matlab 贝叶斯网络工具箱

【实例简介】
matlab官方贝叶斯网络工具箱 具体说明请上官方网站 官方主页：http://www.cs.ubc.ca/~murphyk/Software/BNT/bnt.html 官方下载：http://www.cs.ubc.ca/~murphyk/Software/BNT/FullBNT-1.0.4.zip 原文链接：...
【实例截图】
【核心代码】
文件清单
└── FullBNT-1.0.4
    ├── BNT
    │   ├── @assocarray
    │   │   ├── assocarray.m
    │   │   ├── CVS
    │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   └── Root
    │   │   └── subsref.m
    │   ├── copyright.txt
    │   ├── CPDs
    │   │   ├── @boolean_CPD
    │   │   │   ├── boolean_CPD.m
    │   │   │   └── CVS
    │   │   │       ├── Entries
    │   │   │       ├── Repository
    │   │   │       └── Root
    │   │   ├── CVS
    │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   ├── Entries.Log
    │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   └── Root
    │   │   ├── @deterministic_CPD
    │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   └── deterministic_CPD.m
    │   │   ├── @discrete_CPD
    │   │   │   ├── convert_CPD_to_table_hidden_ps.m
    │   │   │   ├── convert_obs_CPD_to_table.m
    │   │   │   ├── convert_to_pot.m
    │   │   │   ├── convert_to_sparse_table.c
    │   │   │   ├── convert_to_table.m
    │   │   │   ├── CPD_to_lambda_msg.m
    │   │   │   ├── CPD_to_pi.m
    │   │   │   ├── CPD_to_scgpot.m
    │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   ├── Entries.Log
    │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   ├── discrete_CPD.m
    │   │   │   ├── dom_sizes.m
    │   │   │   ├── log_prob_node.m
    │   │   │   ├── Old
    │   │   │   │   ├── convert_to_pot.m
    │   │   │   │   ├── convert_to_table.m
    │   │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   │   ├── prob_CPD.m
    │   │   │   │   └── prob_node.m
    │   │   │   ├── private
    │   │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   │   └── prod_CPT_and_pi_msgs.m
    │   │   │   ├── prob_node.m
    │   │   │   ├── README
    │   │   │   └── sample_node.m
    │   │   ├── @gaussian_CPD
    │   │   │   ├── adjustable_CPD.m
    │   │   │   ├── convert_CPD_to_table_hidden_ps.m
    │   │   │   ├── convert_to_pot.m
    │   │   │   ├── convert_to_table.m
    │   │   │   ├── CPD_to_lambda_msg.m
    │   │   │   ├── CPD_to_pi.m
    │   │   │   ├── CPD_to_scgpot.m
    │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   ├── Entries.Log
    │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   ├── display.m
    │   │   │   ├── gaussian_CPD.m
    │   │   │   ├── gaussian_CPD_params_given_dps.m
    │   │   │   ├── get_field.m
    │   │   │   ├── learn_params.m
    │   │   │   ├── log_prob_node.m
    │   │   │   ├── maximize_params_debug.m
    │   │   │   ├── maximize_params.m
    │   │   │   ├── Old
    │   │   │   │   ├── CPD_to_lambda_msg.m
    │   │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   │   ├── gaussian_CPD.m
    │   │   │   │   ├── log_prob_node.m
    │   │   │   │   ├── maximize_params.m
    │   │   │   │   ├── update_ess.m
    │   │   │   │   └── update_tied_ess.m
    │   │   │   ├── private
    │   │   │   │   ├── CPD_to_linear_gaussian.m
    │   │   │   │   └── CVS
    │   │   │   │       ├── Entries
    │   │   │   │       ├── Repository
    │   │   │   │       └── Root
    │   │   │   ├── reset_ess.m
    │   │   │   ├── sample_node.m
    │   │   │   ├── set_fields.m
    │   │   │   └── update_ess.m
    │   │   ├── @generic_CPD
    │   │   │   ├── adjustable_CPD.m
    │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   ├── Entries.Log
    │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   ├── display.m
    │   │   │   ├── generic_CPD.m
    │   │   │   ├── learn_params.m
    │   │   │   ├── log_prior.m
    │   │   │   ├── Old
    │   │   │   │   ├── BIC_score_CPD.m
    │   │   │   │   ├── CPD_to_dpots.m
    │   │   │   │   └── CVS
    │   │   │   │       ├── Entries
    │   │   │   │       ├── Repository
    │   │   │   │       └── Root
    │   │   │   ├── README
    │   │   │   └── set_clamped.m
    │   │   ├── @gmux_CPD
    │   │   │   ├── convert_to_pot.m
    │   │   │   ├── CPD_to_lambda_msg.m
    │   │   │   ├── CPD_to_pi.m
    │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   ├── Entries.Log
    │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   ├── display.m
    │   │   │   ├── gmux_CPD.m
    │   │   │   ├── Old
    │   │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   │   └── gmux_CPD.m
    │   │   │   └── sample_node.m
    │   │   ├── @hhmm2Q_CPD
    │   │   │   ├── CPD_to_CPT.m
    │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   ├── hhmm2Q_CPD.m
    │   │   │   ├── maximize_params.m
    │   │   │   ├── reset_ess.m
    │   │   │   └── update_ess.m
    │   │   ├── @hhmmF_CPD
    │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   ├── hhmmF_CPD.m
    │   │   │   ├── log_prior.m
    │   │   │   ├── maximize_params.m
    │   │   │   ├── Old
    │   │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   │   ├── hhmmF_CPD.m
    │   │   │   │   ├── log_prior.m
    │   │   │   │   ├── maximize_params.m
    │   │   │   │   ├── reset_ess.m
    │   │   │   │   ├── update_CPT.m
    │   │   │   │   └── update_ess.m
    │   │   │   ├── reset_ess.m
    │   │   │   ├── update_CPT.m
    │   │   │   └── update_ess.m
    │   │   ├── @hhmmQ_CPD
    │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   ├── hhmmQ_CPD.m
    │   │   │   ├── log_prior.m
    │   │   │   ├── maximize_params.m
    │   │   │   ├── Old
    │   │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   │   ├── hhmmQ_CPD.m
    │   │   │   │   ├── log_prior.m
    │   │   │   │   ├── maximize_params.m
    │   │   │   │   ├── reset_ess.m
    │   │   │   │   ├── update_CPT.m
    │   │   │   │   ├── update_ess2.m
    │   │   │   │   ├── update_ess3.m
    │   │   │   │   ├── update_ess4.m
    │   │   │   │   └── update_ess.m
    │   │   │   ├── reset_ess.m
    │   │   │   ├── update_CPT.m
    │   │   │   └── update_ess.m
    │   │   ├── mk_isolated_tabular_CPD.m
    │   │   ├── @mlp_CPD
    │   │   │   ├── convert_to_table.m
    │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   ├── maximize_params.m
    │   │   │   ├── mlp_CPD.m
    │   │   │   ├── reset_ess.m
    │   │   │   └── update_ess.m
    │   │   ├── @noisyor_CPD
    │   │   │   ├── CPD_to_CPT.m
    │   │   │   ├── CPD_to_CPT.m~
    │   │   │   ├── CPD_to_lambda_msg.m
    │   │   │   ├── CPD_to_pi.m
    │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   ├── Entries.Log
    │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   ├── noisyor_CPD.m
    │   │   │   └── private
    │   │   │       ├── CVS
    │   │   │       │   ├── Entries
    │   │   │       │   ├── Repository
    │   │   │       │   └── Root
    │   │   │       └── sum_prod_CPD_and_pi_msgs.m
    │   │   ├── Old
    │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   ├── Entries.Log
    │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   ├── @linear_gaussian_CPD
    │   │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   │   ├── linear_gaussian_CPD.m
    │   │   │   │   ├── log_marg_prob_node.m
    │   │   │   │   └── update_params_complete.m
    │   │   │   ├── @root_gaussian_CPD
    │   │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   │   ├── log_marg_prob_node.m
    │   │   │   │   ├── root_gaussian_CPD.m
    │   │   │   │   └── update_params_complete.m
    │   │   │   └── @tabular_chance_node
    │   │   │       ├── CPD_to_upot.m
    │   │   │       ├── CVS
    │   │   │       │   ├── Entries
    │   │   │       │   ├── Repository
    │   │   │       │   └── Root
    │   │   │       └── tabular_chance_node.m
    │   │   ├── @root_CPD
    │   │   │   ├── convert_to_pot.m
