misc
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── mixexp_data.txt
│ │ │ │ ├── mixexp_graddesc.m
│ │ │ │ ├── mixexp_plot.m
│ │ │ │ └── sprinkler.bif
│ │ │ ├── Models
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ └── mk_hmm_bnet.m
│ │ │ │ ├── mk_alarm_bnet.m
│ │ │ │ ├── mk_asia_bnet.m
│ │ │ │ ├── mk_cancer_bnet.m
│ │ │ │ ├── mk_car_bnet.m
│ │ │ │ ├── mk_hmm_bnet.m
│ │ │ │ ├── mk_ideker_bnet.m
│ │ │ │ ├── mk_incinerator_bnet.m
│ │ │ │ ├── mk_markov_chain_bnet.m
│ │ │ │ ├── mk_minimal_qmr_bnet.m
│ │ │ │ ├── mk_qmr_bnet.m
│ │ │ │ └── mk_vstruct_bnet.m
│ │ │ ├── SCG
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── scg1.m
│ │ │ │ ├── scg2.m
│ │ │ │ ├── scg3.m
│ │ │ │ ├── scg_3node.m
│ │ │ │ └── scg_unstable.m
│ │ │ ├── StructLearn
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── bic1.asv
│ │ │ │ ├── bic1.m
│ │ │ │ ├── cooper_yoo.asv
│ │ │ │ ├── cooper_yoo.m
│ │ │ │ ├── k2demo1.asv
│ │ │ │ ├── k2demo1.m
│ │ │ │ ├── mcmc1.asv
│ │ │ │ ├── mcmc1.m
│ │ │ │ ├── model_select1.asv
│ │ │ │ ├── model_select1.m
│ │ │ │ ├── model_select2.m
│ │ │ │ ├── pc1.m
│ │ │ │ └── pc2.m
│ │ │ ├── Zoubin
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── README
│ │ │ │ ├── csum.m
│ │ │ │ ├── ffa.m
│ │ │ │ ├── mfa.m
│ │ │ │ ├── mfa_cl.m
│ │ │ │ ├── mfademo.m
│ │ │ │ ├── rdiv.m
│ │ │ │ ├── rprod.m
│ │ │ │ └── rsum.m
│ │ │ ├── brainy.m
│ │ │ ├── burglar-alarm-net.lisp.txt
│ │ │ ├── burglary.m
│ │ │ ├── cg1.asv
│ │ │ ├── cg1.m
│ │ │ ├── cg2.m
│ │ │ ├── cmp_inference_static.m
│ │ │ ├── discrete1.m
│ │ │ ├── discrete2.m
│ │ │ ├── discrete3.m
│ │ │ ├── dtree
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── test_housing.m
│ │ │ │ ├── test_restaurants.m
│ │ │ │ ├── test_zoo1.m
│ │ │ │ ├── tmp.dot
│ │ │ │ └── transform_data_into_bnt_format.m
│ │ │ ├── fa1.m
│ │ │ ├── fgraph
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── fg1.m
│ │ │ │ ├── fg2.m
│ │ │ │ ├── fg3.m
│ │ │ │ ├── fg_mrf1.m
│ │ │ │ └── fg_mrf2.m
│ │ │ ├── gaussian1.m
│ │ │ ├── gaussian2.m
│ │ │ ├── gibbs_test1.m
│ │ │ ├── learn1.asv
│ │ │ ├── learn1.m
│ │ │ ├── lw1.m
│ │ │ ├── mfa1.asv
│ │ │ ├── mfa1.m
│ │ │ ├── mixexp1.m
│ │ │ ├── mixexp2.asv
│ │ │ ├── mixexp2.m
│ │ │ ├── mixexp3.m
│ │ │ ├── mog1.m
│ │ │ ├── mpe1.m
│ │ │ ├── mpe2.m
│ │ │ ├── nodeorderExample.m
│ │ │ ├── qmr1.asv
│ │ │ ├── qmr1.m
│ │ │ ├── qmr2.m
│ │ │ ├── sample1.m
│ │ │ ├── softev1.m
│ │ │ ├── softmax1.m
│ │ │ └── sprinkler1.m
│ │ ├── general
│ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ └── Root
│ │ │ ├── Old
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── bnet_to_gdl_graph.m
│ │ │ │ ├── calc_mpe.m
│ │ │ │ ├── calc_mpe_bucket.m
│ │ │ │ ├── calc_mpe_dbn.m
│ │ │ │ ├── calc_mpe_given_inf_engine.m
│ │ │ │ ├── calc_mpe_global.m
│ │ │ │ ├── compute_interface_nodes.m
│ │ │ │ └── mk_gdl_graph.m
│ │ │ ├── add_ev_to_dmarginal.m
│ │ │ ├── add_evidence_to_gmarginal.m
│ │ │ ├── bnet_to_fgraph.m
│ │ │ ├── compute_fwd_interface.m
│ │ │ ├── compute_interface_nodes.m
│ │ │ ├── compute_joint_pot.m
│ │ │ ├── compute_minimal_interface.m
│ │ │ ├── convert_dbn_CPDs_to_pots.m
│ │ │ ├── convert_dbn_CPDs_to_tables.m
│ │ │ ├── convert_dbn_CPDs_to_tables1.m
│ │ │ ├── convert_dbn_CPDs_to_tables_slow.m
│ │ │ ├── dbn_to_bnet.m
│ │ │ ├── dbn_to_hmm.m
│ │ │ ├── determine_elim_constraints.m
│ │ │ ├── dispcpt.m
│ │ │ ├── do_intervention.m
│ │ │ ├── dsep.m
│ │ │ ├── dsep_test.m
│ │ │ ├── enumerate_scenarios.m
│ │ │ ├── fgraph_to_bnet.m
│ │ │ ├── hodbn_to_bnet.m
│ │ │ ├── is_mnet.m
│ │ │ ├── linear_gaussian_to_cpot.m
│ │ │ ├── log_lik_complete.m
│ │ │ ├── log_marg_lik_complete.m
│ │ │ ├── mk_bnet.m
│ │ │ ├── mk_dbn.m
│ │ │ ├── mk_fgraph.m
│ │ │ ├── mk_fgraph_given_ev.m
│ │ │ ├── mk_higher_order_dbn.m
│ │ │ ├── mk_limid.m
│ │ │ ├── mk_mnet.m
│ │ │ ├── mk_mrf2.m
│ │ │ ├── mk_mutilated_samples.m
│ │ │ ├── mk_named_CPT.m
│ │ │ ├── mk_slice_and_half_dbn.m
│ │ │ ├── noisyORtoTable.m
│ │ │ ├── partition_dbn_nodes.m
│ │ │ ├── partition_matrix_vec_3.m
│ │ │ ├── sample_bnet.m
│ │ │ ├── sample_bnet_nocell.m
│ │ │ ├── sample_dbn.m
│ │ │ ├── score_bnet_complete.m
│ │ │ ├── shrink_obs_dims_in_gaussian.m
│ │ │ ├── shrink_obs_dims_in_table.m
│ │ │ ├── solve_limid.m
│ │ │ ├── unroll_dbn_topology.m
│ │ │ ├── unroll_higher_order_topology.m
│ │ │ └── unroll_set.m
│ │ ├── inference
│ │ │ ├── @inf_engine
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── marginal_family_pot.m
│ │ │ │ │ └── observed_nodes.m
│ │ │ │ ├── bnet_from_engine.m
│ │ │ │ ├── get_field.m
│ │ │ │ ├── inf_engine.m
│ │ │ │ ├── marginal_family.m
│ │ │ │ ├── set_fields.m
│ │ │ │ └── update_engine.m
│ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ └── Root
│ │ │ ├── dummy
│ │ │ ├── dynamic
│ │ │ │ ├── @bk_ff_hmm_inf_engine
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── bk_ff_hmm_inf_engine.m
│ │ │ │ │ ├── dbn_init_bel.m
│ │ │ │ │ ├── dbn_marginal_from_bel.m
│ │ │ │ │ ├── dbn_predict_bel.m
│ │ │ │ │ ├── dbn_update_bel.m
│ │ │ │ │ ├── dbn_update_bel1.m
│ │ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_family.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_nodes.m
│ │ │ │ │ └── private
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── bk_ff_fb.m
│ │ │ │ │ ├── combine_marginals_into_joint.m
│ │ │ │ │ ├── dbn_to_hmm.m
│ │ │ │ │ ├── mk_hmm_obs_lik_mat.m
│ │ │ │ │ ├── mk_hmm_obs_lik_vec.m
│ │ │ │ │ ├── mk_hmm_obs_lik_vec1.m
│ │ │ │ │ └── project_joint_onto_marginals.m
│ │ │ │ ├── @bk_inf_engine
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── bk_inf_engine.m
│ │ │ │ │ ├── dbn_init_bel.m
│ │ │ │ │ ├── dbn_marginal_from_bel.m
│ │ │ │ │ ├── dbn_update_bel.m
│ │ │ │ │ ├── dbn_update_bel1.m
│ │ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ │ ├── enter_soft_evidence.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_family.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_nodes.m
│ │ │ │ │ └── update_engine.m
│ │ │ │ ├── @cbk_inf_engine
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── cbk_inf_engine.m
│ │ │ │ │ ├── dbn_init_bel.m
│ │ │ │ │ ├── dbn_marginal_from_bel.m
│ │ │ │ │ ├── dbn_update_bel.m
│ │ │ │ │ ├── dbn_update_bel1.m
│ │ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ │ ├── enter_soft_evidence.m
│ │ │ │ │ ├── junk
│ │ │ │ │ ├── marginal_family.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_nodes.m
│ │ │ │ │ └── update_engine.m
│ │ │ │ ├── @ff_inf_engine
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ │ ├── enter_soft_evidence.m
│ │ │ │ │ │ ├── enter_soft_evidence1.m
│ │ │ │ │ │ └── marginal_family.m
│ │ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ │ ├── enter_soft_evidence.m
│ │ │ │ │ ├── ff_inf_engine.m
│ │ │ │ │ ├── filter_evidence.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_family.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_nodes.m
│ │ │ │ │ └── smooth_evidence.m
│ │ │ │ ├── @frontier_inf_engine
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ │ ├── enter_soft_evidence.m
│ │ │ │ │ ├── frontier_inf_engine.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_family.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_nodes.m
│ │ │ │ │ └── set_fwdback.m
│ │ │ │ ├── @hmm_inf_engine
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ │ ├── dhmm_inf_engine.m
│ │ │ │ │ │ ├── marginal_family.m
│ │ │ │ │ │ └── marginal_nodes.m
│ │ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ │ ├── find_mpe.m
│ │ │ │ │ ├── fwdback_twoslice.m
│ │ │ │ │ ├── hmm_inf_engine.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_family.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_nodes.m
│ │ │ │ │ ├── private
│ │ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ │ ├── mk_hmm_obs_lik_matrix.m
│ │ │ │ │ │ └── mk_hmm_obs_lik_vec.m
│ │ │ │ │ └── update_engine.m
│ │ │ │ ├── @jtree_dbn_inf_engine
│ │ │ │ │ ├── Broken
│ │ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ │ ├── enter_soft_evidence1.m
│ │ │ │ │ │ ├── enter_soft_evidence2.m
│ │ │ │ │ │ ├── enter_soft_evidence3.m
│ │ │ │ │ │ ├── enter_soft_evidence4.m
│ │ │ │ │ │ └── marginal_nodes.m
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ │ ├── enter_soft_evidence_nonint.m
│ │ │ │ │ │ ├── enter_soft_evidence_trans.m
│ │ │ │ │ │ ├── jtree_dbn_inf_engine.m
│ │ │ │ │ │ ├── jtree_dbn_inf_engine1.m
│ │ │ │ │ │ └── jtree_dbn_inf_engine2.m
│ │ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ │ ├── enter_soft_evidence.m
│ │ │ │ │ ├── jtree_dbn_inf_engine.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_family.m
│ │ │ │ │ └── marginal_nodes.m
│ │ │ │ ├── @jtree_unrolled_dbn_inf_engine
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ │ ├── marginal_family.m
│ │ │ │ │ │ └── marginal_nodes.m
│ │ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ │ ├── jtree_unrolled_dbn_inf_engine.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_family.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_nodes.m
│ │ │ │ │ └── update_engine.m
│ │ │ │ ├── @kalman_inf_engine
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ │ ├── kalman_inf_engine.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_nodes.m
│ │ │ │ │ ├── private
│ │ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ │ ├── dbn_to_lds.m
│ │ │ │ │ │ └── extract_params_from_gbn.m
│ │ │ │ │ └── update_engine.m
│ │ │ │ ├── @pearl_dbn_inf_engine
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ │ ├── correct_smooth.m
│ │ │ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ │ │ ├── filter_evidence.m
│ │ │ │ │ │ ├── filter_evidence_obj_oriented.m
│ │ │ │ │ │ ├── smooth_evidence.m
│ │ │ │ │ │ ├── smooth_evidence_fast.m
│ │ │ │ │ │ └── wrong_smooth.m
│ │ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ │ ├── enter_soft_ev.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_nodes.m
│ │ │ │ │ ├── pearl_dbn_inf_engine.m
│ │ │ │ │ └── private
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ └── init_pearl_dbn_ev_msgs.m
│ │ │ │ ├── @pearl_unrolled_dbn_inf_engine
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_family.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_nodes.m
