实例介绍
【实例简介】
camelyon16竞赛源代码camelyon16竞赛源代码camelyon16竞赛源代码camelyon16竞赛源代码
【实例截图】
【核心代码】
4744300845393807342.rar
└── camelyon
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├── CAMELYON16-Challenge-master
│ ├── Camelyon2016_Release
│ │ ├── Program
│ │ │ └── Camelyon_VGGRes
│ │ │ ├── PredictWSI
│ │ │ │ ├── ClusterTest_V2.01.py
│ │ │ │ ├── Deploys
│ │ │ │ │ ├── Res-152-deploy.prototxt
│ │ │ │ │ └── VGG_16_deploy.prototxt
│ │ │ │ ├── Evaluation_Classification.py
│ │ │ │ ├── Evaluation_Classification.py~
│ │ │ │ ├── Readme.txt
│ │ │ │ ├── Readme.txt~
│ │ │ │ ├── Untitled Document~
│ │ │ │ ├── VGGResDetecter_001to130.py
│ │ │ │ └── VGGResDetecter_001to130.py~
│ │ │ ├── Readme.txt
│ │ │ ├── Readme.txt~
│ │ │ ├── TestTrainData
│ │ │ │ ├── ResDetecter
│ │ │ │ │ ├── ClusterTest_V2.01.py
│ │ │ │ │ ├── ClusterTest_V2.01.py~
│ │ │ │ │ ├── Deploys
│ │ │ │ │ │ └── Res-152-deploy.prototxt
│ │ │ │ │ ├── Evaluation_FROC.py
│ │ │ │ │ ├── Readme.txt
│ │ │ │ │ ├── Readme.txt~
│ │ │ │ │ ├── RefinedResults
│ │ │ │ │ │ ├── Tumor_001_ColorLabel.jpg
│ │ │ │ │ │ └── Tumor_001.csv
│ │ │ │ │ ├── ResResults
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│ │ │ │ │ │ ├── Tumor_001.csv
│ │ │ │ │ │ └── Tumor_001_pred.jpg
│ │ │ │ │ ├── ResTool_SlideTesterCrossLv_001_110.py
│ │ │ │ │ ├── ResTool_SlideTesterCrossLv_001_110.py~
│ │ │ │ │ └── VGGcsvDir
│ │ │ │ │ └── Tumor_001.csv
│ │ │ │ └── VGGDetecter
│ │ │ │ ├── CorrTxtMaker.py
│ │ │ │ ├── CorrTxtMaker.py~
│ │ │ │ ├── Deploys
│ │ │ │ │ └── VGG_16_deploy.prototxt
│ │ │ │ ├── Evaluation_FROC.py
│ │ │ │ ├── Evaluation_FROC.py~
│ │ │ │ ├── Readme.txt
│ │ │ │ ├── Readme.txt~
│ │ │ │ ├── VGGResults
│ │ │ │ │ ├── Tumor_001_Accuracy.txt
│ │ │ │ │ ├── Tumor_001_coor.txt
│ │ │ │ │ ├── Tumor_001.csv
│ │ │ │ │ └── Tumor_001_pred.jpg
│ │ │ │ ├── VGGTool_SlideTesterCrossLv_001_040.py~
│ │ │ │ ├── VGGTool_SlideTesterCrossLv_001_110.py
│ │ │ │ └── VGGTool_SlideTesterCrossLv_001_110.py~
│ │ │ └── Train
│ │ │ ├── CorrTxtMaker.py
│ │ │ ├── CorrTxtMaker.py~
│ │ │ ├── Deploys
│ │ │ │ ├── Res-152-deploy.prototxt
│ │ │ │ ├── Res_152_train_val.prototxt
│ │ │ │ ├── ResSolver.prototxt
│ │ │ │ ├── VGG_16_deploy.prototxt
│ │ │ │ ├── VGG_16_train_val.prototxt
│ │ │ │ └── VGGSolver.prototxt
│ │ │ ├── Readme.txt
│ │ │ ├── Readme.txt~
│ │ │ ├── ResRandomTrainer_L0.py
│ │ │ ├── ResRandomTrainer_L0.py~
│ │ │ ├── ResSnapshots_L0
│ │ │ │ └── Tumor_001.csv
│ │ │ ├── VGGRandomTrainer_L1.py
│ │ │ ├── VGGRandomTrainer_L1.py~