    │   │   │   ├── CPD_to_pi.m
    │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   ├── Entries.Log
    │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   ├── log_marg_prob_node.m
    │   │   │   ├── log_prob_node.m
    │   │   │   ├── Old
    │   │   │   │   ├── CPD_to_CPT.m
    │   │   │   │   └── CVS
    │   │   │   │       ├── Entries
    │   │   │   │       ├── Repository
    │   │   │   │       └── Root
    │   │   │   ├── root_CPD.m
    │   │   │   └── sample_node.m
    │   │   ├── @softmax_CPD
    │   │   │   ├── convert_to_pot.m
    │   │   │   ├── convert_to_table.m
    │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   ├── Entries.Log
    │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   ├── display.m
    │   │   │   ├── get_field.m
    │   │   │   ├── maximize_params.m
    │   │   │   ├── private
    │   │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   │   └── extract_params.m
    │   │   │   ├── reset_ess.m
    │   │   │   ├── sample_node.m
    │   │   │   ├── set_fields.m
    │   │   │   ├── softmax_CPD.m
    │   │   │   └── update_ess.m
    │   │   ├── @tabular_CPD
    │   │   │   ├── bayes_update_params.m
    │   │   │   ├── CPD_to_CPT.m
    │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   ├── Entries.Log
    │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   ├── display.m
    │   │   │   ├── get_field.m
    │   │   │   ├── learn_params.m
    │   │   │   ├── log_marg_prob_node.m
    │   │   │   ├── log_nextcase_prob_node.m
    │   │   │   ├── log_prior.m
    │   │   │   ├── maximize_params.m
    │   │   │   ├── Old
    │   │   │   │   ├── bayesian_score_CPD.m
    │   │   │   │   ├── BIC_score_CPD.m
    │   │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   │   ├── log_marg_prob_node_case.m
    │   │   │   │   ├── mult_CPD_and_pi_msgs.m
    │   │   │   │   ├── prob_CPT.m
    │   │   │   │   ├── prob_node.m
    │   │   │   │   ├── sample_node.m
    │   │   │   │   ├── sample_node_single_case.m
    │   │   │   │   ├── tabular_CPD.m
    │   │   │   │   └── update_params.m
    │   │   │   ├── reset_ess.m
    │   │   │   ├── set_fields.m
    │   │   │   ├── tabular_CPD.m
    │   │   │   ├── update_ess.m
    │   │   │   └── update_ess_simple.m
    │   │   ├── @tabular_decision_node
    │   │   │   ├── CPD_to_CPT.m
    │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   ├── Entries.Log
    │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   ├── display.m
    │   │   │   ├── get_field.m
    │   │   │   ├── Old
    │   │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   │   └── tabular_decision_node.m
    │   │   │   ├── set_fields.m
    │   │   │   └── tabular_decision_node.m
    │   │   ├── @tabular_kernel
    │   │   │   ├── convert_to_pot.m
    │   │   │   ├── convert_to_table.m
    │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   ├── Entries.Log
    │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   ├── get_field.m
    │   │   │   ├── Old
    │   │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   │   └── tabular_kernel.m
    │   │   │   ├── set_fields.m
    │   │   │   └── tabular_kernel.m
    │   │   ├── @tabular_utility_node
    │   │   │   ├── convert_to_pot.m
    │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   ├── display.m
    │   │   │   └── tabular_utility_node.m
    │   │   └── @tree_CPD
    │   │       ├── CVS
    │   │       │   ├── Entries
    │   │       │   ├── Repository
    │   │       │   └── Root
    │   │       ├── display.m
    │   │       ├── evaluate_tree_performance.m
    │   │       ├── get_field.m
    │   │       ├── learn_params.m
    │   │       ├── readme.txt
    │   │       ├── set_fields.m
    │   │       └── tree_CPD.m
    │   ├── CVS
    │   │   ├── Entries
    │   │   ├── Entries.Log
    │   │   ├── Repository
    │   │   └── Root
    │   ├── examples
    │   │   ├── CVS
    │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   └── Root
    │   │   ├── dummy
    │   │   ├── dynamic
    │   │   │   ├── arhmm1.m
    │   │   │   ├── bat1.m
    │   │   │   ├── bkff1.m
    │   │   │   ├── chmm1.m
    │   │   │   ├── cmp_inference_dbn.m
    │   │   │   ├── cmp_learning_dbn.m
    │   │   │   ├── cmp_online_inference.m
    │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   ├── Entries.Log
    │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   ├── dhmm1.m
    │   │   │   ├── ehmm1.m
    │   │   │   ├── fhmm_infer.m
    │   │   │   ├── filter_test1.m
    │   │   │   ├── ghmm1.m
    │   │   │   ├── HHMM
    │   │   │   │   ├── abcd_hhmm.m
    │   │   │   │   ├── add_hhmm_end_state.m
    │   │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   │   ├── Entries.Log
    │   │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   │   ├── hhmm_jtree_clqs.m
    │   │   │   │   ├── Map
    │   │   │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   │   │   ├── disp_map_hhmm.m
    │   │   │   │   │   ├── learn_map.m
    │   │   │   │   │   ├── mk_map_hhmm.m
    │   │   │   │   │   ├── mk_rnd_map_hhmm.m
    │   │   │   │   │   ├── Old
    │   │   │   │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   │   │   │   └── mk_map_hhmm.m
    │   │   │   │   │   └── sample_from_map.m
    │   │   │   │   ├── Mgram
    │   │   │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   │   │   ├── letter2num.m
    │   │   │   │   │   ├── mgram1.m
    │   │   │   │   │   ├── mgram2.m
    │   │   │   │   │   ├── mgram3.m
    │   │   │   │   │   ├── num2letter.m
    │   │   │   │   │   └── Old
    │   │   │   │   │       ├── CVS
    │   │   │   │   │       │   ├── Entries
    │   │   │   │   │       │   ├── Repository
    │   │   │   │   │       │   └── Root
    │   │   │   │   │       └── mgram2.m
    │   │   │   │   ├── mk_hhmm.m
    │   │   │   │   ├── mk_hhmm_topo_F1.m
    │   │   │   │   ├── mk_hhmm_topo.m
    │   │   │   │   ├── Motif
    │   │   │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   │   │   ├── fixed_args_mk_motif_hhmm.m
    │   │   │   │   │   ├── learn_motif_hhmm.m
    │   │   │   │   │   ├── mk_motif_hhmm.m
    │   │   │   │   │   └── sample_motif_hhmm.m
    │   │   │   │   ├── Old
    │   │   │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   │   │   ├── mk_abcd_hhmm.m
    │   │   │   │   │   ├── mk_arrow_alpha_hhmm3.m
    │   │   │   │   │   ├── mk_hhmm2.m
    │   │   │   │   │   ├── mk_hhmm3_args.m
    │   │   │   │   │   ├── mk_hhmm3.m
    │   │   │   │   │   ├── motif_hhmm.m
    │   │   │   │   │   └── remove_hhmm_end_state.m
    │   │   │   │   ├── pretty_print_hhmm_parse.m
    │   │   │   │   ├── remove_hhmm_end_state.m
    │   │   │   │   └── Square
    │   │   │   │       ├── CVS
    │   │   │   │       │   ├── Entries
    │   │   │   │       │   ├── Repository
    │   │   │   │       │   └── Root
    │   │   │   │       ├── get_square_data.m
    │   │   │   │       ├── hhmm_inference.m
    │   │   │   │       ├── is_F2_true_D3.m
    │   │   │   │       ├── learn_square_hhmm_cts.m
    │   │   │   │       ├── learn_square_hhmm_discrete.m
    │   │   │   │       ├── mk_square_hhmm.m
    │   │   │   │       ├── Old
    │   │   │   │       │   ├── CVS
    │   │   │   │       │   │   ├── Entries
    │   │   │   │       │   │   ├── Repository
    │   │   │   │       │   │   └── Root
    │   │   │   │       │   ├── learn_square_hhmm.m
    │   │   │   │       │   ├── mk_square_hhmm.m
    │   │   │   │       │   ├── plot_square_hhmm.m
    │   │   │   │       │   └── sample_square_hhmm.m
    │   │   │   │       ├── plot_square_hhmm.m
    │   │   │   │       ├── sample_square_hhmm_cts.m