│ │ │ │ │ ├── pearl_unrolled_dbn_inf_engine.m
│ │ │ │ │ └── update_engine.m
│ │ │ │ ├── @stable_ho_inf_engine
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_family.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_nodes.m
│ │ │ │ │ ├── stable_ho_inf_engine.m
│ │ │ │ │ ├── test_ho_inf_enginge.m
│ │ │ │ │ └── update_engine.m
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ └── dummy
│ │ │ ├── online
│ │ │ │ ├── @filter_engine
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── bnet_from_engine.m
│ │ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ │ ├── filter_engine.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_family.m
│ │ │ │ │ └── marginal_nodes.m
│ │ │ │ ├── @hmm_2TBN_inf_engine
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── back.m
│ │ │ │ │ ├── backT.m
│ │ │ │ │ ├── fwd.m
│ │ │ │ │ ├── fwd1.m
│ │ │ │ │ ├── hmm_2TBN_inf_engine.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_family.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_nodes.m
│ │ │ │ │ ├── private
│ │ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ │ └── mk_hmm_obs_lik_vec.m
│ │ │ │ │ └── update_engine.m
│ │ │ │ ├── @jtree_2TBN_inf_engine
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ │ └── jtree_2TBN_inf_engine.m
│ │ │ │ │ ├── back.m
│ │ │ │ │ ├── back1.m
│ │ │ │ │ ├── back1_mpe.m
│ │ │ │ │ ├── backT.m
│ │ │ │ │ ├── backT_mpe.m
│ │ │ │ │ ├── back_mpe.m
│ │ │ │ │ ├── fwd.m
│ │ │ │ │ ├── fwd1.m
│ │ │ │ │ ├── jtree_2TBN_inf_engine.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_family.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_nodes.m
│ │ │ │ │ └── set_fields.m
│ │ │ │ ├── @jtree_sparse_2TBN_inf_engine
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── back.m
│ │ │ │ │ ├── back1.m
│ │ │ │ │ ├── backT.m
│ │ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ │ ├── fwd.m
│ │ │ │ │ ├── fwd1.m
│ │ │ │ │ ├── jtree_sparse_2TBN_inf_engine.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_family.m
│ │ │ │ │ └── marginal_nodes.m
│ │ │ │ ├── @smoother_engine
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── bnet_from_engine.m
│ │ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ │ ├── find_mpe.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_family.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_nodes.m
│ │ │ │ │ ├── smoother_engine.m
│ │ │ │ │ └── update_engine.m
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ └── dummy
│ │ │ └── static
│ │ │ ├── @belprop_fg_inf_engine
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── belprop_fg_inf_engine.m
│ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ ├── find_mpe.m
│ │ │ │ ├── loopy_converged.m
│ │ │ │ ├── marginal_nodes.m
│ │ │ │ └── set_params.m
│ │ │ ├── @belprop_inf_engine
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── belprop_gdl_inf_engine.m
│ │ │ │ │ ├── belprop_inf_engine_nostr.m
│ │ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ │ ├── enter_evidence1.m
│ │ │ │ │ └── marginal_domain.m
│ │ │ │ ├── belprop_inf_engine.m
│ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ ├── find_mpe.m
│ │ │ │ ├── loopy_converged.m
│ │ │ │ ├── marginal_family.m
│ │ │ │ ├── marginal_nodes.m
│ │ │ │ └── private
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── junk
│ │ │ │ ├── parallel_protocol.m
│ │ │ │ └── tree_protocol.m
│ │ │ ├── @belprop_mrf2_inf_engine
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── belprop_mrf2_inf_engine.m
│ │ │ │ ├── bp_mrf2.m
│ │ │ │ ├── enter_soft_evidence.m
│ │ │ │ ├── find_mpe.m
│ │ │ │ ├── marginal_nodes.m
│ │ │ │ └── set_params.m
│ │ │ ├── @cond_gauss_inf_engine
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── cond_gauss_inf_engine.m
│ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ └── marginal_nodes.m
│ │ │ ├── @enumerative_inf_engine
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ ├── enumerative_inf_engine.m
│ │ │ │ └── marginal_nodes.m
│ │ │ ├── @gaussian_inf_engine
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ ├── gaussian_inf_engine.m
│ │ │ │ ├── marginal_nodes.m
│ │ │ │ └── private
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ └── extract_params_from_gbn.m
│ │ │ ├── @gibbs_sampling_inf_engine
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ ├── gibbs_sampling_inf_engine.m
│ │ │ │ ├── marginal_nodes.m
│ │ │ │ └── private
│ │ │ │ ├── CPT.m
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── compute_children.m
│ │ │ │ ├── compute_families.m
│ │ │ │ ├── compute_families_dbn.m
│ │ │ │ ├── compute_posterior.c
│ │ │ │ ├── compute_posterior_dbn.m
│ │ │ │ ├── compute_strides.m
│ │ │ │ ├── get_cpts.m
│ │ │ │ ├── get_slice_dbn.c
│ │ │ │ ├── get_slice_dbn.m
│ │ │ │ ├── my_sample_discrete.m
│ │ │ │ └── sample_single_discrete.c
│ │ │ ├── @global_joint_inf_engine
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ ├── find_mpe.m
│ │ │ │ ├── global_joint_inf_engine.m
│ │ │ │ ├── marginal_family.m
│ │ │ │ └── marginal_nodes.m
│ │ │ ├── @jtree_inf_engine
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── collect_evidence.m
│ │ │ │ │ ├── distribute_evidence.m
│ │ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ │ └── enter_soft_evidence.m
│ │ │ │ ├── cliques_from_engine.m
│ │ │ │ ├── clq_containing_nodes.m
│ │ │ │ ├── collect_evidence.m
│ │ │ │ ├── distribute_evidence.m
│ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ ├── enter_soft_evidence.m
│ │ │ │ ├── find_max_config.m
│ │ │ │ ├── find_mpe.m
│ │ │ │ ├── init_pot.m
│ │ │ │ ├── jtree_inf_engine.m
│ │ │ │ ├── marginal_family.m
│ │ │ │ ├── marginal_nodes.m
│ │ │ │ └── set_fields.m
│ │ │ ├── @jtree_limid_inf_engine
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── marginal_family.m
│ │ │ │ │ └── marginal_nodes_SS.m
│ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ ├── jtree_limid_inf_engine.m
│ │ │ │ ├── marginal_family.m
│ │ │ │ └── marginal_nodes.m
│ │ │ ├── @jtree_mnet_inf_engine
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ ├── find_mpe.m
│ │ │ │ └── jtree_mnet_inf_engine.m
│ │ │ ├── @jtree_sparse_inf_engine
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── cliques_from_engine.m
│ │ │ │ ├── clq_containing_nodes.m
│ │ │ │ ├── collect_evidence.c
│ │ │ │ ├── distribute_evidence.c
│ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ ├── enter_soft_evidence.m
│ │ │ │ ├── init_pot.c
│ │ │ │ ├── jtree_sparse_inf_engine.m
│ │ │ │ ├── marginal_family.m
│ │ │ │ ├── marginal_nodes.m
│ │ │ │ ├── old
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── collect_evidence.c
│ │ │ │ │ ├── distribute_evidence.c
│ │ │ │ │ ├── init_pot.c
│ │ │ │ │ ├── init_pot1.c
│ │ │ │ │ └── init_pot1.m
│ │ │ │ └── set_fields.m
│ │ │ ├── @likelihood_weighting_inf_engine
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ ├── likelihood_weighting_inf_engine.m
│ │ │ │ └── marginal_nodes.m
│ │ │ ├── @pearl_inf_engine
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── bethe_free_energy.m
│ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ ├── loopy_converged.m
│ │ │ │ ├── marginal_family.m
│ │ │ │ ├── marginal_nodes.m
│ │ │ │ ├── pearl_inf_engine.m
│ │ │ │ ├── pearl_inf_engine.m~
│ │ │ │ └── private
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── compute_bel.m
│ │ │ │ ├── parallel_protocol.m
│ │ │ │ ├── parallel_protocol.m~
│ │ │ │ ├── prod_lambda_msgs.m
│ │ │ │ └── tree_protocol.m
│ │ │ ├── @quickscore_inf_engine
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ ├── marginal_nodes.m
│ │ │ │ ├── private
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── C_quickscore.c
│ │ │ │ │ ├── nr.h
│ │ │ │ │ ├── nrutil.c
│ │ │ │ │ ├── nrutil.h
│ │ │ │ │ └── quickscore.m
│ │ │ │ └── quickscore_inf_engine.m
│ │ │ ├── @stab_cond_gauss_inf_engine
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ └── initialize_engine.m
│ │ │ │ ├── README
│ │ │ │ ├── clq_containing_nodes.m
│ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ ├── marginal_difclq_nodes.m
│ │ │ │ ├── marginal_nodes.m
│ │ │ │ ├── marginal_singleclq_nodes.m
│ │ │ │ ├── problems.txt
│ │ │ │ ├── push.m
│ │ │ │ ├── push_pot_toclique.m
│ │ │ │ └── stab_cond_gauss_inf_engine.m
│ │ │ ├── @var_elim_inf_engine
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ ├── find_mpe.m
│ │ │ │ ├── marginal_nodes.m
│ │ │ │ └── var_elim_inf_engine.m
│ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ └── Root
│ │ │ └── dummy
│ │ ├── installC_BNT.m
│ │ ├── installC_graph.m
│ │ ├── learning
│ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ └── Root
│ │ │ ├── CovMat.m
│ │ │ ├── bayes_update_params.m
│ │ │ ├── bic_score_family.m
│ │ │ ├── compute_cooling_schedule.m
│ │ │ ├── dirichlet_score_family.m
│ │ │ ├── kpm_learn_struct_mcmc.m
│ │ │ ├── learn_params.m
│ │ │ ├── learn_params_dbn.m
│ │ │ ├── learn_params_dbn_em.m
│ │ │ ├── learn_params_em.m
│ │ │ ├── learn_struct_K2.m
│ │ │ ├── learn_struct_dbn_reveal.m
│ │ │ ├── learn_struct_mcmc.asv
│ │ │ ├── learn_struct_mcmc.m
│ │ │ ├── learn_struct_pdag_ic_star.m
│ │ │ ├── learn_struct_pdag_pc.m
│ │ │ ├── learn_struct_pdag_pc_constrain.m
│ │ │ ├── mcmc_sample_to_hist.asv
│ │ │ ├── mcmc_sample_to_hist.m
│ │ │ ├── mk_schedule.m
│ │ │ ├── mk_tetrad_data_file.m
│ │ │ ├── score_dags.m
│ │ │ ├── score_dags_old.m
│ │ │ └── score_family.m
│ │ ├── license.gpl.txt
│ │ ├── potentials
│ │ │ ├── @cgpot
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── normalize_pot.m
│ │ │ │ │ ├── set_domain_pot.m
│ │ │ │ │ └── simple_marginalize_pot.m
│ │ │ │ ├── cg_can_to_mom.m
│ │ │ │ ├── cg_mom_to_can.m
│ │ │ │ ├── cgpot.m
│ │ │ │ ├── display.m
│ │ │ │ ├── divide_by_pot.m
│ │ │ │ ├── domain_pot.m
│ │ │ │ ├── enter_cts_evidence_pot.m
│ │ │ │ ├── enter_discrete_evidence_pot.m
│ │ │ │ ├── marginalize_pot.m
│ │ │ │ ├── multiply_by_pot.m
│ │ │ │ ├── multiply_pots.m
│ │ │ │ ├── normalize_pot.m
│ │ │ │ ├── pot_to_marginal.m
│ │ │ │ └── set_domain_pot.m
│ │ │ ├── @cpot
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── cpot_to_mpot.m
│ │ │ │ │ └── normalize_pot.convert.m
