蛋白质网络聚类算法分析平台ClusterE 插件开发包.zip

【实例简介】
蛋白质网络聚类是识别功能模块的重要手段，不仅有利于理解生物系统的组织结构，对预测蛋白质功能也具有重要的意义。针对目前蛋白质网络聚类算法缺乏有效分析软件的事实，本文设计并实现了一个新的蛋白质网络聚类算法分析平台ClusterE。该平台实现了查全率、查准率、敏感性、特异性、功能富集分析等聚类评估方法，并且集成了FAG-EC、Dpclus、Monet、IPC-MCE、IPCA等聚类算法，不仅可以对蛋白质网络聚类分析结果进行可视化，并且可以在不同聚类分析指标下对多个聚类算法进行可视化比较与分析。该平台具有良好的扩展性，其中聚类算法以及聚类评估方法都是以插件形式集成到系统中。 关 键 词: 聚类算法;评估方法;可扩展平台;蛋白质网络; 该资源是用来开发基于ClusterE系统插件的开发包 由于上传容量受限 ClusterE完整系统无法上传上来， 将该项目解压 导入到eclipse中 以ecpise_plugin方式便可以运行，用户可以开发基于本系统的插件 开发手册将会在稍后上传
【实例截图】
【核心代码】
4744300845376015994.zip
└── ClusterE_plugin
├── bin
│   ├── com
│   │   └── wuxuehong
│   │   └── plugin
│   │   ├── TestAlgorithm$1.class
│   │   └── TestAlgorithm.class
│   └── plugin.xml
├── build.properties
├── ClusterE.product
├── ComplexFunction
│   ├── GO.annotation
│   ├── Go.Component
│   ├── Go.Function
│   ├── Go.Process
│   ├── MIPS.annotation
│   └── MIPS.protein
├── icons
│   ├── alt_about.gif
│   ├── alt_launcher.icns
│   ├── alt_launcher.ico
│   ├── alt_launcher.xpm
│   ├── alt_window_16.gif
│   ├── alt_window_32.gif
│   ├── config.ico
│   ├── expand.ico
│   ├── file_open.ico
│   ├── filesave.ico
│   ├── help.ico
│   ├── layout.ico
│   ├── manage.ico
│   ├── open.ico
│   ├── pictureSave.ico
│   ├── random.ico
│   ├── reduce.ico
│   ├── setting.ico
│   ├── vew.ico
│   └── view.ico
├── lib
│   ├── clustere.jar
│   ├── commons-logging.jar
│   ├── jcommon-1.0.16.jar
│   ├── jfreechart-1.0.13.jar
│   ├── jfreechart-1.0.13-swt.jar
│   ├── jpf-boot.jar
│   ├── jpf.jar
│   ├── jpf-tools.jar
│   ├── jxl.jar
│   └── jxp.jar
├── META-INF
│   └── MANIFEST.MF
├── plugin_customization.ini
├── plugin.xml
├── splash.bmp
├── src
│   ├── com
│   │   └── wuxuehong
│   │   └── plugin
│   │   └── TestAlgorithm.java
│   └── plugin.xml
├── swt-awt-win32-3557.dll
├── swt-gdip-win32-3557.dll
├── swt-wgl-win32-3557.dll
├── swt-win32-3557.dll
└── swt-xulrunner-win32-3557.dll

13 directories, 52 files