    │   │   │   │       ├── sample_square_hhmm_discrete.m
    │   │   │   │       ├── square4_cases.mat
    │   │   │   │       ├── square4.mat
    │   │   │   │       ├── test_square_fig.m
    │   │   │   │       └── test_square_fig.mat
    │   │   │   ├── ho1.m
    │   │   │   ├── jtree_clq_test2.m
    │   │   │   ├── jtree_clq_test.m
    │   │   │   ├── kalman1.m
    │   │   │   ├── kjaerulff1.m
    │   │   │   ├── loopy_dbn1.m
    │   │   │   ├── mhmm1.m
    │   │   │   ├── mildew1.m
    │   │   │   ├── mk_bat_dbn.m
    │   │   │   ├── mk_chmm.m
    │   │   │   ├── mk_collage_from_clqs.m
    │   │   │   ├── mk_fhmm.m
    │   │   │   ├── mk_mildew_dbn.m
    │   │   │   ├── mk_orig_bat_dbn.m
    │   │   │   ├── mk_orig_water_dbn.m
    │   │   │   ├── mk_ps_from_clqs.m
    │   │   │   ├── mk_uffe_dbn.m
    │   │   │   ├── mk_water_dbn.m
    │   │   │   ├── Old
    │   │   │   │   ├── chmm1.m
    │   │   │   │   ├── cmp_inference.m
    │   │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   │   ├── kalman1.m
    │   │   │   │   ├── old.water1.m
    │   │   │   │   ├── online1.m
    │   │   │   │   ├── online2.m
    │   │   │   │   └── scg_dbn.m
    │   │   │   ├── orig_water1.m
    │   │   │   ├── reveal1.m
    │   │   │   ├── scg_dbn.m
    │   │   │   ├── skf_data_assoc_gmux.m
    │   │   │   ├── SLAM
    │   │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   │   ├── mk_gmux_robot_dbn.m
    │   │   │   │   ├── mk_linear_slam.m
    │   │   │   │   ├── Old
    │   │   │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   │   │   ├── offline_loopy_slam.m
    │   │   │   │   │   ├── paskin1.m
    │   │   │   │   │   ├── skf_data_assoc_gmux2.m
    │   │   │   │   │   └── slam_kf.m
    │   │   │   │   ├── slam_kf.m
    │   │   │   │   ├── slam_offline_loopy.m
    │   │   │   │   ├── slam_partial_kf.m
    │   │   │   │   └── slam_stationary_loopy.m
    │   │   │   ├── viterbi1.m
    │   │   │   ├── water1.m
    │   │   │   └── water2.m
    │   │   ├── limids
    │   │   │   ├── amnio.m
    │   │   │   ├── asia_dt1.m
    │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   ├── id1.m
    │   │   │   ├── oil1.m
    │   │   │   └── pigs1.m
    │   │   └── static
    │   │       ├── Belprop
    │   │       │   ├── belprop_loop1_discrete.m
    │   │       │   ├── belprop_loop1_gauss.m
    │   │       │   ├── belprop_loopy_cg.m
    │   │       │   ├── belprop_loopy_discrete.m
    │   │       │   ├── belprop_loopy_gauss.m
    │   │       │   ├── belprop_polytree_cg.m
    │   │       │   ├── belprop_polytree_discrete.m
    │   │       │   ├── belprop_polytree_gauss.m
    │   │       │   ├── bp1.m
    │   │       │   ├── CVS
    │   │       │   │   ├── Entries
    │   │       │   │   ├── Repository
    │   │       │   │   └── Root
    │   │       │   └── gmux1.m
    │   │       ├── brainy.m
    │   │       ├── Brutti
    │   │       │   ├── Belief_hmdt.m
    │   │       │   ├── Belief_hme.m
    │   │       │   ├── Belief_IOhmm.m
    │   │       │   ├── CVS
    │   │       │   │   ├── Entries
    │   │       │   │   ├── Repository
    │   │       │   │   └── Root
    │   │       │   └── Sigmoid_Belief.m
    │   │       ├── burglar-alarm-net.lisp.txt
    │   │       ├── burglary.m
    │   │       ├── cg1.m
    │   │       ├── cg2.m
    │   │       ├── cmp_inference_static.m
    │   │       ├── CVS
    │   │       │   ├── Entries
    │   │       │   ├── Entries.Log
    │   │       │   ├── Repository
    │   │       │   └── Root
    │   │       ├── discrete1.m
    │   │       ├── discrete2.m
    │   │       ├── discrete3.m
    │   │       ├── dtree
    │   │       │   ├── CVS
    │   │       │   │   ├── Entries
    │   │       │   │   ├── Repository
    │   │       │   │   └── Root
    │   │       │   ├── test_housing.m
    │   │       │   ├── test_restaurants.m
    │   │       │   ├── test_zoo1.m
    │   │       │   ├── tmp.dot
    │   │       │   └── transform_data_into_bnt_format.m
    │   │       ├── fa1.m
    │   │       ├── fgraph
    │   │       │   ├── CVS
    │   │       │   │   ├── Entries
    │   │       │   │   ├── Repository
    │   │       │   │   └── Root
    │   │       │   ├── fg1.m
    │   │       │   ├── fg2.m
    │   │       │   ├── fg3.m
    │   │       │   ├── fg_mrf1.m
    │   │       │   └── fg_mrf2.m
    │   │       ├── gaussian1.m
    │   │       ├── gaussian2.m
    │   │       ├── gibbs_test1.m
    │   │       ├── HME
    │   │       │   ├── CVS
    │   │       │   │   ├── Entries
    │   │       │   │   ├── Repository
    │   │       │   │   └── Root
    │   │       │   ├── fhme.m
    │   │       │   ├── gen_data.m
    │   │       │   ├── hme_class_plot.m
    │   │       │   ├── HMEforMatlab.jpg
    │   │       │   ├── hmemenu.m
    │   │       │   ├── hme_reg_plot.m
    │   │       │   ├── hme_topobuilder.m
    │   │       │   ├── README
    │   │       │   ├── test_data_class2.mat
    │   │       │   ├── test_data_class.mat
    │   │       │   ├── test_data_reg.mat
    │   │       │   ├── train_data_class.mat
    │   │       │   └── train_data_reg.mat
    │   │       ├── learn1.m
    │   │       ├── lw1.m
    │   │       ├── mfa1.m
    │   │       ├── Misc
    │   │       │   ├── CVS
    │   │       │   │   ├── Entries
    │   │       │   │   ├── Repository
    │   │       │   │   └── Root
    │   │       │   ├── mixexp_data.txt
    │   │       │   ├── mixexp_graddesc.m
    │   │       │   ├── mixexp_plot.m
    │   │       │   └── sprinkler.bif
    │   │       ├── mixexp1.m
    │   │       ├── mixexp2.m
    │   │       ├── mixexp3.m
    │   │       ├── Models
    │   │       │   ├── CVS
    │   │       │   │   ├── Entries
    │   │       │   │   ├── Repository
    │   │       │   │   └── Root
    │   │       │   ├── mk_alarm_bnet.m
    │   │       │   ├── mk_asia_bnet.m
    │   │       │   ├── mk_cancer_bnet.m
    │   │       │   ├── mk_car_bnet.m
    │   │       │   ├── mk_hmm_bnet.m
    │   │       │   ├── mk_ideker_bnet.m
    │   │       │   ├── mk_incinerator_bnet.m
    │   │       │   ├── mk_markov_chain_bnet.m
    │   │       │   ├── mk_minimal_qmr_bnet.m
    │   │       │   ├── mk_qmr_bnet.m
    │   │       │   ├── mk_vstruct_bnet.m
    │   │       │   └── Old
    │   │       │       ├── CVS
    │   │       │       │   ├── Entries
    │   │       │       │   ├── Repository
    │   │       │       │   └── Root
    │   │       │       └── mk_hmm_bnet.m
    │   │       ├── mog1.m
    │   │       ├── mpe1.m
    │   │       ├── mpe2.m
    │   │       ├── nodeorderExample.m
    │   │       ├── qmr1.m
    │   │       ├── qmr2.m
    │   │       ├── sample1.m
    │   │       ├── SCG
    │   │       │   ├── CVS
    │   │       │   │   ├── Entries
    │   │       │   │   ├── Repository
    │   │       │   │   └── Root
    │   │       │   ├── scg1.m
    │   │       │   ├── scg2.m
    │   │       │   ├── scg3.m
    │   │       │   ├── scg_3node.m
    │   │       │   └── scg_unstable.m
    │   │       ├── softev1.m
    │   │       ├── softmax1.m
    │   │       ├── sprinkler1.m
    │   │       ├── StructLearn
    │   │       │   ├── bic1.m
    │   │       │   ├── cooper_yoo.m
    │   │       │   ├── CVS
    │   │       │   │   ├── Entries
    │   │       │   │   ├── Repository
    │   │       │   │   └── Root
    │   │       │   ├── k2demo1.m
    │   │       │   ├── mcmc1.m
    │   │       │   ├── model_select1.m
    │   │       │   ├── model_select2.m
    │   │       │   ├── pc1.m
    │   │       │   └── pc2.m
    │   │       └── Zoubin
    │   │           ├── csum.m
    │   │           ├── CVS
    │   │           │   ├── Entries
    │   │           │   ├── Repository
    │   │           │   └── Root