│ │ │ │ ├── cpot.m
│ │ │ │ ├── cpot_to_mpot.m
│ │ │ │ ├── display.m
│ │ │ │ ├── divide_by_pot.m
│ │ │ │ ├── domain_pot.m
│ │ │ │ ├── enter_cts_evidence_pot.m
│ │ │ │ ├── marginalize_pot.m
│ │ │ │ ├── multiply_by_pot.m
│ │ │ │ ├── multiply_pots.m
│ │ │ │ ├── normalize_pot.m
│ │ │ │ ├── pot_to_marginal.m
│ │ │ │ ├── rescale_pot.m
│ │ │ │ └── set_domain_pot.m
│ │ │ ├── @dpot
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── approxeq_pot.m
│ │ │ │ ├── display.m
│ │ │ │ ├── divide_by_pot.m
│ │ │ │ ├── domain_pot.m
│ │ │ │ ├── dpot.m
│ │ │ │ ├── dpot_to_table.m
│ │ │ │ ├── find_most_prob_entry.m
│ │ │ │ ├── get_fields.m
│ │ │ │ ├── marginalize_pot.m
│ │ │ │ ├── multiply_by_pot.m
│ │ │ │ ├── multiply_pots.m
│ │ │ │ ├── normalize_pot.m
│ │ │ │ ├── pot_to_marginal.m
│ │ │ │ ├── set_domain_pot.m
│ │ │ │ ├── subsasgn.m
│ │ │ │ └── subsref.m
│ │ │ ├── @mpot
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── display.m
│ │ │ │ ├── marginalize_pot.m
│ │ │ │ ├── mpot.m
│ │ │ │ ├── mpot_to_cpot.m
│ │ │ │ ├── normalize_pot.m
│ │ │ │ ├── pot_to_marginal.m
│ │ │ │ ├── rescale_pot.m
│ │ │ │ └── set_domain_pot.m
│ │ │ ├── @scgcpot
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── marginalize_pot.m
│ │ │ │ ├── normalize_pot.m
│ │ │ │ ├── reduce_pot.m
│ │ │ │ ├── rescale_pot.m
│ │ │ │ └── scgcpot.m
│ │ │ ├── @scgpot
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── README
│ │ │ │ ├── combine_pots.m
│ │ │ │ ├── complement_pot.m
│ │ │ │ ├── direct_combine_pots.m
│ │ │ │ ├── extension_pot.m
│ │ │ │ ├── marginalize_pot.m
│ │ │ │ ├── normalize_pot.m
│ │ │ │ ├── pot_to_marginal.m
│ │ │ │ ├── recursive_combine_pots.m
│ │ │ │ ├── reduce_pot.m
│ │ │ │ └── scgpot.m
│ │ │ ├── @upot
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── approxeq_pot.m
│ │ │ │ ├── display.m
│ │ │ │ ├── divide_by_pot.m
│ │ │ │ ├── marginalize_pot.m
│ │ │ │ ├── multiply_by_pot.m
│ │ │ │ ├── normalize_pot.m
│ │ │ │ ├── pot_to_marginal.m
│ │ │ │ ├── upot.m
│ │ │ │ └── upot_to_opt_policy.m
│ │ │ ├── CPD_to_pot.m
│ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ └── Root
│ │ │ ├── Old
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ └── comp_eff_node_sizes.m
│ │ │ ├── README
│ │ │ ├── Tables
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── divide_by_sparse_table.c
│ │ │ │ ├── divide_by_table.c
│ │ │ │ ├── divide_by_table.m
│ │ │ │ ├── extend_domain_table.m
│ │ │ │ ├── marg_sparse_table.c
│ │ │ │ ├── marg_table.c
│ │ │ │ ├── marg_table.m
│ │ │ │ ├── marg_tableC.c
│ │ │ │ ├── marg_tableM.m
│ │ │ │ ├── mult_by_sparse_table.c
│ │ │ │ ├── mult_by_table.c
│ │ │ │ ├── mult_by_table.m
│ │ │ │ ├── mult_by_table2.m
│ │ │ │ ├── mult_by_tableC.c
│ │ │ │ ├── mult_by_tableM.m
│ │ │ │ ├── mult_by_table_global.m
│ │ │ │ ├── rep_mult.c
│ │ │ │ └── repmat_and_mult.c
│ │ │ ├── check_for_cd_arcs.m
│ │ │ ├── determine_pot_type.m
│ │ │ ├── genops.c
│ │ │ └── mk_initial_pot.m
│ │ ├── test_BNT.m
│ │ ├── test_BNT.m~
│ │ └── uninstallC_BNT.m
│ ├── CVS
│ │ ├── Entries
│ │ ├── Entries.Log
│ │ ├── Repository
│ │ └── Root
│ ├── ChangeLog.Sourceforge.txt
│ ├── ChangeLog.txt
│ ├── GraphViz
│ │ ├── CVS
│ │ │ ├── Entries
│ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ ├── Repository
│ │ │ └── Root
│ │ ├── Old
│ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ └── Root
│ │ │ ├── dot_to_graph.m
│ │ │ ├── draw_dot.m
│ │ │ ├── draw_graph.m
│ │ │ ├── graphToDot.m
│ │ │ └── pre_pesha_graph_to_dot.m
│ │ ├── README.txt
│ │ ├── approxeq.m
│ │ ├── arrow.m
│ │ ├── dot_to_graph.m
│ │ ├── draw_dbn.m
│ │ ├── draw_dbn_test.m
│ │ ├── draw_dot.m
│ │ ├── draw_graph.m
│ │ ├── draw_graph_test.m
│ │ ├── draw_hmm.m
│ │ ├── editGraphGUI.m
│ │ ├── graph_to_dot.m
│ │ ├── make_layout.m
│ │ ├── my_call.m
│ │ └── process_options.m
│ ├── HMM
│ │ ├── CVS
│ │ │ ├── Entries
│ │ │ ├── Repository
│ │ │ └── Root
│ │ ├── README.txt
│ │ ├── dhmm_em.m
│ │ ├── dhmm_em_demo.m
│ │ ├── dhmm_em_online.m
│ │ ├── dhmm_em_online_demo.m
│ │ ├── dhmm_logprob.m
│ │ ├── dhmm_logprob_brute_force.m
│ │ ├── dhmm_logprob_path.m
│ │ ├── dhmm_sample.m
│ │ ├── dhmm_sample_endstate.m
│ │ ├── fixed_lag_smoother.m
│ │ ├── fixed_lag_smoother_demo.m
│ │ ├── fwdback.m
│ │ ├── gausshmm_train_observed.m
│ │ ├── mc_sample.m
│ │ ├── mc_sample_endstate.m
│ │ ├── mdp_sample.m
│ │ ├── mhmmParzen_train_observed.m
│ │ ├── mhmm_em.m
│ │ ├── mhmm_em_demo.m
│ │ ├── mhmm_logprob.m
│ │ ├── mhmm_sample.m
│ │ ├── mk_leftright_transmat.m
│ │ ├── mk_rightleft_transmat.m
│ │ ├── pomdp_sample.m
│ │ ├── testHMM.m
│ │ ├── transmat_train_observed.m
│ │ └── viterbi_path.m
│ ├── KPMstats
│ │ ├── CVS
│ │ │ ├── Entries
│ │ │ ├── Repository
│ │ │ └── Root
│ │ ├── KLgauss.m
│ │ ├── README.txt
│ │ ├── beta_sample.m
│ │ ├── chisquared_histo.m
│ │ ├── chisquared_prob.m
│ │ ├── chisquared_readme.txt
│ │ ├── chisquared_table.m
│ │ ├── clg_Mstep.m
│ │ ├── clg_Mstep_simple.m
│ │ ├── clg_prob.m
│ │ ├── condGaussToJoint.m
│ │ ├── cond_indep_fisher_z.m
│ │ ├── condgaussTrainObserved.m
│ │ ├── condgauss_sample.m
│ │ ├── convertBinaryLabels.m
│ │ ├── cwr_demo.m
│ │ ├── cwr_em.m
│ │ ├── cwr_predict.m
│ │ ├── cwr_prob.m
│ │ ├── cwr_readme.txt
│ │ ├── cwr_test.m
│ │ ├── dirichlet_sample.m
│ │ ├── dirichletpdf.m
│ │ ├── dirichletrnd.m
│ │ ├── distchck.m
│ │ ├── eigdec.m
│ │ ├── est_transmat.m
│ │ ├── fit_paritioned_model_testfn.m
│ │ ├── fit_partitioned_model.m
│ │ ├── gamma_sample.m
│ │ ├── gaussian_prob.m
│ │ ├── gaussian_sample.m
│ │ ├── histCmpChi2.m
│ │ ├── linear_regression.m
│ │ ├── logist2.m
│ │ ├── logist2Apply.m
│ │ ├── logist2ApplyRegularized.m
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│ │ ├── logist2FitRegularized.m
│ │ ├── logistK.m
│ │ ├── logistK_eval.m
│ │ ├── marginalize_gaussian.m
│ │ ├── matrix_T_pdf.m
│ │ ├── matrix_normal_pdf.m
│ │ ├── mc_stat_distrib.m
│ │ ├── mixgauss_Mstep.m
│ │ ├── mixgauss_classifier_apply.m
│ │ ├── mixgauss_classifier_train.m
│ │ ├── mixgauss_em.m
│ │ ├── mixgauss_init.m
│ │ ├── mixgauss_prob.m
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│ │ ├── mixgauss_sample.m
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│ │ ├── multinomial_sample.m
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│ │ ├── multirnd.m
│ │ ├── normal_coef.m
│ │ ├── partial_corr_coef.m
│ │ ├── parzen.m
│ │ ├── parzenC.c
│ │ ├── parzenC.dll
│ │ ├── parzenC.mexglx
│ │ ├── parzenC_test.m
│ │ ├── parzen_fit_select_unif.m
│ │ ├── pca.m
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│ │ ├── sample_discrete.m
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│ │ ├── student_t_logprob.m
│ │ ├── student_t_prob.m
│ │ ├── test_dir.m
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│ │ └── weightedRegression.m
│ ├── KPMtools
│ │ ├── CVS
│ │ │ ├── Entries
│ │ │ ├── Repository
│ │ │ └── Root
│ │ ├── README.txt
│ │ ├── approx_unique.m
│ │ ├── approxeq.m
│ │ ├── argmax.m
│ │ ├── argmin.m
│ │ ├── asdemo.html
│ │ ├── asdemo.m
│ │ ├── asort.m
│ │ ├── assert.m
│ │ ├── assignEdgeNums.m
│ │ ├── assign_cols.m
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│ │ ├── bipartiteMatchingDemo.m
│ │ ├── bipartiteMatchingDemoPlot.m
│ │ ├── bipartiteMatchingHungarian.m
│ │ ├── bipartiteMatchingIntProg.m
│ │ ├── block.m
│ │ ├── cell2matPad.m
│ │ ├── cell2num.m
│ │ ├── centeringMatrix.m
│ │ ├── checkpsd.m
│ │ ├── chi2inv.m
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│ │ ├── collapse_mog.m
│ │ ├── colmult.c
│ │ ├── colmult.mexglx
│ │ ├── computeROC.m
│ │ ├── compute_counts.m
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│ │ ├── draw_ellipse_axes.m
│ │ ├── em_converged.m
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│ │ ├── exportfig.m
│ │ ├── extend_domain_table.m
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│ │ ├── fullfileKPM.m
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│ │ ├── image_rgb.m
│ │ ├── imresizeAspect.m
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│ │ ├── ind2subvKPM.c
│ │ ├── ind2subvKPM.m
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│ │ ├── installC_KPMtools.m
│ │ ├── is_psd.m
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│ │ ├── logdet.m
│ │ ├── logsum.m
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│ │ ├── logsumexp.m
│ │ ├── logsumexpv.m
│ │ ├── mahal2conf.m
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│ │ ├── max_mult.c
│ │ ├── max_mult.m
│ │ ├── mexutil.c
│ │ ├── mexutil.h
│ │ ├── mk_multi_index.m
│ │ ├── mk_stochastic.m
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│ │ ├── montageKPM2.m
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│ │ ├── mult_by_table.m
│ │ ├── myintersect.m
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│ │ ├── myismember.m~
│ │ ├── myones.m
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│ │ ├── myrand.m
│ │ ├── myrepmat.m
│ │ ├── myreshape.m
│ │ ├── mysetdiff.m
│ │ ├── mysize.m
│ │ ├── mysubset.m
│ │ ├── mysymsetdiff.m
│ │ ├── myunion.m
│ │ ├── nchoose2.m
│ │ ├── ncols.m
│ │ ├── nonmaxsup.m
│ │ ├── normalise.m
│ │ ├── normaliseC.c
│ │ ├── normaliseC.dll
│ │ ├── normalize.m
│ │ ├── nrows.m
│ │ ├── num2strcell.m
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│ │ ├── optimalMatchingTest.m
│ │ ├── partitionData.m
│ │ ├── partition_matrix_vec.m
│ │ ├── pca_kpm.m
│ │ ├── pca_netlab.m
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│ │ ├── plotROCkpm.m
│ │ ├── plot_axis_thru_origin.m
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│ │ ├── plot_matrix.m
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│ │ ├── polygon_intersect.m
│ │ ├── previewfig.m
│ │ ├── process_options.m
│ │ ├── rand_psd.m
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│ │ ├── rectintLoopC.c
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│ │ ├── rectintSparse.m
│ │ ├── rectintSparseC.m
│ │ ├── rectintSparseLoopC.c
│ │ ├── rectintSparseLoopC.dll
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│ │ ├── repmatC.dll
│ │ ├── repmatC.mexglx
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│ │ ├── rnd_partition.m
│ │ ├── rotate_xlabel.m
