MCScanX：MCScanX：多重共线性扫描工具包X版本。 世界上最流行的同义词分析工具！-源码.zip

【实例简介】
MCScanX：MCScanX：多重共线性扫描工具包X版本。 世界上最流行的同义词分析工具！
【实例截图】
【核心代码】
16359647308853424231.zip
└── MCScanX-master
├── cls.cc
├── cls.h
├── dagchainer.cc
├── dagchainer.h
├── data
│   ├── AAAP_family.tree
│   ├── at.blast
│   ├── at.cds
│   ├── at.gff
│   ├── at_gm_pt_vv.gff
│   ├── at_gm_pt_vv.homology
│   ├── at_MCL_families.txt
│   ├── at_vv.blast
│   ├── at_vv.gff
│   ├── MADS_box_family.txt
│   ├── MADS_box.txt
│   ├── os_sb.blast
│   └── os_sb.gff
├── detect_collinear_tandem_arrays.cc
├── detect_collinear_tandem_arrays.h
├── detect_syntenic_tandem_arrays.cc
├── detect_syntenic_tandem_arrays.h
├── dissect_multiple_alignment.cc
├── dissect_multiple_alignment.h
├── downstream_analyses
│   ├── add_ka_and_ks_to_collinearity.pl
│   ├── add_kaks_to_synteny.pl
│   ├── bar.ctl
│   ├── bar_plotter.java
│   ├── branch.java
│   ├── circle.ctl
│   ├── circle_plotter.java
│   ├── Cubic.java
│   ├── detect_collinearity_within_gene_families.pl
│   ├── detect_synteny_within_gene_families.pl
│   ├── dot.ctl
│   ├── dot_plotter.java
│   ├── dual_synteny.ctl
│   ├── dual_synteny_plotter.java
│   ├── family_circle_plotter.java
│   ├── family.ctl
│   ├── family_tree_plotter_chr.java
│   ├── family_tree_plotter.java
│   ├── family_tree_plotter_show_length.java
│   ├── group_collinear_genes.pl
│   ├── group_syntenic_genes.pl
│   ├── makefile
│   ├── node.java
│   ├── origin_enrichment_analysis.pl
│   └── rt.java
├── dup_classifier.cc
├── dup_classifier.h
├── makefile
├── mcscan.cc
├── mcscan.h
├── mcscan_h.cc
├── mcscan_h.h
├── msa.cc
├── msa.h
├── out_homology.cc
├── out_utils.cc
├── out_utils.h
├── permutation.cc
├── permutation.h
├── read_data.cc
├── read_data.h
├── read_homology.cc
├── read_homology.h
├── README.rst
├── readme.txt
├── struct.cc
└── struct.h

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