    │   │           ├── ffa.m
    │   │           ├── mfa_cl.m
    │   │           ├── mfademo.m
    │   │           ├── mfa.m
    │   │           ├── rdiv.m
    │   │           ├── README
    │   │           ├── rprod.m
    │   │           └── rsum.m
    │   ├── general
    │   │   ├── add_evidence_to_gmarginal.m
    │   │   ├── add_ev_to_dmarginal.m
    │   │   ├── bnet_to_fgraph.m
    │   │   ├── compute_fwd_interface.m
    │   │   ├── compute_interface_nodes.m
    │   │   ├── compute_joint_pot.m
    │   │   ├── compute_minimal_interface.m
    │   │   ├── convert_dbn_CPDs_to_pots.m
    │   │   ├── convert_dbn_CPDs_to_tables1.m
    │   │   ├── convert_dbn_CPDs_to_tables.m
    │   │   ├── convert_dbn_CPDs_to_tables_slow.m
    │   │   ├── CVS
    │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   ├── Entries.Log
    │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   └── Root
    │   │   ├── dbn_to_bnet.m
    │   │   ├── dbn_to_hmm.m
    │   │   ├── determine_elim_constraints.m
    │   │   ├── dispcpt.m
    │   │   ├── do_intervention.m
    │   │   ├── dsep.m
    │   │   ├── dsep_test.m
    │   │   ├── enumerate_scenarios.m
    │   │   ├── fgraph_to_bnet.m
    │   │   ├── hodbn_to_bnet.m
    │   │   ├── is_mnet.m
    │   │   ├── linear_gaussian_to_cpot.m
    │   │   ├── log_lik_complete.m
    │   │   ├── log_marg_lik_complete.m
    │   │   ├── mk_bnet.m
    │   │   ├── mk_dbn.m
    │   │   ├── mk_fgraph_given_ev.m
    │   │   ├── mk_fgraph.m
    │   │   ├── mk_higher_order_dbn.m
    │   │   ├── mk_limid.m
    │   │   ├── mk_mnet.m
    │   │   ├── mk_mrf2.m
    │   │   ├── mk_mutilated_samples.m
    │   │   ├── mk_named_CPT.m
    │   │   ├── mk_slice_and_half_dbn.m
    │   │   ├── noisyORtoTable.m
    │   │   ├── Old
    │   │   │   ├── bnet_to_gdl_graph.m
    │   │   │   ├── calc_mpe_bucket.m
    │   │   │   ├── calc_mpe_dbn.m
    │   │   │   ├── calc_mpe_given_inf_engine.m
    │   │   │   ├── calc_mpe_global.m
    │   │   │   ├── calc_mpe.m
    │   │   │   ├── compute_interface_nodes.m
    │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   └── mk_gdl_graph.m
    │   │   ├── partition_dbn_nodes.m
    │   │   ├── partition_matrix_vec_3.m
    │   │   ├── sample_bnet.m
    │   │   ├── sample_bnet_nocell.m
    │   │   ├── sample_dbn.m
    │   │   ├── score_bnet_complete.m
    │   │   ├── shrink_obs_dims_in_gaussian.m
    │   │   ├── shrink_obs_dims_in_table.m
    │   │   ├── solve_limid.m
    │   │   ├── unroll_dbn_topology.m
    │   │   ├── unroll_higher_order_topology.m
    │   │   └── unroll_set.m
    │   ├── inference
    │   │   ├── CVS
    │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   ├── Entries.Log
    │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   └── Root
    │   │   ├── dummy
    │   │   ├── dynamic
    │   │   │   ├── @bk_ff_hmm_inf_engine
    │   │   │   │   ├── bk_ff_hmm_inf_engine.m
    │   │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   │   ├── Entries.Log
    │   │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   │   ├── dbn_init_bel.m
    │   │   │   │   ├── dbn_marginal_from_bel.m
    │   │   │   │   ├── dbn_predict_bel.m
    │   │   │   │   ├── dbn_update_bel1.m
    │   │   │   │   ├── dbn_update_bel.m
    │   │   │   │   ├── enter_evidence.m
    │   │   │   │   ├── marginal_family.m
    │   │   │   │   ├── marginal_nodes.m
    │   │   │   │   └── private
    │   │   │   │       ├── bk_ff_fb.m
    │   │   │   │       ├── combine_marginals_into_joint.m
    │   │   │   │       ├── CVS
    │   │   │   │       │   ├── Entries
    │   │   │   │       │   ├── Repository
    │   │   │   │       │   └── Root
    │   │   │   │       ├── dbn_to_hmm.m
    │   │   │   │       ├── mk_hmm_obs_lik_mat.m
    │   │   │   │       ├── mk_hmm_obs_lik_vec1.m
    │   │   │   │       ├── mk_hmm_obs_lik_vec.m
    │   │   │   │       └── project_joint_onto_marginals.m
    │   │   │   ├── @bk_inf_engine
    │   │   │   │   ├── bk_inf_engine.m
    │   │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   │   ├── dbn_init_bel.m
    │   │   │   │   ├── dbn_marginal_from_bel.m
    │   │   │   │   ├── dbn_update_bel1.m
    │   │   │   │   ├── dbn_update_bel.m
    │   │   │   │   ├── enter_evidence.m
    │   │   │   │   ├── enter_soft_evidence.m
    │   │   │   │   ├── marginal_family.m
    │   │   │   │   ├── marginal_nodes.m
    │   │   │   │   └── update_engine.m
    │   │   │   ├── @cbk_inf_engine
    │   │   │   │   ├── cbk_inf_engine.m
    │   │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   │   ├── dbn_init_bel.m
    │   │   │   │   ├── dbn_marginal_from_bel.m
    │   │   │   │   ├── dbn_update_bel1.m
    │   │   │   │   ├── dbn_update_bel.m
    │   │   │   │   ├── enter_evidence.m
    │   │   │   │   ├── enter_soft_evidence.m
    │   │   │   │   ├── junk
    │   │   │   │   ├── marginal_family.m
    │   │   │   │   ├── marginal_nodes.m
    │   │   │   │   └── update_engine.m
    │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   ├── Entries.Log
    │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   ├── dummy
    │   │   │   ├── @ff_inf_engine
    │   │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   │   ├── enter_evidence.m
    │   │   │   │   ├── enter_soft_evidence.m
    │   │   │   │   ├── ff_inf_engine.m
    │   │   │   │   ├── filter_evidence.m
    │   │   │   │   ├── marginal_family.m
    │   │   │   │   ├── marginal_nodes.m
    │   │   │   │   ├── Old
    │   │   │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   │   │   ├── enter_soft_evidence1.m
    │   │   │   │   │   ├── enter_soft_evidence.m
    │   │   │   │   │   └── marginal_family.m
    │   │   │   │   └── smooth_evidence.m
    │   │   │   ├── @frontier_inf_engine
    │   │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   │   ├── enter_evidence.m
    │   │   │   │   ├── enter_soft_evidence.m
    │   │   │   │   ├── frontier_inf_engine.m
    │   │   │   │   ├── marginal_family.m
    │   │   │   │   ├── marginal_nodes.m
    │   │   │   │   └── set_fwdback.m
    │   │   │   ├── @hmm_inf_engine
    │   │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   │   ├── enter_evidence.m
    │   │   │   │   ├── find_mpe.m
    │   │   │   │   ├── fwdback_twoslice.m
    │   │   │   │   ├── hmm_inf_engine.m
    │   │   │   │   ├── marginal_family.m
    │   │   │   │   ├── marginal_nodes.m
    │   │   │   │   ├── Old
    │   │   │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   │   │   ├── dhmm_inf_engine.m
    │   │   │   │   │   ├── marginal_family.m
    │   │   │   │   │   └── marginal_nodes.m
    │   │   │   │   ├── private
    │   │   │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   │   │   ├── mk_hmm_obs_lik_matrix.m
    │   │   │   │   │   └── mk_hmm_obs_lik_vec.m
    │   │   │   │   └── update_engine.m
    │   │   │   ├── @jtree_dbn_inf_engine
    │   │   │   │   ├── Broken
    │   │   │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   │   │   ├── enter_soft_evidence1.m
    │   │   │   │   │   ├── enter_soft_evidence2.m
    │   │   │   │   │   ├── enter_soft_evidence3.m
    │   │   │   │   │   ├── enter_soft_evidence4.m
    │   │   │   │   │   └── marginal_nodes.m
    │   │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   │   ├── Entries.Log
    │   │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   │   ├── enter_evidence.m
    │   │   │   │   ├── enter_soft_evidence.m
    │   │   │   │   ├── jtree_dbn_inf_engine.m
    │   │   │   │   ├── marginal_family.m
    │   │   │   │   ├── marginal_nodes.m
    │   │   │   │   └── Old
    │   │   │   │       ├── CVS
    │   │   │   │       │   ├── Entries