│ │ ├── safeStr.m
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│ │ ├── set_xtick_label_demo.m
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│ │ ├── sqdist.m
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│ │ ├── strsplit.m
│ │ ├── subplot2.m
│ │ ├── subplot3.m
│ │ ├── subsets.m
│ │ ├── subsets1.m
│ │ ├── subsetsFixedSize.m
│ │ ├── subv2ind.m
│ │ ├── subv2indKPM.c
│ │ ├── subv2indKPM.m
│ │ ├── subv2indMinka.m
│ │ ├── subv2indTest.m
│ │ ├── sumv.m
│ │ ├── suptitle.m
│ │ ├── unaryEncoding.m
│ │ ├── wrap.m
│ │ ├── xticklabel_rotate90.m
│ │ ├── zipload.m
│ │ └── zipsave.m
│ ├── Kalman
│ │ ├── AR_to_SS.m
│ │ ├── CVS
│ │ │ ├── Entries
│ │ │ ├── Repository
│ │ │ └── Root
│ │ ├── README.txt
│ │ ├── SS_to_AR.m
│ │ ├── convert_to_lagged_form.m
│ │ ├── ensure_AR.m
│ │ ├── eval_AR_perf.m
│ │ ├── kalman_filter.m
│ │ ├── kalman_forward_backward.m
│ │ ├── kalman_smoother.m
│ │ ├── kalman_update.m
│ │ ├── learn_AR.m
│ │ ├── learn_AR_diagonal.m
│ │ ├── learn_kalman.m
│ │ ├── learning_demo.m
│ │ ├── sample_lds.m
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│ │ └── tracking_demo.m
│ ├── foptions.m
│ ├── genpathKPM.m
│ ├── graph
│ │ ├── CVS
│ │ │ ├── Entries
│ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ ├── Repository
│ │ │ └── Root
│ │ ├── Old
│ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ └── Root
│ │ │ ├── best_first_elim_order.m
│ │ │ ├── dag_to_jtree.m
│ │ │ ├── dfs.m
│ │ │ ├── dsep_test.m
│ │ │ └── mk_2D_lattice_slow.m
│ │ ├── README.txt
│ │ ├── acyclic.m
│ │ ├── assignEdgeNums.m
│ │ ├── best_first_elim_order.m
│ │ ├── check_jtree_property.m
│ │ ├── check_triangulated.m
│ │ ├── children.m
│ │ ├── cliques_to_jtree.m
│ │ ├── cliques_to_strong_jtree.m
│ │ ├── connected_graph.m
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│ │ ├── dfs.m
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│ │ ├── minspan.m
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│ │ ├── mk_2D_lattice_slow.m
│ │ ├── mk_adj_mat.m
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│ │ ├── mk_nbrs_of_digraph_broken.m
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│ │ ├── mk_undirected.m
│ │ ├── moralize.m
│ │ ├── neighbors.m
│ │ ├── parents.m
│ │ ├── pred2path.m
│ │ ├── reachability_graph.m
│ │ ├── scc.m
│ │ ├── strong_elim_order.m
│ │ ├── test.m
│ │ ├── test_strong_root.m
│ │ ├── topological_sort.m
│ │ ├── trees.txt
│ │ ├── triangulate.c
│ │ ├── triangulate.m
│ │ ├── triangulate_2Dlattice_demo.m
│ │ └── triangulate_test.m
│ ├── nethelp3.3
│ │ ├── CVS
│ │ │ ├── Entries
│ │ │ ├── Repository
│ │ │ └── Root
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│ │ ├── gtmprob.htm
│ │ ├── hbayes.htm
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│ │ ├── hmc.htm
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│ │ ├── kmeans.htm
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│ │ ├── linemin.htm
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│ │ ├── mdndist2.htm
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│ │ ├── metrop.htm
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│ │ ├── mlp.htm
│ │ ├── mlpbkp.htm
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│ │ ├── mlperr.htm
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│ │ ├── mlphdotv.htm
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│ │ ├── mlpprior.htm
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│ │ ├── plotmat.htm
│ │ ├── ppca.htm
│ │ ├── quasinew.htm
│ │ ├── rbf.htm
│ │ ├── rbfbkp.htm
│ │ ├── rbfderiv.htm
│ │ ├── rbferr.htm
│ │ ├── rbfevfwd.htm
│ │ ├── rbffwd.htm
│ │ ├── rbfgrad.htm
│ │ ├── rbfhess.htm
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│ │ ├── rbfsetfw.htm
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│ │ ├── rosen.htm
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│ │ ├── somfwd.htm
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│ │ ├── somtrain.htm
│ │ └── somunpak.htm
│ ├── netlab3.3
│ │ ├── CVS
│ │ │ ├── Entries
│ │ │ ├── Repository
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│ │ ├── Contents.m
│ │ ├── LICENSE
│ │ ├── conffig.m
│ │ ├── confmat.m
│ │ ├── conjgrad.m
│ │ ├── consist.m
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│ │ ├── demglm1.m
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├── How_to_use_the_Bayes_Net_Toolbox.doc
├── 如何使用FULLBNT工具箱.pdf
└── 如何安装贝叶斯.txt
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创建你的第一个贝叶斯网络 手工创建一个模型 从一个文件加载一个模型 使用 GUI 创建一个模型 推断 处理边缘分布 处理联合分布 虚拟证据 最或然率解释 条件概率分布 列表（多项式）节点 Noisy-or 节点 其它（噪音）确定性节点 Softmax（多项式 分对数）节点 神经网络节点 根节点 高斯节点 广义线性模型节点 分类 / 回归树节点 其它连续分布 CPD 类型摘要 模型举例 高斯混合模型 PCA、ICA等 专家系统的混合 专家系统的分等级混合 QMR 条件高斯模型 其它混合模型 参数学习 从一个文件里加载数据 从完整的数据中进行最大似然参数估计 先验参数 从完整的数据中（连续）更新贝
【实例截图】
【核心代码】
贝叶斯网络工具包
└── 贝叶斯网络工具包
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│ └── FullBNT-1.0.4
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│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── hhmm2Q_CPD.m
│ │ │ │ ├── maximize_params.m
│ │ │ │ ├── reset_ess.m
│ │ │ │ └── update_ess.m
│ │ │ ├── @hhmmF_CPD
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── hhmmF_CPD.m
│ │ │ │ │ ├── log_prior.m
│ │ │ │ │ ├── maximize_params.m
│ │ │ │ │ ├── reset_ess.m
│ │ │ │ │ ├── update_CPT.m
│ │ │ │ │ └── update_ess.m
│ │ │ │ ├── hhmmF_CPD.m
│ │ │ │ ├── log_prior.m
│ │ │ │ ├── maximize_params.m
│ │ │ │ ├── reset_ess.m
│ │ │ │ ├── update_CPT.m
│ │ │ │ └── update_ess.m
│ │ │ ├── @hhmmQ_CPD
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── hhmmQ_CPD.m
│ │ │ │ │ ├── log_prior.m
│ │ │ │ │ ├── maximize_params.m
│ │ │ │ │ ├── reset_ess.m
│ │ │ │ │ ├── update_CPT.m
│ │ │ │ │ ├── update_ess.m
│ │ │ │ │ ├── update_ess2.m
│ │ │ │ │ ├── update_ess3.m
│ │ │ │ │ └── update_ess4.m
│ │ │ │ ├── hhmmQ_CPD.m
│ │ │ │ ├── log_prior.m
│ │ │ │ ├── maximize_params.m
│ │ │ │ ├── reset_ess.m
│ │ │ │ ├── update_CPT.m
│ │ │ │ └── update_ess.m
│ │ │ ├── @mlp_CPD
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── convert_to_table.m
│ │ │ │ ├── maximize_params.m
│ │ │ │ ├── mlp_CPD.m
│ │ │ │ ├── reset_ess.m
│ │ │ │ └── update_ess.m
│ │ │ ├── @noisyor_CPD
│ │ │ │ ├── CPD_to_CPT.m
│ │ │ │ ├── CPD_to_CPT.m~
│ │ │ │ ├── CPD_to_lambda_msg.m
│ │ │ │ ├── CPD_to_pi.m
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── noisyor_CPD.m
│ │ │ │ └── private
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ └── sum_prod_CPD_and_pi_msgs.m
│ │ │ ├── @root_CPD
│ │ │ │ ├── CPD_to_pi.m
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ ├── CPD_to_CPT.m
│ │ │ │ │ └── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── convert_to_pot.m
│ │ │ │ ├── log_marg_prob_node.m
│ │ │ │ ├── log_prob_node.m
│ │ │ │ ├── root_CPD.m
│ │ │ │ └── sample_node.m
│ │ │ ├── @softmax_CPD
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── convert_to_pot.m
│ │ │ │ ├── convert_to_table.m
│ │ │ │ ├── display.m
│ │ │ │ ├── get_field.m
│ │ │ │ ├── maximize_params.m
│ │ │ │ ├── private
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ └── extract_params.m
│ │ │ │ ├── reset_ess.m
│ │ │ │ ├── sample_node.m
│ │ │ │ ├── set_fields.m
│ │ │ │ ├── softmax_CPD.m
│ │ │ │ └── update_ess.m
│ │ │ ├── @tabular_CPD
│ │ │ │ ├── CPD_to_CPT.m
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ ├── BIC_score_CPD.m
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── bayesian_score_CPD.m
│ │ │ │ │ ├── log_marg_prob_node_case.m
│ │ │ │ │ ├── mult_CPD_and_pi_msgs.m
│ │ │ │ │ ├── prob_CPT.m
│ │ │ │ │ ├── prob_node.m
│ │ │ │ │ ├── sample_node.m
│ │ │ │ │ ├── sample_node_single_case.m
│ │ │ │ │ ├── tabular_CPD.m
│ │ │ │ │ └── update_params.m
│ │ │ │ ├── bayes_update_params.m
│ │ │ │ ├── display.m
│ │ │ │ ├── get_field.m
│ │ │ │ ├── learn_params.m
│ │ │ │ ├── log_marg_prob_node.m
│ │ │ │ ├── log_nextcase_prob_node.m
│ │ │ │ ├── log_prior.m
│ │ │ │ ├── maximize_params.m
│ │ │ │ ├── reset_ess.m
│ │ │ │ ├── set_fields.m
│ │ │ │ ├── tabular_CPD.m
│ │ │ │ ├── update_ess.m
│ │ │ │ └── update_ess_simple.m
│ │ │ ├── @tabular_decision_node
│ │ │ │ ├── CPD_to_CPT.m
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ └── tabular_decision_node.m
│ │ │ │ ├── display.m
│ │ │ │ ├── get_field.m
│ │ │ │ ├── set_fields.m
│ │ │ │ └── tabular_decision_node.m
│ │ │ ├── @tabular_kernel
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ └── tabular_kernel.m
│ │ │ │ ├── convert_to_pot.m
│ │ │ │ ├── convert_to_table.m
│ │ │ │ ├── get_field.m
│ │ │ │ ├── set_fields.m
│ │ │ │ └── tabular_kernel.m
│ │ │ ├── @tabular_utility_node
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── convert_to_pot.m
│ │ │ │ ├── display.m
│ │ │ │ └── tabular_utility_node.m
│ │ │ ├── @tree_CPD
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── display.m
│ │ │ │ ├── evaluate_tree_performance.m
│ │ │ │ ├── get_field.m
│ │ │ │ ├── learn_params.m
│ │ │ │ ├── readme.txt
│ │ │ │ ├── set_fields.m
│ │ │ │ └── tree_CPD.m
│ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ └── Root
│ │ │ ├── Old
│ │ │ │ ├── @linear_gaussian_CPD
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── linear_gaussian_CPD.m
│ │ │ │ │ ├── log_marg_prob_node.m
│ │ │ │ │ └── update_params_complete.m
│ │ │ │ ├── @root_gaussian_CPD
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── log_marg_prob_node.m
│ │ │ │ │ ├── root_gaussian_CPD.m
│ │ │ │ │ └── update_params_complete.m
│ │ │ │ ├── @tabular_chance_node
│ │ │ │ │ ├── CPD_to_upot.m
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ └── tabular_chance_node.m
│ │ │ │ └── CVS
│ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ └── Root
│ │ │ └── mk_isolated_tabular_CPD.m
│ │ ├── CVS
│ │ │ ├── Entries
│ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ ├── Repository
│ │ │ └── Root
│ │ ├── README.txt
│ │ ├── copyright.txt
│ │ ├── examples
│ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ └── Root
│ │ │ ├── dummy
│ │ │ ├── dynamic
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── HHMM
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── Map
│ │ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ │ │ └── mk_map_hhmm.m