    │   │   │   │       │   ├── Repository
    │   │   │   │       │   └── Root
    │   │   │   │       ├── enter_soft_evidence_nonint.m
    │   │   │   │       ├── enter_soft_evidence_trans.m
    │   │   │   │       ├── jtree_dbn_inf_engine1.m
    │   │   │   │       ├── jtree_dbn_inf_engine2.m
    │   │   │   │       └── jtree_dbn_inf_engine.m
    │   │   │   ├── @jtree_unrolled_dbn_inf_engine
    │   │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   │   ├── enter_evidence.m
    │   │   │   │   ├── jtree_unrolled_dbn_inf_engine.m
    │   │   │   │   ├── marginal_family.m
    │   │   │   │   ├── marginal_nodes.m
    │   │   │   │   ├── Old
    │   │   │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   │   │   ├── marginal_family.m
    │   │   │   │   │   └── marginal_nodes.m
    │   │   │   │   └── update_engine.m
    │   │   │   ├── @kalman_inf_engine
    │   │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   │   ├── enter_evidence.m
    │   │   │   │   ├── kalman_inf_engine.m
    │   │   │   │   ├── marginal_nodes.m
    │   │   │   │   ├── private
    │   │   │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   │   │   ├── dbn_to_lds.m
    │   │   │   │   │   └── extract_params_from_gbn.m
    │   │   │   │   └── update_engine.m
    │   │   │   ├── @pearl_dbn_inf_engine
    │   │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   │   ├── enter_evidence.m
    │   │   │   │   ├── enter_soft_ev.m
    │   │   │   │   ├── marginal_nodes.m
    │   │   │   │   ├── Old
    │   │   │   │   │   ├── correct_smooth.m
    │   │   │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   │   │   ├── enter_evidence.m
    │   │   │   │   │   ├── filter_evidence.m
    │   │   │   │   │   ├── filter_evidence_obj_oriented.m
    │   │   │   │   │   ├── smooth_evidence_fast.m
    │   │   │   │   │   ├── smooth_evidence.m
    │   │   │   │   │   └── wrong_smooth.m
    │   │   │   │   ├── pearl_dbn_inf_engine.m
    │   │   │   │   └── private
    │   │   │   │       ├── CVS
    │   │   │   │       │   ├── Entries
    │   │   │   │       │   ├── Repository
    │   │   │   │       │   └── Root
    │   │   │   │       └── init_pearl_dbn_ev_msgs.m
    │   │   │   ├── @pearl_unrolled_dbn_inf_engine
    │   │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   │   ├── enter_evidence.m
    │   │   │   │   ├── marginal_family.m
    │   │   │   │   ├── marginal_nodes.m
    │   │   │   │   ├── pearl_unrolled_dbn_inf_engine.m
    │   │   │   │   └── update_engine.m
    │   │   │   └── @stable_ho_inf_engine
    │   │   │       ├── CVS
    │   │   │       │   ├── Entries
    │   │   │       │   ├── Repository
    │   │   │       │   └── Root
    │   │   │       ├── enter_evidence.m
    │   │   │       ├── marginal_family.m
    │   │   │       ├── marginal_nodes.m
    │   │   │       ├── stable_ho_inf_engine.m
    │   │   │       ├── test_ho_inf_enginge.m
    │   │   │       └── update_engine.m
    │   │   ├── @inf_engine
    │   │   │   ├── bnet_from_engine.m
    │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   ├── Entries.Log
    │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   ├── get_field.m
    │   │   │   ├── inf_engine.m
    │   │   │   ├── marginal_family.m
    │   │   │   ├── Old
    │   │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   │   ├── marginal_family_pot.m
    │   │   │   │   └── observed_nodes.m
    │   │   │   ├── set_fields.m
    │   │   │   └── update_engine.m
    │   │   ├── online
    │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   ├── Entries.Log
    │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   ├── dummy
    │   │   │   ├── @filter_engine
    │   │   │   │   ├── bnet_from_engine.m
    │   │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   │   ├── enter_evidence.m
    │   │   │   │   ├── filter_engine.m
    │   │   │   │   ├── marginal_family.m
    │   │   │   │   └── marginal_nodes.m
    │   │   │   ├── @hmm_2TBN_inf_engine
    │   │   │   │   ├── back.m
    │   │   │   │   ├── backT.m
    │   │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   │   ├── Entries.Log
    │   │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   │   ├── fwd1.m
    │   │   │   │   ├── fwd.m
    │   │   │   │   ├── hmm_2TBN_inf_engine.m
    │   │   │   │   ├── marginal_family.m
    │   │   │   │   ├── marginal_nodes.m
    │   │   │   │   ├── private
    │   │   │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   │   │   └── mk_hmm_obs_lik_vec.m
    │   │   │   │   └── update_engine.m
    │   │   │   ├── @jtree_2TBN_inf_engine
    │   │   │   │   ├── back1.m
    │   │   │   │   ├── back1_mpe.m
    │   │   │   │   ├── back.m
    │   │   │   │   ├── back_mpe.m
    │   │   │   │   ├── backT.m
    │   │   │   │   ├── backT_mpe.m
    │   │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   │   ├── Entries.Log
    │   │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   │   ├── fwd1.m
    │   │   │   │   ├── fwd.m
    │   │   │   │   ├── jtree_2TBN_inf_engine.m
    │   │   │   │   ├── marginal_family.m
    │   │   │   │   ├── marginal_nodes.m
    │   │   │   │   ├── Old
    │   │   │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   │   │   └── jtree_2TBN_inf_engine.m
    │   │   │   │   └── set_fields.m
    │   │   │   ├── @jtree_sparse_2TBN_inf_engine
    │   │   │   │   ├── back1.m
    │   │   │   │   ├── back.m
    │   │   │   │   ├── backT.m
    │   │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   │   ├── enter_evidence.m
    │   │   │   │   ├── fwd1.m
    │   │   │   │   ├── fwd.m
    │   │   │   │   ├── jtree_sparse_2TBN_inf_engine.m
    │   │   │   │   ├── marginal_family.m
    │   │   │   │   └── marginal_nodes.m
    │   │   │   └── @smoother_engine
    │   │   │       ├── bnet_from_engine.m
    │   │   │       ├── CVS
    │   │   │       │   ├── Entries
    │   │   │       │   ├── Repository
    │   │   │       │   └── Root
    │   │   │       ├── enter_evidence.m
    │   │   │       ├── find_mpe.m
    │   │   │       ├── marginal_family.m
    │   │   │       ├── marginal_nodes.m
    │   │   │       ├── smoother_engine.m
    │   │   │       └── update_engine.m
    │   │   └── static
    │   │       ├── @belprop_fg_inf_engine
    │   │       │   ├── belprop_fg_inf_engine.m
    │   │       │   ├── CVS
    │   │       │   │   ├── Entries
    │   │       │   │   ├── Repository
    │   │       │   │   └── Root
    │   │       │   ├── enter_evidence.m
    │   │       │   ├── find_mpe.m
    │   │       │   ├── loopy_converged.m
    │   │       │   ├── marginal_nodes.m
    │   │       │   └── set_params.m
    │   │       ├── @belprop_inf_engine
    │   │       │   ├── belprop_inf_engine.m
    │   │       │   ├── CVS
    │   │       │   │   ├── Entries
    │   │       │   │   ├── Entries.Log
    │   │       │   │   ├── Repository
    │   │       │   │   └── Root
    │   │       │   ├── enter_evidence.m
    │   │       │   ├── find_mpe.m
    │   │       │   ├── loopy_converged.m
    │   │       │   ├── marginal_family.m
    │   │       │   ├── marginal_nodes.m
    │   │       │   ├── Old
    │   │       │   │   ├── belprop_gdl_inf_engine.m
    │   │       │   │   ├── belprop_inf_engine_nostr.m
    │   │       │   │   ├── CVS
    │   │       │   │   │   ├── Entries
    │   │       │   │   │   ├── Repository
    │   │       │   │   │   └── Root
    │   │       │   │   ├── enter_evidence1.m
    │   │       │   │   ├── enter_evidence.m
    │   │       │   │   └── marginal_domain.m
    │   │       │   └── private
    │   │       │       ├── CVS
    │   │       │       │   ├── Entries
    │   │       │       │   ├── Repository