│ │ │ │ │ │ ├── disp_map_hhmm.m
│ │ │ │ │ │ ├── learn_map.m
│ │ │ │ │ │ ├── mk_map_hhmm.m
│ │ │ │ │ │ ├── mk_rnd_map_hhmm.m
│ │ │ │ │ │ └── sample_from_map.m
│ │ │ │ │ ├── Mgram
│ │ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ │ │ └── mgram2.m
│ │ │ │ │ │ ├── letter2num.m
│ │ │ │ │ │ ├── mgram1.m
│ │ │ │ │ │ ├── mgram2.m
│ │ │ │ │ │ ├── mgram3.m
│ │ │ │ │ │ └── num2letter.m
│ │ │ │ │ ├── Motif
│ │ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ │ ├── fixed_args_mk_motif_hhmm.m
│ │ │ │ │ │ ├── learn_motif_hhmm.m
│ │ │ │ │ │ ├── mk_motif_hhmm.m
│ │ │ │ │ │ └── sample_motif_hhmm.m
│ │ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ │ ├── mk_abcd_hhmm.m
│ │ │ │ │ │ ├── mk_arrow_alpha_hhmm3.m
│ │ │ │ │ │ ├── mk_hhmm2.m
│ │ │ │ │ │ ├── mk_hhmm3.m
│ │ │ │ │ │ ├── mk_hhmm3_args.m
│ │ │ │ │ │ ├── motif_hhmm.m
│ │ │ │ │ │ └── remove_hhmm_end_state.m
│ │ │ │ │ ├── Square
│ │ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ │ │ ├── learn_square_hhmm.m
│ │ │ │ │ │ │ ├── mk_square_hhmm.m
│ │ │ │ │ │ │ ├── plot_square_hhmm.m
│ │ │ │ │ │ │ └── sample_square_hhmm.m
│ │ │ │ │ │ ├── get_square_data.m
│ │ │ │ │ │ ├── hhmm_inference.m
│ │ │ │ │ │ ├── is_F2_true_D3.m
│ │ │ │ │ │ ├── learn_square_hhmm_cts.m
│ │ │ │ │ │ ├── learn_square_hhmm_discrete.m
│ │ │ │ │ │ ├── mk_square_hhmm.m
│ │ │ │ │ │ ├── plot_square_hhmm.m
│ │ │ │ │ │ ├── sample_square_hhmm_cts.m
│ │ │ │ │ │ ├── sample_square_hhmm_discrete.m
│ │ │ │ │ │ ├── square4.mat
│ │ │ │ │ │ ├── square4_cases.mat
│ │ │ │ │ │ ├── test_square_fig.m
│ │ │ │ │ │ └── test_square_fig.mat
│ │ │ │ │ ├── abcd_hhmm.m
│ │ │ │ │ ├── add_hhmm_end_state.m
│ │ │ │ │ ├── hhmm_jtree_clqs.m
│ │ │ │ │ ├── mk_hhmm.m
│ │ │ │ │ ├── mk_hhmm_topo.m
│ │ │ │ │ ├── mk_hhmm_topo_F1.m
│ │ │ │ │ ├── pretty_print_hhmm_parse.m
│ │ │ │ │ └── remove_hhmm_end_state.m
│ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── chmm1.m
│ │ │ │ │ ├── cmp_inference.m
│ │ │ │ │ ├── kalman1.m
│ │ │ │ │ ├── old.water1.m
│ │ │ │ │ ├── online1.m
│ │ │ │ │ ├── online2.m
│ │ │ │ │ └── scg_dbn.m
│ │ │ │ ├── SLAM
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ │ ├── offline_loopy_slam.m
│ │ │ │ │ │ ├── paskin1.m
│ │ │ │ │ │ ├── skf_data_assoc_gmux2.m
│ │ │ │ │ │ └── slam_kf.m
│ │ │ │ │ ├── mk_gmux_robot_dbn.m
│ │ │ │ │ ├── mk_linear_slam.m
│ │ │ │ │ ├── slam_kf.m
│ │ │ │ │ ├── slam_offline_loopy.m
│ │ │ │ │ ├── slam_partial_kf.m
│ │ │ │ │ └── slam_stationary_loopy.m
│ │ │ │ ├── arhmm1.m
│ │ │ │ ├── bat1.m
│ │ │ │ ├── bkff1.m
│ │ │ │ ├── chmm1.m
│ │ │ │ ├── cmp_inference_dbn.m
│ │ │ │ ├── cmp_learning_dbn.m
│ │ │ │ ├── cmp_online_inference.m
│ │ │ │ ├── dhmm1.m
│ │ │ │ ├── ehmm1.m
│ │ │ │ ├── fhmm_infer.m
│ │ │ │ ├── filter_test1.m
│ │ │ │ ├── ghmm1.m
│ │ │ │ ├── ho1.m
│ │ │ │ ├── jtree_clq_test.m
│ │ │ │ ├── jtree_clq_test2.m
│ │ │ │ ├── kalman1.m
│ │ │ │ ├── kjaerulff1.m
│ │ │ │ ├── loopy_dbn1.m
│ │ │ │ ├── mhmm1.m
│ │ │ │ ├── mildew1.m
│ │ │ │ ├── mk_bat_dbn.m
│ │ │ │ ├── mk_chmm.m
│ │ │ │ ├── mk_collage_from_clqs.m
│ │ │ │ ├── mk_fhmm.m
│ │ │ │ ├── mk_mildew_dbn.m
│ │ │ │ ├── mk_orig_bat_dbn.m
│ │ │ │ ├── mk_orig_water_dbn.m
│ │ │ │ ├── mk_ps_from_clqs.m
│ │ │ │ ├── mk_uffe_dbn.m
│ │ │ │ ├── mk_water_dbn.m
│ │ │ │ ├── orig_water1.m
│ │ │ │ ├── reveal1.m
│ │ │ │ ├── scg_dbn.m
│ │ │ │ ├── skf_data_assoc_gmux.m
│ │ │ │ ├── viterbi1.m
│ │ │ │ ├── water1.m
│ │ │ │ └── water2.m
│ │ │ ├── limids
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── amnio.m
│ │ │ │ ├── asia_dt1.m
│ │ │ │ ├── id1.m
│ │ │ │ ├── oil1.m
│ │ │ │ └── pigs1.m
│ │ │ └── static
│ │ │ ├── Belprop
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── belprop_loop1_discrete.m
│ │ │ │ ├── belprop_loop1_gauss.m
│ │ │ │ ├── belprop_loopy_cg.m
│ │ │ │ ├── belprop_loopy_discrete.m
│ │ │ │ ├── belprop_loopy_gauss.m
│ │ │ │ ├── belprop_polytree_cg.m
│ │ │ │ ├── belprop_polytree_discrete.m
│ │ │ │ ├── belprop_polytree_gauss.m
│ │ │ │ ├── bp1.m
│ │ │ │ └── gmux1.m
│ │ │ ├── Brutti
│ │ │ │ ├── Belief_IOhmm.m
│ │ │ │ ├── Belief_hmdt.m
│ │ │ │ ├── Belief_hme.m
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ └── Sigmoid_Belief.m
│ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ └── Root
│ │ │ ├── HME
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── HMEforMatlab.jpg
│ │ │ │ ├── README
│ │ │ │ ├── fhme.m
│ │ │ │ ├── gen_data.m
│ │ │ │ ├── hme_class_plot.m
│ │ │ │ ├── hme_reg_plot.m
│ │ │ │ ├── hme_topobuilder.m
│ │ │ │ ├── hmemenu.asv
│ │ │ │ ├── hmemenu.m
│ │ │ │ ├── test_data_class.mat
│ │ │ │ ├── test_data_class2.mat
│ │ │ │ ├── test_data_reg.mat
│ │ │ │ ├── train_data_class.mat
│ │ │ │ └── train_data_reg.mat
│ │ │ ├── Misc
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── mixexp_data.txt
│ │ │ │ ├── mixexp_graddesc.m
│ │ │ │ ├── mixexp_plot.m
│ │ │ │ └── sprinkler.bif
│ │ │ ├── Models
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ └── mk_hmm_bnet.m
│ │ │ │ ├── mk_alarm_bnet.m
│ │ │ │ ├── mk_asia_bnet.m
│ │ │ │ ├── mk_cancer_bnet.m
│ │ │ │ ├── mk_car_bnet.m
│ │ │ │ ├── mk_hmm_bnet.m
│ │ │ │ ├── mk_ideker_bnet.m
│ │ │ │ ├── mk_incinerator_bnet.m
│ │ │ │ ├── mk_markov_chain_bnet.m
│ │ │ │ ├── mk_minimal_qmr_bnet.m
│ │ │ │ ├── mk_qmr_bnet.m
│ │ │ │ └── mk_vstruct_bnet.m
│ │ │ ├── SCG
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── scg1.m
│ │ │ │ ├── scg2.m
│ │ │ │ ├── scg3.m
│ │ │ │ ├── scg_3node.m
│ │ │ │ └── scg_unstable.m
│ │ │ ├── StructLearn
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── bic1.asv
│ │ │ │ ├── bic1.m
│ │ │ │ ├── cooper_yoo.asv
│ │ │ │ ├── cooper_yoo.m
│ │ │ │ ├── k2demo1.asv
│ │ │ │ ├── k2demo1.m
│ │ │ │ ├── mcmc1.asv
│ │ │ │ ├── mcmc1.m
│ │ │ │ ├── model_select1.asv
│ │ │ │ ├── model_select1.m
│ │ │ │ ├── model_select2.m
│ │ │ │ ├── pc1.m
│ │ │ │ └── pc2.m
│ │ │ ├── Zoubin
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── README
│ │ │ │ ├── csum.m
│ │ │ │ ├── ffa.m
│ │ │ │ ├── mfa.m
│ │ │ │ ├── mfa_cl.m
│ │ │ │ ├── mfademo.m
│ │ │ │ ├── rdiv.m
│ │ │ │ ├── rprod.m
│ │ │ │ └── rsum.m
│ │ │ ├── brainy.m
│ │ │ ├── burglar-alarm-net.lisp.txt
│ │ │ ├── burglary.m
│ │ │ ├── cg1.asv
│ │ │ ├── cg1.m
│ │ │ ├── cg2.m
│ │ │ ├── cmp_inference_static.m
│ │ │ ├── discrete1.m
│ │ │ ├── discrete2.m
│ │ │ ├── discrete3.m
│ │ │ ├── dtree
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── test_housing.m
│ │ │ │ ├── test_restaurants.m
│ │ │ │ ├── test_zoo1.m
│ │ │ │ ├── tmp.dot
│ │ │ │ └── transform_data_into_bnt_format.m
│ │ │ ├── fa1.m
│ │ │ ├── fgraph
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── fg1.m
│ │ │ │ ├── fg2.m
│ │ │ │ ├── fg3.m
│ │ │ │ ├── fg_mrf1.m
│ │ │ │ └── fg_mrf2.m
│ │ │ ├── gaussian1.m
│ │ │ ├── gaussian2.m
│ │ │ ├── gibbs_test1.m
│ │ │ ├── learn1.asv
│ │ │ ├── learn1.m
│ │ │ ├── lw1.m
│ │ │ ├── mfa1.asv
│ │ │ ├── mfa1.m
│ │ │ ├── mixexp1.m
│ │ │ ├── mixexp2.asv
│ │ │ ├── mixexp2.m
│ │ │ ├── mixexp3.m
│ │ │ ├── mog1.m
│ │ │ ├── mpe1.m
│ │ │ ├── mpe2.m
│ │ │ ├── nodeorderExample.m
│ │ │ ├── qmr1.asv
│ │ │ ├── qmr1.m
│ │ │ ├── qmr2.m
│ │ │ ├── sample1.m
│ │ │ ├── softev1.m
│ │ │ ├── softmax1.m
│ │ │ └── sprinkler1.m
│ │ ├── general
│ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ └── Root
│ │ │ ├── Old
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── bnet_to_gdl_graph.m
│ │ │ │ ├── calc_mpe.m
│ │ │ │ ├── calc_mpe_bucket.m
│ │ │ │ ├── calc_mpe_dbn.m
│ │ │ │ ├── calc_mpe_given_inf_engine.m
│ │ │ │ ├── calc_mpe_global.m
│ │ │ │ ├── compute_interface_nodes.m
│ │ │ │ └── mk_gdl_graph.m
│ │ │ ├── add_ev_to_dmarginal.m
│ │ │ ├── add_evidence_to_gmarginal.m
│ │ │ ├── bnet_to_fgraph.m
│ │ │ ├── compute_fwd_interface.m
│ │ │ ├── compute_interface_nodes.m
│ │ │ ├── compute_joint_pot.m
│ │ │ ├── compute_minimal_interface.m
│ │ │ ├── convert_dbn_CPDs_to_pots.m
│ │ │ ├── convert_dbn_CPDs_to_tables.m
│ │ │ ├── convert_dbn_CPDs_to_tables1.m
│ │ │ ├── convert_dbn_CPDs_to_tables_slow.m
│ │ │ ├── dbn_to_bnet.m
│ │ │ ├── dbn_to_hmm.m
│ │ │ ├── determine_elim_constraints.m
│ │ │ ├── dispcpt.m
│ │ │ ├── do_intervention.m
│ │ │ ├── dsep.m
│ │ │ ├── dsep_test.m
│ │ │ ├── enumerate_scenarios.m
│ │ │ ├── fgraph_to_bnet.m
│ │ │ ├── hodbn_to_bnet.m
│ │ │ ├── is_mnet.m
│ │ │ ├── linear_gaussian_to_cpot.m
│ │ │ ├── log_lik_complete.m
│ │ │ ├── log_marg_lik_complete.m
│ │ │ ├── mk_bnet.m
│ │ │ ├── mk_dbn.m
│ │ │ ├── mk_fgraph.m
│ │ │ ├── mk_fgraph_given_ev.m
│ │ │ ├── mk_higher_order_dbn.m
│ │ │ ├── mk_limid.m
│ │ │ ├── mk_mnet.m
│ │ │ ├── mk_mrf2.m
│ │ │ ├── mk_mutilated_samples.m
│ │ │ ├── mk_named_CPT.m
│ │ │ ├── mk_slice_and_half_dbn.m
│ │ │ ├── noisyORtoTable.m
│ │ │ ├── partition_dbn_nodes.m
│ │ │ ├── partition_matrix_vec_3.m
│ │ │ ├── sample_bnet.m
│ │ │ ├── sample_bnet_nocell.m
│ │ │ ├── sample_dbn.m
│ │ │ ├── score_bnet_complete.m
│ │ │ ├── shrink_obs_dims_in_gaussian.m
│ │ │ ├── shrink_obs_dims_in_table.m
│ │ │ ├── solve_limid.m
│ │ │ ├── unroll_dbn_topology.m
│ │ │ ├── unroll_higher_order_topology.m
│ │ │ └── unroll_set.m
│ │ ├── inference
│ │ │ ├── @inf_engine
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── marginal_family_pot.m
│ │ │ │ │ └── observed_nodes.m
│ │ │ │ ├── bnet_from_engine.m
│ │ │ │ ├── get_field.m
│ │ │ │ ├── inf_engine.m
│ │ │ │ ├── marginal_family.m
│ │ │ │ ├── set_fields.m
│ │ │ │ └── update_engine.m
│ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ └── Root
│ │ │ ├── dummy
│ │ │ ├── dynamic
│ │ │ │ ├── @bk_ff_hmm_inf_engine
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── bk_ff_hmm_inf_engine.m
│ │ │ │ │ ├── dbn_init_bel.m
│ │ │ │ │ ├── dbn_marginal_from_bel.m
│ │ │ │ │ ├── dbn_predict_bel.m
│ │ │ │ │ ├── dbn_update_bel.m
│ │ │ │ │ ├── dbn_update_bel1.m
│ │ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_family.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_nodes.m
│ │ │ │ │ └── private
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── bk_ff_fb.m
│ │ │ │ │ ├── combine_marginals_into_joint.m
│ │ │ │ │ ├── dbn_to_hmm.m
│ │ │ │ │ ├── mk_hmm_obs_lik_mat.m
│ │ │ │ │ ├── mk_hmm_obs_lik_vec.m
│ │ │ │ │ ├── mk_hmm_obs_lik_vec1.m