    │   │       │       │   └── Root
    │   │       │       ├── junk
    │   │       │       ├── parallel_protocol.m
    │   │       │       └── tree_protocol.m
    │   │       ├── @belprop_mrf2_inf_engine
    │   │       │   ├── belprop_mrf2_inf_engine.m
    │   │       │   ├── bp_mrf2.m
    │   │       │   ├── CVS
    │   │       │   │   ├── Entries
    │   │       │   │   ├── Repository
    │   │       │   │   └── Root
    │   │       │   ├── enter_soft_evidence.m
    │   │       │   ├── find_mpe.m
    │   │       │   ├── marginal_nodes.m
    │   │       │   └── set_params.m
    │   │       ├── @cond_gauss_inf_engine
    │   │       │   ├── cond_gauss_inf_engine.m
    │   │       │   ├── CVS
    │   │       │   │   ├── Entries
    │   │       │   │   ├── Repository
    │   │       │   │   └── Root
    │   │       │   ├── enter_evidence.m
    │   │       │   └── marginal_nodes.m
    │   │       ├── CVS
    │   │       │   ├── Entries
    │   │       │   ├── Entries.Log
    │   │       │   ├── Repository
    │   │       │   └── Root
    │   │       ├── dummy
    │   │       ├── @enumerative_inf_engine
    │   │       │   ├── CVS
    │   │       │   │   ├── Entries
    │   │       │   │   ├── Repository
    │   │       │   │   └── Root
    │   │       │   ├── enter_evidence.m
    │   │       │   ├── enumerative_inf_engine.m
    │   │       │   └── marginal_nodes.m
    │   │       ├── @gaussian_inf_engine
    │   │       │   ├── CVS
    │   │       │   │   ├── Entries
    │   │       │   │   ├── Repository
    │   │       │   │   └── Root
    │   │       │   ├── enter_evidence.m
    │   │       │   ├── gaussian_inf_engine.m
    │   │       │   ├── marginal_nodes.m
    │   │       │   └── private
    │   │       │       ├── CVS
    │   │       │       │   ├── Entries
    │   │       │       │   ├── Repository
    │   │       │       │   └── Root
    │   │       │       └── extract_params_from_gbn.m
    │   │       ├── @gibbs_sampling_inf_engine
    │   │       │   ├── CVS
    │   │       │   │   ├── Entries
    │   │       │   │   ├── Repository
    │   │       │   │   └── Root
    │   │       │   ├── enter_evidence.m
    │   │       │   ├── gibbs_sampling_inf_engine.m
    │   │       │   ├── marginal_nodes.m
    │   │       │   └── private
    │   │       │       ├── compute_children.m
    │   │       │       ├── compute_families_dbn.m
    │   │       │       ├── compute_families.m
    │   │       │       ├── compute_posterior.c
    │   │       │       ├── compute_posterior_dbn.m
    │   │       │       ├── compute_strides.m
    │   │       │       ├── CPT.m
    │   │       │       ├── CVS
    │   │       │       │   ├── Entries
    │   │       │       │   ├── Repository
    │   │       │       │   └── Root
    │   │       │       ├── get_cpts.m
    │   │       │       ├── get_slice_dbn.c
    │   │       │       ├── get_slice_dbn.m
    │   │       │       ├── my_sample_discrete.m
    │   │       │       └── sample_single_discrete.c
    │   │       ├── @global_joint_inf_engine
    │   │       │   ├── CVS
    │   │       │   │   ├── Entries
    │   │       │   │   ├── Repository
    │   │       │   │   └── Root
    │   │       │   ├── enter_evidence.m
    │   │       │   ├── find_mpe.m
    │   │       │   ├── global_joint_inf_engine.m
    │   │       │   ├── marginal_family.m
    │   │       │   └── marginal_nodes.m
    │   │       ├── @jtree_inf_engine
    │   │       │   ├── cliques_from_engine.m
    │   │       │   ├── clq_containing_nodes.m
    │   │       │   ├── collect_evidence.m
    │   │       │   ├── CVS
    │   │       │   │   ├── Entries
    │   │       │   │   ├── Entries.Log
    │   │       │   │   ├── Repository
    │   │       │   │   └── Root
    │   │       │   ├── distribute_evidence.m
    │   │       │   ├── enter_evidence.m
    │   │       │   ├── enter_soft_evidence.m
    │   │       │   ├── find_max_config.m
    │   │       │   ├── find_mpe.m
    │   │       │   ├── init_pot.m
    │   │       │   ├── jtree_inf_engine.m
    │   │       │   ├── marginal_family.m
    │   │       │   ├── marginal_nodes.m
    │   │       │   ├── Old
    │   │       │   │   ├── collect_evidence.m
    │   │       │   │   ├── CVS
    │   │       │   │   │   ├── Entries
    │   │       │   │   │   ├── Repository
    │   │       │   │   │   └── Root
    │   │       │   │   ├── distribute_evidence.m
    │   │       │   │   ├── enter_evidence.m
    │   │       │   │   └── enter_soft_evidence.m
    │   │       │   └── set_fields.m
    │   │       ├── @jtree_limid_inf_engine
    │   │       │   ├── CVS
    │   │       │   │   ├── Entries
    │   │       │   │   ├── Repository
    │   │       │   │   └── Root
    │   │       │   ├── enter_evidence.m
    │   │       │   ├── jtree_limid_inf_engine.m
    │   │       │   ├── marginal_family.m
    │   │       │   ├── marginal_nodes.m
    │   │       │   └── Old
    │   │       │       ├── CVS
    │   │       │       │   ├── Entries
    │   │       │       │   ├── Repository
    │   │       │       │   └── Root
    │   │       │       ├── marginal_family.m
    │   │       │       └── marginal_nodes_SS.m
    │   │       ├── @jtree_mnet_inf_engine
    │   │       │   ├── CVS
    │   │       │   │   ├── Entries
    │   │       │   │   ├── Repository
    │   │       │   │   └── Root
    │   │       │   ├── enter_evidence.m
    │   │       │   ├── find_mpe.m
    │   │       │   └── jtree_mnet_inf_engine.m
    │   │       ├── @jtree_sparse_inf_engine
    │   │       │   ├── cliques_from_engine.m
    │   │       │   ├── clq_containing_nodes.m
    │   │       │   ├── collect_evidence.c
    │   │       │   ├── CVS
    │   │       │   │   ├── Entries
    │   │       │   │   ├── Entries.Log
    │   │       │   │   ├── Repository
    │   │       │   │   └── Root
    │   │       │   ├── distribute_evidence.c
    │   │       │   ├── enter_evidence.m
    │   │       │   ├── enter_soft_evidence.m
    │   │       │   ├── init_pot.c
    │   │       │   ├── jtree_sparse_inf_engine.m
    │   │       │   ├── marginal_family.m
    │   │       │   ├── marginal_nodes.m
    │   │       │   ├── old
    │   │       │   │   ├── collect_evidence.c
    │   │       │   │   ├── CVS
    │   │       │   │   │   ├── Entries
    │   │       │   │   │   ├── Repository
    │   │       │   │   │   └── Root
    │   │       │   │   ├── distribute_evidence.c
    │   │       │   │   ├── init_pot1.c
    │   │       │   │   ├── init_pot1.m
    │   │       │   │   └── init_pot.c
    │   │       │   └── set_fields.m
    │   │       ├── @likelihood_weighting_inf_engine
    │   │       │   ├── CVS
    │   │       │   │   ├── Entries
    │   │       │   │   ├── Repository
    │   │       │   │   └── Root
    │   │       │   ├── enter_evidence.m
    │   │       │   ├── likelihood_weighting_inf_engine.m
    │   │       │   └── marginal_nodes.m
    │   │       ├── @pearl_inf_engine
    │   │       │   ├── bethe_free_energy.m
    │   │       │   ├── CVS
    │   │       │   │   ├── Entries
    │   │       │   │   ├── Entries.Log
    │   │       │   │   ├── Repository
    │   │       │   │   └── Root
    │   │       │   ├── enter_evidence.m
    │   │       │   ├── loopy_converged.m
    │   │       │   ├── marginal_family.m
    │   │       │   ├── marginal_nodes.m
    │   │       │   ├── pearl_inf_engine.m
    │   │       │   ├── pearl_inf_engine.m~
    │   │       │   └── private
    │   │       │       ├── compute_bel.m
    │   │       │       ├── CVS
    │   │       │       │   ├── Entries
    │   │       │       │   ├── Repository
    │   │       │       │   └── Root
    │   │       │       ├── parallel_protocol.m
    │   │       │       ├── parallel_protocol.m~
    │   │       │       ├── prod_lambda_msgs.m
    │   │       │       └── tree_protocol.m
    │   │       ├── @quickscore_inf_engine
    │   │       │   ├── CVS
    │   │       │   │   ├── Entries
    │   │       │   │   ├── Repository
    │   │       │   │   └── Root
    │   │       │   ├── enter_evidence.m
    │   │       │   ├── marginal_nodes.m
    │   │       │   ├── private
    │   │       │   │   ├── C_quickscore.c
    │   │       │   │   ├── CVS
    │   │       │   │   │   ├── Entries
    │   │       │   │   │   ├── Repository
    │   │       │   │   │   └── Root
    │   │       │   │   ├── nr.h
    │   │       │   │   ├── nrutil.c
    │   │       │   │   ├── nrutil.h
    │   │       │   │   └── quickscore.m
    │   │       │   └── quickscore_inf_engine.m
    │   │       ├── @stab_cond_gauss_inf_engine
    │   │       │   ├── clq_containing_nodes.m
    │   │       │   ├── CVS
    │   │       │   │   ├── Entries
    │   │       │   │   ├── Entries.Log
    │   │       │   │   ├── Repository
    │   │       │   │   └── Root
    │   │       │   ├── enter_evidence.m
    │   │       │   ├── marginal_difclq_nodes.m
    │   │       │   ├── marginal_nodes.m
    │   │       │   ├── marginal_singleclq_nodes.m
    │   │       │   ├── Old
    │   │       │   │   ├── CVS
    │   │       │   │   │   ├── Entries
    │   │       │   │   │   ├── Repository
    │   │       │   │   │   └── Root
    │   │       │   │   └── initialize_engine.m
    │   │       │   ├── problems.txt
    │   │       │   ├── push.m
    │   │       │   ├── push_pot_toclique.m
    │   │       │   ├── README
    │   │       │   └── stab_cond_gauss_inf_engine.m
    │   │       └── @var_elim_inf_engine
    │   │           ├── CVS
    │   │           │   ├── Entries
    │   │           │   ├── Repository
    │   │           │   └── Root
    │   │           ├── enter_evidence.m
    │   │           ├── find_mpe.m
    │   │           ├── marginal_nodes.m
    │   │           └── var_elim_inf_engine.m
    │   ├── installC_BNT.m
    │   ├── installC_graph.m
    │   ├── learning
    │   │   ├── bayes_update_params.m
    │   │   ├── bic_score_family.m
    │   │   ├── compute_cooling_schedule.m
    │   │   ├── CovMat.m
    │   │   ├── CVS
    │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   └── Root
    │   │   ├── dirichlet_score_family.m
    │   │   ├── kpm_learn_struct_mcmc.m
    │   │   ├── learn_params_dbn_em.m
    │   │   ├── learn_params_dbn.m
    │   │   ├── learn_params_em.m
    │   │   ├── learn_params.m
    │   │   ├── learn_struct_dbn_reveal.m
    │   │   ├── learn_struct_K2.m
    │   │   ├── learn_struct_mcmc.m
    │   │   ├── learn_struct_pdag_ic_star.m
    │   │   ├── learn_struct_pdag_pc_constrain.m
    │   │   ├── learn_struct_pdag_pc.m
    │   │   ├── mcmc_sample_to_hist.m
    │   │   ├── mk_schedule.m
    │   │   ├── mk_tetrad_data_file.m
    │   │   ├── score_dags.m
    │   │   ├── score_dags_old.m
    │   │   └── score_family.m
    │   ├── license.gpl.txt
    │   ├── potentials
    │   │   ├── @cgpot
    │   │   │   ├── cg_can_to_mom.m
    │   │   │   ├── cg_mom_to_can.m
    │   │   │   ├── cgpot.m
    │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   ├── Entries.Log
    │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   ├── display.m
    │   │   │   ├── divide_by_pot.m
    │   │   │   ├── domain_pot.m
    │   │   │   ├── enter_cts_evidence_pot.m
    │   │   │   ├── enter_discrete_evidence_pot.m
    │   │   │   ├── marginalize_pot.m
    │   │   │   ├── multiply_by_pot.m
    │   │   │   ├── multiply_pots.m
    │   │   │   ├── normalize_pot.m
    │   │   │   ├── Old
    │   │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   │   ├── normalize_pot.m
    │   │   │   │   ├── set_domain_pot.m
    │   │   │   │   └── simple_marginalize_pot.m
    │   │   │   ├── pot_to_marginal.m
    │   │   │   └── set_domain_pot.m
    │   │   ├── check_for_cd_arcs.m
    │   │   ├── CPD_to_pot.m
    │   │   ├── @cpot
    │   │   │   ├── cpot.m
    │   │   │   ├── cpot_to_mpot.m
    │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   ├── Entries.Log
    │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   ├── display.m
    │   │   │   ├── divide_by_pot.m
    │   │   │   ├── domain_pot.m
    │   │   │   ├── enter_cts_evidence_pot.m
    │   │   │   ├── marginalize_pot.m
    │   │   │   ├── multiply_by_pot.m
    │   │   │   ├── multiply_pots.m
    │   │   │   ├── normalize_pot.m
    │   │   │   ├── Old
    │   │   │   │   ├── cpot_to_mpot.m
    │   │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   │   └── normalize_pot.convert.m
    │   │   │   ├── pot_to_marginal.m
    │   │   │   ├── rescale_pot.m
    │   │   │   └── set_domain_pot.m
    │   │   ├── CVS
    │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   ├── Entries.Log
    │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   └── Root
    │   │   ├── determine_pot_type.m
    │   │   ├── @dpot
    │   │   │   ├── approxeq_pot.m
    │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   ├── display.m
    │   │   │   ├── divide_by_pot.m
    │   │   │   ├── domain_pot.m
    │   │   │   ├── dpot.m
    │   │   │   ├── dpot_to_table.m
    │   │   │   ├── find_most_prob_entry.m
    │   │   │   ├── get_fields.m
    │   │   │   ├── marginalize_pot.m
    │   │   │   ├── multiply_by_pot.m
    │   │   │   ├── multiply_pots.m
    │   │   │   ├── normalize_pot.m
    │   │   │   ├── pot_to_marginal.m
    │   │   │   ├── set_domain_pot.m
    │   │   │   ├── subsasgn.m
    │   │   │   └── subsref.m
    │   │   ├── genops.c
    │   │   ├── mk_initial_pot.m
    │   │   ├── @mpot
    │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   ├── display.m
    │   │   │   ├── marginalize_pot.m
    │   │   │   ├── mpot.m
    │   │   │   ├── mpot_to_cpot.m
    │   │   │   ├── normalize_pot.m
    │   │   │   ├── pot_to_marginal.m
    │   │   │   ├── rescale_pot.m
    │   │   │   └── set_domain_pot.m
    │   │   ├── Old
    │   │   │   ├── comp_eff_node_sizes.m
    │   │   │   └── CVS
    │   │   │       ├── Entries
    │   │   │       ├── Repository
    │   │   │       └── Root
    │   │   ├── README
    │   │   ├── @scgcpot
    │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   ├── marginalize_pot.m
    │   │   │   ├── normalize_pot.m
    │   │   │   ├── reduce_pot.m
    │   │   │   ├── rescale_pot.m
    │   │   │   └── scgcpot.m
    │   │   ├── @scgpot
    │   │   │   ├── combine_pots.m
    │   │   │   ├── complement_pot.m
    │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   ├── direct_combine_pots.m
    │   │   │   ├── extension_pot.m
    │   │   │   ├── marginalize_pot.m
    │   │   │   ├── normalize_pot.m
    │   │   │   ├── pot_to_marginal.m
    │   │   │   ├── README
    │   │   │   ├── recursive_combine_pots.m
    │   │   │   ├── reduce_pot.m
    │   │   │   └── scgpot.m
    │   │   ├── Tables
    │   │   │   ├── CVS
    │   │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   │   └── Root
    │   │   │   ├── divide_by_sparse_table.c
    │   │   │   ├── divide_by_table.c
    │   │   │   ├── divide_by_table.m
    │   │   │   ├── extend_domain_table.m
    │   │   │   ├── marg_sparse_table.c
    │   │   │   ├── marg_table.c
    │   │   │   ├── marg_tableC.c
    │   │   │   ├── marg_table.m
    │   │   │   ├── marg_tableM.m
    │   │   │   ├── mult_by_sparse_table.c
    │   │   │   ├── mult_by_table2.m
    │   │   │   ├── mult_by_table.c
    │   │   │   ├── mult_by_tableC.c
    │   │   │   ├── mult_by_table_global.m
    │   │   │   ├── mult_by_table.m
    │   │   │   ├── mult_by_tableM.m
    │   │   │   ├── repmat_and_mult.c