│ │ │ │ │ └── project_joint_onto_marginals.m
│ │ │ │ ├── @bk_inf_engine
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── bk_inf_engine.m
│ │ │ │ │ ├── dbn_init_bel.m
│ │ │ │ │ ├── dbn_marginal_from_bel.m
│ │ │ │ │ ├── dbn_update_bel.m
│ │ │ │ │ ├── dbn_update_bel1.m
│ │ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ │ ├── enter_soft_evidence.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_family.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_nodes.m
│ │ │ │ │ └── update_engine.m
│ │ │ │ ├── @cbk_inf_engine
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── cbk_inf_engine.m
│ │ │ │ │ ├── dbn_init_bel.m
│ │ │ │ │ ├── dbn_marginal_from_bel.m
│ │ │ │ │ ├── dbn_update_bel.m
│ │ │ │ │ ├── dbn_update_bel1.m
│ │ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ │ ├── enter_soft_evidence.m
│ │ │ │ │ ├── junk
│ │ │ │ │ ├── marginal_family.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_nodes.m
│ │ │ │ │ └── update_engine.m
│ │ │ │ ├── @ff_inf_engine
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ │ ├── enter_soft_evidence.m
│ │ │ │ │ │ ├── enter_soft_evidence1.m
│ │ │ │ │ │ └── marginal_family.m
│ │ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ │ ├── enter_soft_evidence.m
│ │ │ │ │ ├── ff_inf_engine.m
│ │ │ │ │ ├── filter_evidence.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_family.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_nodes.m
│ │ │ │ │ └── smooth_evidence.m
│ │ │ │ ├── @frontier_inf_engine
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ │ ├── enter_soft_evidence.m
│ │ │ │ │ ├── frontier_inf_engine.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_family.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_nodes.m
│ │ │ │ │ └── set_fwdback.m
│ │ │ │ ├── @hmm_inf_engine
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ │ ├── dhmm_inf_engine.m
│ │ │ │ │ │ ├── marginal_family.m
│ │ │ │ │ │ └── marginal_nodes.m
│ │ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ │ ├── find_mpe.m
│ │ │ │ │ ├── fwdback_twoslice.m
│ │ │ │ │ ├── hmm_inf_engine.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_family.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_nodes.m
│ │ │ │ │ ├── private
│ │ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ │ ├── mk_hmm_obs_lik_matrix.m
│ │ │ │ │ │ └── mk_hmm_obs_lik_vec.m
│ │ │ │ │ └── update_engine.m
│ │ │ │ ├── @jtree_dbn_inf_engine
│ │ │ │ │ ├── Broken
│ │ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ │ ├── enter_soft_evidence1.m
│ │ │ │ │ │ ├── enter_soft_evidence2.m
│ │ │ │ │ │ ├── enter_soft_evidence3.m
│ │ │ │ │ │ ├── enter_soft_evidence4.m
│ │ │ │ │ │ └── marginal_nodes.m
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ │ ├── enter_soft_evidence_nonint.m
│ │ │ │ │ │ ├── enter_soft_evidence_trans.m
│ │ │ │ │ │ ├── jtree_dbn_inf_engine.m
│ │ │ │ │ │ ├── jtree_dbn_inf_engine1.m
│ │ │ │ │ │ └── jtree_dbn_inf_engine2.m
│ │ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ │ ├── enter_soft_evidence.m
│ │ │ │ │ ├── jtree_dbn_inf_engine.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_family.m
│ │ │ │ │ └── marginal_nodes.m
│ │ │ │ ├── @jtree_unrolled_dbn_inf_engine
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ │ ├── marginal_family.m
│ │ │ │ │ │ └── marginal_nodes.m
│ │ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ │ ├── jtree_unrolled_dbn_inf_engine.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_family.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_nodes.m
│ │ │ │ │ └── update_engine.m
│ │ │ │ ├── @kalman_inf_engine
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ │ ├── kalman_inf_engine.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_nodes.m
│ │ │ │ │ ├── private
│ │ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ │ ├── dbn_to_lds.m
│ │ │ │ │ │ └── extract_params_from_gbn.m
│ │ │ │ │ └── update_engine.m
│ │ │ │ ├── @pearl_dbn_inf_engine
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ │ ├── correct_smooth.m
│ │ │ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ │ │ ├── filter_evidence.m
│ │ │ │ │ │ ├── filter_evidence_obj_oriented.m
│ │ │ │ │ │ ├── smooth_evidence.m
│ │ │ │ │ │ ├── smooth_evidence_fast.m
│ │ │ │ │ │ └── wrong_smooth.m
│ │ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ │ ├── enter_soft_ev.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_nodes.m
│ │ │ │ │ ├── pearl_dbn_inf_engine.m
│ │ │ │ │ └── private
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ └── init_pearl_dbn_ev_msgs.m
│ │ │ │ ├── @pearl_unrolled_dbn_inf_engine
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_family.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_nodes.m
│ │ │ │ │ ├── pearl_unrolled_dbn_inf_engine.m
│ │ │ │ │ └── update_engine.m
│ │ │ │ ├── @stable_ho_inf_engine
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_family.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_nodes.m
│ │ │ │ │ ├── stable_ho_inf_engine.m
│ │ │ │ │ ├── test_ho_inf_enginge.m
│ │ │ │ │ └── update_engine.m
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ └── dummy
│ │ │ ├── online
│ │ │ │ ├── @filter_engine
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── bnet_from_engine.m
│ │ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ │ ├── filter_engine.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_family.m
│ │ │ │ │ └── marginal_nodes.m
│ │ │ │ ├── @hmm_2TBN_inf_engine
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── back.m
│ │ │ │ │ ├── backT.m
│ │ │ │ │ ├── fwd.m
│ │ │ │ │ ├── fwd1.m
│ │ │ │ │ ├── hmm_2TBN_inf_engine.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_family.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_nodes.m
│ │ │ │ │ ├── private
│ │ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ │ └── mk_hmm_obs_lik_vec.m
│ │ │ │ │ └── update_engine.m
│ │ │ │ ├── @jtree_2TBN_inf_engine
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ │ └── jtree_2TBN_inf_engine.m
│ │ │ │ │ ├── back.m
│ │ │ │ │ ├── back1.m
│ │ │ │ │ ├── back1_mpe.m
│ │ │ │ │ ├── backT.m
│ │ │ │ │ ├── backT_mpe.m
│ │ │ │ │ ├── back_mpe.m
│ │ │ │ │ ├── fwd.m
│ │ │ │ │ ├── fwd1.m
│ │ │ │ │ ├── jtree_2TBN_inf_engine.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_family.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_nodes.m
│ │ │ │ │ └── set_fields.m
│ │ │ │ ├── @jtree_sparse_2TBN_inf_engine
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── back.m
│ │ │ │ │ ├── back1.m
│ │ │ │ │ ├── backT.m
│ │ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ │ ├── fwd.m
│ │ │ │ │ ├── fwd1.m
│ │ │ │ │ ├── jtree_sparse_2TBN_inf_engine.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_family.m
│ │ │ │ │ └── marginal_nodes.m
│ │ │ │ ├── @smoother_engine
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── bnet_from_engine.m
│ │ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ │ ├── find_mpe.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_family.m
│ │ │ │ │ ├── marginal_nodes.m
│ │ │ │ │ ├── smoother_engine.m
│ │ │ │ │ └── update_engine.m
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ └── dummy
│ │ │ └── static
│ │ │ ├── @belprop_fg_inf_engine
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── belprop_fg_inf_engine.m
│ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ ├── find_mpe.m
│ │ │ │ ├── loopy_converged.m
│ │ │ │ ├── marginal_nodes.m
│ │ │ │ └── set_params.m
│ │ │ ├── @belprop_inf_engine
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── belprop_gdl_inf_engine.m
│ │ │ │ │ ├── belprop_inf_engine_nostr.m
│ │ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ │ ├── enter_evidence1.m
│ │ │ │ │ └── marginal_domain.m
│ │ │ │ ├── belprop_inf_engine.m
│ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ ├── find_mpe.m
│ │ │ │ ├── loopy_converged.m
│ │ │ │ ├── marginal_family.m
│ │ │ │ ├── marginal_nodes.m
│ │ │ │ └── private
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── junk
│ │ │ │ ├── parallel_protocol.m
│ │ │ │ └── tree_protocol.m
│ │ │ ├── @belprop_mrf2_inf_engine
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── belprop_mrf2_inf_engine.m
│ │ │ │ ├── bp_mrf2.m
│ │ │ │ ├── enter_soft_evidence.m
│ │ │ │ ├── find_mpe.m
│ │ │ │ ├── marginal_nodes.m
│ │ │ │ └── set_params.m
│ │ │ ├── @cond_gauss_inf_engine
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── cond_gauss_inf_engine.m
│ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ └── marginal_nodes.m
│ │ │ ├── @enumerative_inf_engine
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ ├── enumerative_inf_engine.m
│ │ │ │ └── marginal_nodes.m
│ │ │ ├── @gaussian_inf_engine
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ ├── gaussian_inf_engine.m
│ │ │ │ ├── marginal_nodes.m
│ │ │ │ └── private
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ └── extract_params_from_gbn.m
│ │ │ ├── @gibbs_sampling_inf_engine
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ ├── gibbs_sampling_inf_engine.m
│ │ │ │ ├── marginal_nodes.m
│ │ │ │ └── private
│ │ │ │ ├── CPT.m
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── compute_children.m
│ │ │ │ ├── compute_families.m
│ │ │ │ ├── compute_families_dbn.m
│ │ │ │ ├── compute_posterior.c
│ │ │ │ ├── compute_posterior_dbn.m
│ │ │ │ ├── compute_strides.m
│ │ │ │ ├── get_cpts.m
│ │ │ │ ├── get_slice_dbn.c
│ │ │ │ ├── get_slice_dbn.m
│ │ │ │ ├── my_sample_discrete.m
│ │ │ │ └── sample_single_discrete.c
│ │ │ ├── @global_joint_inf_engine
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ ├── find_mpe.m
│ │ │ │ ├── global_joint_inf_engine.m
│ │ │ │ ├── marginal_family.m
│ │ │ │ └── marginal_nodes.m
│ │ │ ├── @jtree_inf_engine
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── collect_evidence.m
│ │ │ │ │ ├── distribute_evidence.m
│ │ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ │ └── enter_soft_evidence.m
│ │ │ │ ├── cliques_from_engine.m
│ │ │ │ ├── clq_containing_nodes.m
│ │ │ │ ├── collect_evidence.m
│ │ │ │ ├── distribute_evidence.m
│ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ ├── enter_soft_evidence.m
│ │ │ │ ├── find_max_config.m
│ │ │ │ ├── find_mpe.m
│ │ │ │ ├── init_pot.m
│ │ │ │ ├── jtree_inf_engine.m
│ │ │ │ ├── marginal_family.m
│ │ │ │ ├── marginal_nodes.m
│ │ │ │ └── set_fields.m
│ │ │ ├── @jtree_limid_inf_engine
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── marginal_family.m
│ │ │ │ │ └── marginal_nodes_SS.m
│ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ ├── jtree_limid_inf_engine.m
│ │ │ │ ├── marginal_family.m
│ │ │ │ └── marginal_nodes.m
│ │ │ ├── @jtree_mnet_inf_engine
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ ├── find_mpe.m
│ │ │ │ └── jtree_mnet_inf_engine.m
│ │ │ ├── @jtree_sparse_inf_engine
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── cliques_from_engine.m
│ │ │ │ ├── clq_containing_nodes.m
│ │ │ │ ├── collect_evidence.c
│ │ │ │ ├── distribute_evidence.c
│ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ ├── enter_soft_evidence.m
│ │ │ │ ├── init_pot.c
│ │ │ │ ├── jtree_sparse_inf_engine.m
│ │ │ │ ├── marginal_family.m
│ │ │ │ ├── marginal_nodes.m
│ │ │ │ ├── old
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── collect_evidence.c
│ │ │ │ │ ├── distribute_evidence.c
│ │ │ │ │ ├── init_pot.c
│ │ │ │ │ ├── init_pot1.c
│ │ │ │ │ └── init_pot1.m
│ │ │ │ └── set_fields.m
│ │ │ ├── @likelihood_weighting_inf_engine
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ ├── likelihood_weighting_inf_engine.m
│ │ │ │ └── marginal_nodes.m
│ │ │ ├── @pearl_inf_engine
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── bethe_free_energy.m
│ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ ├── loopy_converged.m
│ │ │ │ ├── marginal_family.m
│ │ │ │ ├── marginal_nodes.m
│ │ │ │ ├── pearl_inf_engine.m
│ │ │ │ ├── pearl_inf_engine.m~
│ │ │ │ └── private
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── compute_bel.m
│ │ │ │ ├── parallel_protocol.m
│ │ │ │ ├── parallel_protocol.m~
│ │ │ │ ├── prod_lambda_msgs.m
│ │ │ │ └── tree_protocol.m
│ │ │ ├── @quickscore_inf_engine
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ ├── marginal_nodes.m
│ │ │ │ ├── private
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── C_quickscore.c
│ │ │ │ │ ├── nr.h
│ │ │ │ │ ├── nrutil.c
│ │ │ │ │ ├── nrutil.h
│ │ │ │ │ └── quickscore.m
│ │ │ │ └── quickscore_inf_engine.m
│ │ │ ├── @stab_cond_gauss_inf_engine
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ └── initialize_engine.m
│ │ │ │ ├── README
│ │ │ │ ├── clq_containing_nodes.m
│ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ ├── marginal_difclq_nodes.m
│ │ │ │ ├── marginal_nodes.m
│ │ │ │ ├── marginal_singleclq_nodes.m
│ │ │ │ ├── problems.txt
│ │ │ │ ├── push.m
│ │ │ │ ├── push_pot_toclique.m
│ │ │ │ └── stab_cond_gauss_inf_engine.m
│ │ │ ├── @var_elim_inf_engine
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── enter_evidence.m
│ │ │ │ ├── find_mpe.m
│ │ │ │ ├── marginal_nodes.m
│ │ │ │ └── var_elim_inf_engine.m
│ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ └── Root
│ │ │ └── dummy
│ │ ├── installC_BNT.m
│ │ ├── installC_graph.m
│ │ ├── learning
│ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ └── Root
│ │ │ ├── CovMat.m
│ │ │ ├── bayes_update_params.m
│ │ │ ├── bic_score_family.m
│ │ │ ├── compute_cooling_schedule.m
│ │ │ ├── dirichlet_score_family.m
│ │ │ ├── kpm_learn_struct_mcmc.m
│ │ │ ├── learn_params.m
│ │ │ ├── learn_params_dbn.m
│ │ │ ├── learn_params_dbn_em.m
│ │ │ ├── learn_params_em.m
│ │ │ ├── learn_struct_K2.m
│ │ │ ├── learn_struct_dbn_reveal.m
│ │ │ ├── learn_struct_mcmc.asv
│ │ │ ├── learn_struct_mcmc.m
│ │ │ ├── learn_struct_pdag_ic_star.m
│ │ │ ├── learn_struct_pdag_pc.m
│ │ │ ├── learn_struct_pdag_pc_constrain.m
│ │ │ ├── mcmc_sample_to_hist.asv
│ │ │ ├── mcmc_sample_to_hist.m
│ │ │ ├── mk_schedule.m
│ │ │ ├── mk_tetrad_data_file.m
│ │ │ ├── score_dags.m
│ │ │ ├── score_dags_old.m
│ │ │ └── score_family.m
│ │ ├── license.gpl.txt
│ │ ├── potentials
│ │ │ ├── @cgpot
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── normalize_pot.m
│ │ │ │ │ ├── set_domain_pot.m
│ │ │ │ │ └── simple_marginalize_pot.m
│ │ │ │ ├── cg_can_to_mom.m
│ │ │ │ ├── cg_mom_to_can.m
│ │ │ │ ├── cgpot.m
│ │ │ │ ├── display.m
│ │ │ │ ├── divide_by_pot.m
│ │ │ │ ├── domain_pot.m
│ │ │ │ ├── enter_cts_evidence_pot.m
│ │ │ │ ├── enter_discrete_evidence_pot.m
│ │ │ │ ├── marginalize_pot.m
│ │ │ │ ├── multiply_by_pot.m
│ │ │ │ ├── multiply_pots.m
│ │ │ │ ├── normalize_pot.m
│ │ │ │ ├── pot_to_marginal.m
│ │ │ │ └── set_domain_pot.m
│ │ │ ├── @cpot
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── Old
│ │ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ │ ├── cpot_to_mpot.m
│ │ │ │ │ └── normalize_pot.convert.m
│ │ │ │ ├── cpot.m
│ │ │ │ ├── cpot_to_mpot.m
│ │ │ │ ├── display.m
│ │ │ │ ├── divide_by_pot.m
│ │ │ │ ├── domain_pot.m
│ │ │ │ ├── enter_cts_evidence_pot.m
│ │ │ │ ├── marginalize_pot.m
│ │ │ │ ├── multiply_by_pot.m
│ │ │ │ ├── multiply_pots.m
│ │ │ │ ├── normalize_pot.m
│ │ │ │ ├── pot_to_marginal.m
│ │ │ │ ├── rescale_pot.m
│ │ │ │ └── set_domain_pot.m
│ │ │ ├── @dpot
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── approxeq_pot.m
│ │ │ │ ├── display.m
│ │ │ │ ├── divide_by_pot.m
│ │ │ │ ├── domain_pot.m
│ │ │ │ ├── dpot.m
│ │ │ │ ├── dpot_to_table.m
│ │ │ │ ├── find_most_prob_entry.m
│ │ │ │ ├── get_fields.m
│ │ │ │ ├── marginalize_pot.m
│ │ │ │ ├── multiply_by_pot.m
│ │ │ │ ├── multiply_pots.m
│ │ │ │ ├── normalize_pot.m
│ │ │ │ ├── pot_to_marginal.m
│ │ │ │ ├── set_domain_pot.m
│ │ │ │ ├── subsasgn.m
│ │ │ │ └── subsref.m
│ │ │ ├── @mpot
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── display.m
│ │ │ │ ├── marginalize_pot.m
│ │ │ │ ├── mpot.m
│ │ │ │ ├── mpot_to_cpot.m
│ │ │ │ ├── normalize_pot.m
│ │ │ │ ├── pot_to_marginal.m
│ │ │ │ ├── rescale_pot.m
│ │ │ │ └── set_domain_pot.m
│ │ │ ├── @scgcpot
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── marginalize_pot.m
│ │ │ │ ├── normalize_pot.m
│ │ │ │ ├── reduce_pot.m
│ │ │ │ ├── rescale_pot.m
│ │ │ │ └── scgcpot.m
│ │ │ ├── @scgpot
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── README
│ │ │ │ ├── combine_pots.m
│ │ │ │ ├── complement_pot.m
│ │ │ │ ├── direct_combine_pots.m
│ │ │ │ ├── extension_pot.m
│ │ │ │ ├── marginalize_pot.m
│ │ │ │ ├── normalize_pot.m
│ │ │ │ ├── pot_to_marginal.m
│ │ │ │ ├── recursive_combine_pots.m
│ │ │ │ ├── reduce_pot.m
│ │ │ │ └── scgpot.m
│ │ │ ├── @upot
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── approxeq_pot.m
│ │ │ │ ├── display.m
│ │ │ │ ├── divide_by_pot.m
│ │ │ │ ├── marginalize_pot.m
│ │ │ │ ├── multiply_by_pot.m
│ │ │ │ ├── normalize_pot.m
│ │ │ │ ├── pot_to_marginal.m
│ │ │ │ ├── upot.m
│ │ │ │ └── upot_to_opt_policy.m
│ │ │ ├── CPD_to_pot.m
│ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ └── Root
│ │ │ ├── Old
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ └── comp_eff_node_sizes.m
│ │ │ ├── README
│ │ │ ├── Tables
│ │ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ │ └── Root
│ │ │ │ ├── divide_by_sparse_table.c
│ │ │ │ ├── divide_by_table.c
│ │ │ │ ├── divide_by_table.m
│ │ │ │ ├── extend_domain_table.m
│ │ │ │ ├── marg_sparse_table.c
│ │ │ │ ├── marg_table.c
│ │ │ │ ├── marg_table.m
│ │ │ │ ├── marg_tableC.c
│ │ │ │ ├── marg_tableM.m
│ │ │ │ ├── mult_by_sparse_table.c
│ │ │ │ ├── mult_by_table.c
│ │ │ │ ├── mult_by_table.m
│ │ │ │ ├── mult_by_table2.m
│ │ │ │ ├── mult_by_tableC.c
│ │ │ │ ├── mult_by_tableM.m
│ │ │ │ ├── mult_by_table_global.m
│ │ │ │ ├── rep_mult.c
│ │ │ │ └── repmat_and_mult.c
│ │ │ ├── check_for_cd_arcs.m
│ │ │ ├── determine_pot_type.m
│ │ │ ├── genops.c
│ │ │ └── mk_initial_pot.m
│ │ ├── test_BNT.m
│ │ ├── test_BNT.m~
│ │ └── uninstallC_BNT.m
│ ├── CVS
│ │ ├── Entries
│ │ ├── Entries.Log
│ │ ├── Repository
│ │ └── Root
│ ├── ChangeLog.Sourceforge.txt
│ ├── ChangeLog.txt
│ ├── GraphViz
│ │ ├── CVS
│ │ │ ├── Entries
│ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ ├── Repository
│ │ │ └── Root
│ │ ├── Old
│ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ └── Root
│ │ │ ├── dot_to_graph.m
│ │ │ ├── draw_dot.m
│ │ │ ├── draw_graph.m
│ │ │ ├── graphToDot.m
│ │ │ └── pre_pesha_graph_to_dot.m
│ │ ├── README.txt
│ │ ├── approxeq.m
│ │ ├── arrow.m
│ │ ├── dot_to_graph.m
│ │ ├── draw_dbn.m
│ │ ├── draw_dbn_test.m
│ │ ├── draw_dot.m
│ │ ├── draw_graph.m
│ │ ├── draw_graph_test.m
│ │ ├── draw_hmm.m
│ │ ├── editGraphGUI.m
│ │ ├── graph_to_dot.m
│ │ ├── make_layout.m
│ │ ├── my_call.m
│ │ └── process_options.m
│ ├── HMM
│ │ ├── CVS
│ │ │ ├── Entries
│ │ │ ├── Repository
│ │ │ └── Root
│ │ ├── README.txt
│ │ ├── dhmm_em.m
│ │ ├── dhmm_em_demo.m
│ │ ├── dhmm_em_online.m
│ │ ├── dhmm_em_online_demo.m
│ │ ├── dhmm_logprob.m
│ │ ├── dhmm_logprob_brute_force.m
│ │ ├── dhmm_logprob_path.m
│ │ ├── dhmm_sample.m
│ │ ├── dhmm_sample_endstate.m
│ │ ├── fixed_lag_smoother.m
│ │ ├── fixed_lag_smoother_demo.m
│ │ ├── fwdback.m
│ │ ├── gausshmm_train_observed.m
│ │ ├── mc_sample.m
│ │ ├── mc_sample_endstate.m
│ │ ├── mdp_sample.m
│ │ ├── mhmmParzen_train_observed.m
│ │ ├── mhmm_em.m
│ │ ├── mhmm_em_demo.m
│ │ ├── mhmm_logprob.m
│ │ ├── mhmm_sample.m
│ │ ├── mk_leftright_transmat.m
│ │ ├── mk_rightleft_transmat.m
│ │ ├── pomdp_sample.m
│ │ ├── testHMM.m
│ │ ├── transmat_train_observed.m
│ │ └── viterbi_path.m
│ ├── KPMstats
│ │ ├── CVS
│ │ │ ├── Entries
│ │ │ ├── Repository
│ │ │ └── Root
│ │ ├── KLgauss.m
│ │ ├── README.txt
│ │ ├── beta_sample.m
│ │ ├── chisquared_histo.m
│ │ ├── chisquared_prob.m
│ │ ├── chisquared_readme.txt
│ │ ├── chisquared_table.m
│ │ ├── clg_Mstep.m
│ │ ├── clg_Mstep_simple.m
│ │ ├── clg_prob.m
│ │ ├── condGaussToJoint.m
│ │ ├── cond_indep_fisher_z.m
│ │ ├── condgaussTrainObserved.m
│ │ ├── condgauss_sample.m
│ │ ├── convertBinaryLabels.m
│ │ ├── cwr_demo.m
│ │ ├── cwr_em.m
│ │ ├── cwr_predict.m
│ │ ├── cwr_prob.m
│ │ ├── cwr_readme.txt
│ │ ├── cwr_test.m
│ │ ├── dirichlet_sample.m
│ │ ├── dirichletpdf.m
│ │ ├── dirichletrnd.m
│ │ ├── distchck.m
│ │ ├── eigdec.m
│ │ ├── est_transmat.m