    │   │   │   └── rep_mult.c
    │   │   └── @upot
    │   │       ├── approxeq_pot.m
    │   │       ├── CVS
    │   │       │   ├── Entries
    │   │       │   ├── Repository
    │   │       │   └── Root
    │   │       ├── display.m
    │   │       ├── divide_by_pot.m
    │   │       ├── marginalize_pot.m
    │   │       ├── multiply_by_pot.m
    │   │       ├── normalize_pot.m
    │   │       ├── pot_to_marginal.m
    │   │       ├── upot.m
    │   │       └── upot_to_opt_policy.m
    │   ├── README.txt
    │   ├── test_BNT.m
    │   ├── test_BNT.m~
    │   └── uninstallC_BNT.m
    ├── ChangeLog.Sourceforge.txt
    ├── #ChangeLog.txt#
    ├── ChangeLog.txt
    ├── CVS
    │   ├── Entries
    │   ├── Entries.Log
    │   ├── Repository
    │   └── Root
    ├── foptions.m
    ├── genpathKPM.m
    ├── graph
    │   ├── acyclic.m
    │   ├── assignEdgeNums.m
    │   ├── best_first_elim_order.m
    │   ├── check_jtree_property.m
    │   ├── check_triangulated.m
    │   ├── children.m
    │   ├── cliques_to_jtree.m
    │   ├── cliques_to_strong_jtree.m
    │   ├── connected_graph.m
    │   ├── CVS
    │   │   ├── Entries
    │   │   ├── Entries.Log
    │   │   ├── Repository
    │   │   └── Root
    │   ├── dag_to_essential_graph.m
    │   ├── dfs.m
    │   ├── dfs_test.m
    │   ├── dijkstra.m
    │   ├── family.m
    │   ├── graph_separated.m
    │   ├── graph_to_jtree.m
    │   ├── minimum_spanning_tree.m
    │   ├── minspan.m
    │   ├── min_subtree_con_nodes.m
    │   ├── mk_2D_lattice.m
    │   ├── mk_2D_lattice_slow.m
    │   ├── mk_adjmat_chain.m
    │   ├── mk_adj_mat.m
    │   ├── mk_all_dags.m
    │   ├── mk_nbrs_of_dag.m
    │   ├── mk_nbrs_of_digraph_broken.m
    │   ├── mk_nbrs_of_digraph.m
    │   ├── mk_nbrs_of_digraph_not_vectorized.m
    │   ├── mk_rnd_dag_given_edge_prob.m
    │   ├── mk_rnd_dag.m
    │   ├── mk_rooted_tree.m
    │   ├── mk_undirected.m
    │   ├── moralize.m
    │   ├── neighbors.m
    │   ├── Old
    │   │   ├── best_first_elim_order.m
    │   │   ├── CVS
    │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   └── Root
    │   │   ├── dag_to_jtree.m
    │   │   ├── dfs.m
    │   │   ├── dsep_test.m
    │   │   └── mk_2D_lattice_slow.m
    │   ├── parents.m
    │   ├── pred2path.m
    │   ├── reachability_graph.m
    │   ├── README.txt
    │   ├── scc.m
    │   ├── strong_elim_order.m
    │   ├── test.m
    │   ├── test_strong_root.m
    │   ├── topological_sort.m
    │   ├── trees.txt
    │   ├── triangulate_2Dlattice_demo.m
    │   ├── triangulate.c
    │   ├── triangulate.m
    │   └── triangulate_test.m
    ├── GraphViz
    │   ├── approxeq.m
    │   ├── arrow.m
    │   ├── CVS
    │   │   ├── Entries
    │   │   ├── Entries.Log
    │   │   ├── Repository
    │   │   └── Root
    │   ├── dot_to_graph.m
    │   ├── draw_dbn.m
    │   ├── draw_dbn_test.m
    │   ├── draw_dot.m
    │   ├── draw_graph.m
    │   ├── draw_graph_test.m
    │   ├── draw_hmm.m
    │   ├── editGraphGUI.m
    │   ├── graph_to_dot.m
    │   ├── make_layout.m
    │   ├── my_call.m
    │   ├── Old
    │   │   ├── CVS
    │   │   │   ├── Entries
    │   │   │   ├── Repository
    │   │   │   └── Root
    │   │   ├── dot_to_graph.m
    │   │   ├── draw_dot.m
    │   │   ├── draw_graph.m
    │   │   ├── graphToDot.m
    │   │   └── pre_pesha_graph_to_dot.m
    │   ├── process_options.m
    │   └── README.txt
    ├── HMM
    │   ├── CVS
    │   │   ├── Entries
    │   │   ├── Repository
    │   │   └── Root
    │   ├── dhmm_em_demo.m
    │   ├── dhmm_em.m
    │   ├── dhmm_em_online_demo.m
    │   ├── dhmm_em_online.m
    │   ├── dhmm_logprob_brute_force.m
    │   ├── dhmm_logprob.m
    │   ├── dhmm_logprob_path.m
    │   ├── dhmm_sample_endstate.m
    │   ├── dhmm_sample.m
    │   ├── fixed_lag_smoother_demo.m
    │   ├── fixed_lag_smoother.m
    │   ├── fwdback.m
    │   ├── gausshmm_train_observed.m
    │   ├── mc_sample_endstate.m
    │   ├── mc_sample.m
    │   ├── mdp_sample.m
    │   ├── mhmm_em_demo.m
    │   ├── mhmm_em.m
    │   ├── mhmm_logprob.m
    │   ├── mhmmParzen_train_observed.m
    │   ├── mhmm_sample.m
    │   ├── mk_leftright_transmat.m
    │   ├── mk_rightleft_transmat.m
    │   ├── pomdp_sample.m
    │   ├── README.txt
    │   ├── testHMM.m
    │   ├── transmat_train_observed.m
    │   └── viterbi_path.m
    ├── Kalman
    │   ├── AR_to_SS.m
    │   ├── convert_to_lagged_form.m
    │   ├── CVS
    │   │   ├── Entries
    │   │   ├── Repository
    │   │   └── Root
    │   ├── ensure_AR.m
    │   ├── eval_AR_perf.m
    │   ├── kalman_filter.m
    │   ├── kalman_forward_backward.m
    │   ├── kalman_smoother.m
    │   ├── kalman_update.m
    │   ├── learn_AR_diagonal.m
    │   ├── learn_AR.m
    │   ├── learning_demo.m
    │   ├── learn_kalman.m
    │   ├── README.txt
    │   ├── sample_lds.m
    │   ├── smooth_update.m
    │   ├── SS_to_AR.m
    │   ├── testKalman.m
    │   └── tracking_demo.m
    ├── KPMstats
    │   ├── beta_sample.m
    │   ├── chisquared_histo.m
    │   ├── chisquared_prob.m
    │   ├── chisquared_readme.txt
    │   ├── chisquared_table.m
    │   ├── clg_Mstep.m
    │   ├── clg_Mstep_simple.m
    │   ├── clg_prob.m
    │   ├── condgauss_sample.m
    │   ├── condGaussToJoint.m
    │   ├── condgaussTrainObserved.m
    │   ├── cond_indep_fisher_z.m
    │   ├── convertBinaryLabels.m
    │   ├── CVS
    │   │   ├── Entries
    │   │   ├── Repository
    │   │   └── Root
    │   ├── cwr_demo.m
    │   ├── cwr_em.m
    │   ├── cwr_predict.m
    │   ├── cwr_prob.m
    │   ├── cwr_readme.txt
    │   ├── cwr_test.m
    │   ├── dirichletpdf.m
    │   ├── dirichletrnd.m
    │   ├── dirichlet_sample.m
    │   ├── distchck.m
    │   ├── eigdec.m
    │   ├── est_transmat.m
    │   ├── fit_paritioned_model_testfn.m
    │   ├── fit_partitioned_model.m
    │   ├── gamma_sample.m
    │   ├── gaussian_prob.m
    │   ├── gaussian_sample.m
    │   ├── histCmpChi2.m
    │   ├── KLgauss.m
    │   ├── linear_regression.m
    │   ├── logist2Apply.m
    │   ├── logist2ApplyRegularized.m
    │   ├── logist2Fit.m
    │   ├── logist2FitRegularized.m
    │   ├── logist2.m
    │   ├── logistK_eval.m
    │   ├── logistK.m
    │   ├── marginalize_gaussian.m
    │   ├── matrix_normal_pdf.m
    │   ├── matrix_T_pdf.m
    │   ├── mc_stat_distrib.m
    │   ├── mixgauss_classifier_apply.m
    │   ├── mixgauss_classifier_train.m
    │   ├── mixgauss_em.m
    │   ├── mixgauss_init.m
    │   ├── mixgauss_Mstep.m
    │   ├── mixgauss_prob.m
    │   ├── mixgauss_prob_test.m
    │   ├── mixgauss_sample.m
    │   ├── mkPolyFvec.m
    │   ├── mk_unit_norm.m
    │   ├── multinomial_prob.m
    │   ├── multinomial_sample.m
    │   ├── multipdf.m
    │   ├── multirnd.m
    │   ├── normal_coef.m
    │   ├── partial_corr_coef.m
    │   ├── parzenC.c
    │   ├── parzenC.dll
    │   ├── parzenC.mexglx
    │   ├── parzenC_test.m
    │   ├── parzen_fit_select_unif.m
    │   ├── parzen.m
    │   ├── pca.m
    │   ├── README.txt
    │   ├── rndcheck.m
    │   ├── sample_discrete.m
    │   ├── sample_gaussian.m
    │   ├── sample.m
    │   ├── standardize.m
    │   ├── student_t_logprob.m
    │   ├── student_t_prob.m
    │   ├── test_dir.m
    │   ├── unidrndKPM.m
    │   ├── unif_discrete_sample.m
    │   └── weightedRegression.m
    ├── KPMtools
    │   ├── approxeq.m
    │   ├── approx_unique.m
    │   ├── argmax.m
    │   ├── argmin.m
    │   ├── asdemo.html
    │   ├── asdemo.m
    │   ├── asort.m
    │   ├── assert.m
    │   ├── assign_cols.m
    │   ├── assignEdgeNums.m
    │   ├── axis_pct.m
    │   ├── bipartiteMatchingDemo.m
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