│ │ ├── fit_paritioned_model_testfn.m
│ │ ├── fit_partitioned_model.m
│ │ ├── gamma_sample.m
│ │ ├── gaussian_prob.m
│ │ ├── gaussian_sample.m
│ │ ├── histCmpChi2.m
│ │ ├── linear_regression.m
│ │ ├── logist2.m
│ │ ├── logist2Apply.m
│ │ ├── logist2ApplyRegularized.m
│ │ ├── logist2Fit.m
│ │ ├── logist2FitRegularized.m
│ │ ├── logistK.m
│ │ ├── logistK_eval.m
│ │ ├── marginalize_gaussian.m
│ │ ├── matrix_T_pdf.m
│ │ ├── matrix_normal_pdf.m
│ │ ├── mc_stat_distrib.m
│ │ ├── mixgauss_Mstep.m
│ │ ├── mixgauss_classifier_apply.m
│ │ ├── mixgauss_classifier_train.m
│ │ ├── mixgauss_em.m
│ │ ├── mixgauss_init.m
│ │ ├── mixgauss_prob.m
│ │ ├── mixgauss_prob_test.m
│ │ ├── mixgauss_sample.m
│ │ ├── mkPolyFvec.m
│ │ ├── mk_unit_norm.m
│ │ ├── multinomial_prob.m
│ │ ├── multinomial_sample.m
│ │ ├── multipdf.m
│ │ ├── multirnd.m
│ │ ├── normal_coef.m
│ │ ├── partial_corr_coef.m
│ │ ├── parzen.m
│ │ ├── parzenC.c
│ │ ├── parzenC.dll
│ │ ├── parzenC.mexglx
│ │ ├── parzenC_test.m
│ │ ├── parzen_fit_select_unif.m
│ │ ├── pca.m
│ │ ├── rndcheck.m
│ │ ├── sample.m
│ │ ├── sample_discrete.m
│ │ ├── sample_gaussian.m
│ │ ├── standardize.m
│ │ ├── student_t_logprob.m
│ │ ├── student_t_prob.m
│ │ ├── test_dir.m
│ │ ├── unidrndKPM.m
│ │ ├── unif_discrete_sample.m
│ │ └── weightedRegression.m
│ ├── KPMtools
│ │ ├── CVS
│ │ │ ├── Entries
│ │ │ ├── Repository
│ │ │ └── Root
│ │ ├── README.txt
│ │ ├── approx_unique.m
│ │ ├── approxeq.m
│ │ ├── argmax.m
│ │ ├── argmin.m
│ │ ├── asdemo.html
│ │ ├── asdemo.m
│ │ ├── asort.m
│ │ ├── assert.m
│ │ ├── assignEdgeNums.m
│ │ ├── assign_cols.m
│ │ ├── axis_pct.m
│ │ ├── bipartiteMatchingDemo.m
│ │ ├── bipartiteMatchingDemoPlot.m
│ │ ├── bipartiteMatchingHungarian.m
│ │ ├── bipartiteMatchingIntProg.m
│ │ ├── block.m
│ │ ├── cell2matPad.m
│ │ ├── cell2num.m
│ │ ├── centeringMatrix.m
│ │ ├── checkpsd.m
│ │ ├── chi2inv.m
│ │ ├── choose.m
│ │ ├── collapse_mog.m
│ │ ├── colmult.c
│ │ ├── colmult.mexglx
│ │ ├── computeROC.m
│ │ ├── compute_counts.m
│ │ ├── conf2mahal.m
│ │ ├── cross_entropy.m
│ │ ├── dirKPM.m
│ │ ├── div.m
│ │ ├── draw_circle.m
│ │ ├── draw_ellipse.m
│ │ ├── draw_ellipse_axes.m
│ │ ├── em_converged.m
│ │ ├── entropy.m
│ │ ├── exportfig.m
│ │ ├── extend_domain_table.m
│ │ ├── factorial.m
│ │ ├── filepartsLast.m
│ │ ├── find_equiv_posns.m
│ │ ├── fullfileKPM.m
│ │ ├── genpathKPM.m
│ │ ├── hash_add.m
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│ │ ├── hash_lookup.m
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│ │ ├── hungarian.m
│ │ ├── image_rgb.m
│ │ ├── imresizeAspect.m
│ │ ├── ind2subv.m
│ │ ├── ind2subvKPM.c
│ │ ├── ind2subvKPM.m
│ │ ├── ind2subvMinka.m
│ │ ├── ind2subvTest.m
│ │ ├── initFigures.m
│ │ ├── installC_KPMtools.m
│ │ ├── is_psd.m
│ │ ├── is_stochastic.m
│ │ ├── isemptycell.m
│ │ ├── isequalKPM.m
│ │ ├── isposdef.m
│ │ ├── isscalar.m
│ │ ├── isvector.m
│ │ ├── junk.c
│ │ ├── loadcell.m
│ │ ├── logb.m
│ │ ├── logdet.m
│ │ ├── logsum.m
│ │ ├── logsum_simple.m
│ │ ├── logsum_test.m
│ │ ├── logsumexp.m
│ │ ├── logsumexpv.m
│ │ ├── mahal2conf.m
│ │ ├── marg_table.m
│ │ ├── marginalize_table.m
│ │ ├── matprint.m
│ │ ├── max_mult.c
│ │ ├── max_mult.m
│ │ ├── mexutil.c
│ │ ├── mexutil.h
│ │ ├── mk_multi_index.m
│ │ ├── mk_stochastic.m
│ │ ├── mkdirKPM.m
│ │ ├── montageKPM.m
│ │ ├── montageKPM2.m
│ │ ├── montageKPM3.m
│ │ ├── mult_by_table.m
│ │ ├── myintersect.m
│ │ ├── myismember.m
│ │ ├── myismember.m~
│ │ ├── myones.m
│ │ ├── myplot.m
│ │ ├── myrand.m
│ │ ├── myrepmat.m
│ │ ├── myreshape.m
│ │ ├── mysetdiff.m
│ │ ├── mysize.m
│ │ ├── mysubset.m
│ │ ├── mysymsetdiff.m
│ │ ├── myunion.m
│ │ ├── nchoose2.m
│ │ ├── ncols.m
│ │ ├── nonmaxsup.m
│ │ ├── normalise.m
│ │ ├── normaliseC.c
│ │ ├── normaliseC.dll
│ │ ├── normalize.m
│ │ ├── nrows.m
│ │ ├── num2strcell.m
│ │ ├── optimalMatching.m
│ │ ├── optimalMatchingTest.m
│ │ ├── partitionData.m
│ │ ├── partition_matrix_vec.m
│ │ ├── pca_kpm.m
│ │ ├── pca_netlab.m
│ │ ├── pick.m
│ │ ├── plotBox.m
│ │ ├── plotColors.m
│ │ ├── plotROC.m
│ │ ├── plotROCkpm.m
│ │ ├── plot_axis_thru_origin.m
│ │ ├── plot_ellipse.m
│ │ ├── plot_matrix.m
│ │ ├── plot_polygon.m
│ │ ├── plotcov2.m
│ │ ├── plotcov2New.m
│ │ ├── plotcov3.m
│ │ ├── plotgauss1d.m
│ │ ├── plotgauss2d.m
│ │ ├── plotgauss2d_old.m
│ │ ├── polygon_area.m
│ │ ├── polygon_centroid.m
│ │ ├── polygon_intersect.m
│ │ ├── previewfig.m
│ │ ├── process_options.m
│ │ ├── rand_psd.m
│ │ ├── rectintC.m
│ │ ├── rectintLoopC.c
│ │ ├── rectintLoopC.dll
│ │ ├── rectintLoopC.mexglx
│ │ ├── rectintSparse.m
│ │ ├── rectintSparseC.m
│ │ ├── rectintSparseLoopC.c
│ │ ├── rectintSparseLoopC.dll
│ │ ├── repmatC.c
│ │ ├── repmatC.dll
│ │ ├── repmatC.mexglx
│ │ ├── rgb2grayKPM.m
│ │ ├── rnd_partition.m
│ │ ├── rotate_xlabel.m
│ │ ├── safeStr.m
│ │ ├── sampleUniformInts.m
│ │ ├── sample_discrete.m
│ │ ├── set_xtick_label.m
│ │ ├── set_xtick_label_demo.m
│ │ ├── setdiag.m
│ │ ├── softeye.m
│ │ ├── sort_evec.m
│ │ ├── splitLongSeqIntoManyShort.m
│ │ ├── sprintf_intvec.m
│ │ ├── sqdist.m
│ │ ├── strmatch_multi.m
│ │ ├── strmatch_substr.m
│ │ ├── strsplit.m
│ │ ├── subplot2.m
│ │ ├── subplot3.m
│ │ ├── subsets.m
│ │ ├── subsets1.m
│ │ ├── subsetsFixedSize.m
│ │ ├── subv2ind.m
│ │ ├── subv2indKPM.c
│ │ ├── subv2indKPM.m
│ │ ├── subv2indMinka.m
│ │ ├── subv2indTest.m
│ │ ├── sumv.m
│ │ ├── suptitle.m
│ │ ├── unaryEncoding.m
│ │ ├── wrap.m
│ │ ├── xticklabel_rotate90.m
│ │ ├── zipload.m
│ │ └── zipsave.m
│ ├── Kalman
│ │ ├── AR_to_SS.m
│ │ ├── CVS
│ │ │ ├── Entries
│ │ │ ├── Repository
│ │ │ └── Root
│ │ ├── README.txt
│ │ ├── SS_to_AR.m
│ │ ├── convert_to_lagged_form.m
│ │ ├── ensure_AR.m
│ │ ├── eval_AR_perf.m
│ │ ├── kalman_filter.m
│ │ ├── kalman_forward_backward.m
│ │ ├── kalman_smoother.m
│ │ ├── kalman_update.m
│ │ ├── learn_AR.m
│ │ ├── learn_AR_diagonal.m
│ │ ├── learn_kalman.m
│ │ ├── learning_demo.m
│ │ ├── sample_lds.m
│ │ ├── smooth_update.m
│ │ ├── testKalman.m
│ │ └── tracking_demo.m
│ ├── foptions.m
│ ├── genpathKPM.m
│ ├── graph
│ │ ├── CVS
│ │ │ ├── Entries
│ │ │ ├── Entries.Log
│ │ │ ├── Repository
│ │ │ └── Root
│ │ ├── Old
│ │ │ ├── CVS
│ │ │ │ ├── Entries
│ │ │ │ ├── Repository
│ │ │ │ └── Root
│ │ │ ├── best_first_elim_order.m
│ │ │ ├── dag_to_jtree.m
│ │ │ ├── dfs.m
│ │ │ ├── dsep_test.m
│ │ │ └── mk_2D_lattice_slow.m
│ │ ├── README.txt
│ │ ├── acyclic.m
│ │ ├── assignEdgeNums.m
│ │ ├── best_first_elim_order.m
│ │ ├── check_jtree_property.m
│ │ ├── check_triangulated.m
│ │ ├── children.m
│ │ ├── cliques_to_jtree.m
│ │ ├── cliques_to_strong_jtree.m
│ │ ├── connected_graph.m
│ │ ├── dag_to_essential_graph.m
│ │ ├── dfs.m
│ │ ├── dfs_test.m
│ │ ├── dijkstra.m
│ │ ├── family.m
│ │ ├── graph_separated.m
│ │ ├── graph_to_jtree.m
│ │ ├── min_subtree_con_nodes.m
│ │ ├── minimum_spanning_tree.m
│ │ ├── minspan.m
│ │ ├── mk_2D_lattice.m
│ │ ├── mk_2D_lattice_slow.m
│ │ ├── mk_adj_mat.m
│ │ ├── mk_adjmat_chain.m
│ │ ├── mk_all_dags.m
│ │ ├── mk_nbrs_of_dag.m
│ │ ├── mk_nbrs_of_digraph.m
│ │ ├── mk_nbrs_of_digraph_broken.m
│ │ ├── mk_nbrs_of_digraph_not_vectorized.m
│ │ ├── mk_rnd_dag.m
│ │ ├── mk_rnd_dag_given_edge_prob.m
│ │ ├── mk_rooted_tree.m
│ │ ├── mk_undirected.m
│ │ ├── moralize.m
│ │ ├── neighbors.m
│ │ ├── parents.m
│ │ ├── pred2path.m
│ │ ├── reachability_graph.m
│ │ ├── scc.m
│ │ ├── strong_elim_order.m
│ │ ├── test.m
│ │ ├── test_strong_root.m
│ │ ├── topological_sort.m
│ │ ├── trees.txt
│ │ ├── triangulate.c
│ │ ├── triangulate.m
│ │ ├── triangulate_2Dlattice_demo.m
│ │ └── triangulate_test.m
│ ├── nethelp3.3
│ │ ├── CVS
│ │ │ ├── Entries
│ │ │ ├── Repository
│ │ │ └── Root
│ │ ├── conffig.htm
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│ │ ├── nethelp3.3.zip
│ │ ├── nethess.htm
│ │ ├── netinit.htm
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│ │ ├── netpak.htm
│ │ ├── netunpak.htm
│ │ ├── olgd.htm
│ │ ├── pca.htm
│ │ ├── plotmat.htm
│ │ ├── ppca.htm
│ │ ├── quasinew.htm
│ │ ├── rbf.htm
│ │ ├── rbfbkp.htm
│ │ ├── rbfderiv.htm
│ │ ├── rbferr.htm
│ │ ├── rbfevfwd.htm
│ │ ├── rbffwd.htm
│ │ ├── rbfgrad.htm
│ │ ├── rbfhess.htm
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│ │ ├── rbfpak.htm
│ │ ├── rbfprior.htm
│ │ ├── rbfsetbf.htm
│ │ ├── rbfsetfw.htm
│ │ ├── rbftrain.htm
│ │ ├── rbfunpak.htm
│ │ ├── rosegrad.htm
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│ │ ├── somfwd.htm
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│ │ └── somunpak.htm
│ ├── netlab3.3
│ │ ├── CVS
│ │ │ ├── Entries
│ │ │ ├── Repository
│ │ │ └── Root
│ │ ├── Contents.m
│ │ ├── LICENSE
│ │ ├── conffig.m
│ │ ├── confmat.m
│ │ ├── conjgrad.m
│ │ ├── consist.m
│ │ ├── convertoldnet.m
│ │ ├── datread.m
│ │ ├── datwrite.m
│ │ ├── dem2ddat.m
│ │ ├── demard.m
│ │ ├── demev1.m
│ │ ├── demev2.m
│ │ ├── demev3.m
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│ │ ├── demgtm1.m
│ │ ├── demgtm2.m
│ │ ├── demhint.m
│ │ ├── demhmc1.m
│ │ ├── demhmc2.m
│ │ ├── demhmc3.m
│ │ ├── demkmn1.m
│ │ ├── demknn1.m
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│ │ ├── demrbf1.m
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│ │ ├── oilTst.dat
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│ │ ├── rbfhess.m
│ │ ├── rbfjacob.m
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│ │ ├── rosen.m
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│ │ └── xor.dat
│ └── netlabKPM
│ ├── CVS
│ │ ├── Entries
│ │ ├── Repository
│ │ └── Root
│ ├── README.txt
│ ├── demgmm1_movie.m
│ ├── evidence_weighted.m
│ ├── glmerr_weighted.m
│ ├── glmgrad_weighted.m
│ ├── glmhess_weighted.m
│ ├── glmtrain_weighted.m
│ ├── gmm1.avi
│ ├── gmmem2.m
│ ├── gmmem_multi_restart.m
│ ├── kmeans_demo.m
│ ├── mlperr_weighted.m
│ ├── mlpgrad_weighted.m
│ ├── mlphdotv_weighted.m
│ ├── mlphess_weighted.m
│ ├── neterr_weighted.m
│ ├── netgrad_weighted.m
│ ├── nethess_weighted.m
│ ├── netopt_weighted.m
│ └── process_options.m
├── How_to_use_the_Bayes_Net_Toolbox.doc
├── 如何使用FULLBNT工具箱.pdf
└── 如何安装贝叶斯.txt
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