│ │ │ ├── VGGRandomTrainer.py~
│ │ │ └── VGGSnapshots_L1
│ │ │ └── Tumor_001_coor.txt
│ │ └── Readme.txt~
│ ├── Camelyon_VGG_L1
│ │ ├── Detecter and Evaluation
│ │ │ ├── ClusterTest.py
│ │ │ ├── ClusterTest_V2.py
│ │ │ ├── Evaluation_Classification.py
│ │ │ └── VGGTool_SlideTesterCrossLv_ForTestData.py
│ │ ├── solver.prototxt
│ │ ├── TxtDataMaker
│ │ │ ├── ForTest
│ │ │ │ └── VGGTool_TxtMakerCrossLv_001_110.py
│ │ │ └── ForTrain
│ │ │ └── VGGTool_TxtMakerCrossLv_001_110.py
│ │ ├── VGG_16_deploy.prototxt
│ │ ├── VGG_16_train_val.prototxt
│ │ └── VGGTool_SlideTrainerCrossLv_Random.py
│ ├── Camelyon_VGGRes
│ │ ├── Detecter and Evaluation
│ │ │ ├── Evaluation_Classification.py
│ │ │ └── VGGResDetecter_001to130.py
│ │ ├── Res-152-deploy.prototxt
│ │ ├── Res_152_train_val.prototxt
│ │ ├── ResDetecter_L0_V3(R13_rc4)
│ │ │ ├── ClusterTest_V2.01.py
│ │ │ ├── ClusterTest_V2.01.py~
│ │ │ ├── ClusterTest_V2.py
│ │ │ ├── Evaluation_FROC.py
│ │ │ ├── Evaluation_FROC.py~
│ │ │ ├── Readme.txt
│ │ │ ├── Readme.txt~
│ │ │ ├── ResTool_SlideTesterCrossLv_001_055.py~
│ │ │ ├── ResTool_SlideTesterCrossLv_001_110.py
│ │ │ ├── ResTool_SlideTesterCrossLv_001_110.py~
│ │ │ └── ResTool_SlideTesterCrossLv_056_110.py~
│ │ ├── ResRandomTrainer_L0.py
│ │ ├── ResRandomTrainer_L1.py
│ │ ├── ResRandomTrainer_L2.py
│ │ ├── ResSolver.prototxt
│ │ ├── VGG_16_deploy.prototxt
│ │ ├── VGG_16_train_val.prototxt
│ │ ├── VGGDetecter
│ │ │ ├── Evaluation_FROC.py
│ │ │ ├── VGGTool_SlideTesterCrossLv_001_040.py~
│ │ │ └── VGGTool_SlideTesterCrossLv_001_110.py
│ │ ├── VGGRandomTrainer.py
│ │ └── VGGSolver.prototxt
│ ├── MyEvaluation
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│ ├── README.md
│ └── Scanffold Codes
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│ ├── ClusterTest_V2.py
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│ ├── VGGTool_SlideTesterCrossLv_ForTestData.py
│ ├── VGGTool_SlideTesterCrossLv.py
│ ├── VGGTool_SlideTrainerCrossLv_Random.py
│ └── VGGTool_TxtMakerCrossLv_ForTestData.py
├── CAMELYON16-Challenge-master.zip
├── camelyon16-grand-challenge-master
│ └── camelyon16-grand-challenge-master
│ ├── camelyon16
│ │ ├── inception
│ │ │ ├── dataset.py
│ │ │ ├── image_processing.py
│ │ │ ├── inception_distributed_train.py
│ │ │ ├── inception_eval.py
│ │ │ ├── inception_model.py
│ │ │ ├── inception_train.py
│ │ │ ├── __init__.py
│ │ │ ├── model.ckpt-0.meta
│ │ │ ├── __pycache__
│ │ │ │ ├── dataset.cpython-35.pyc
│ │ │ │ ├── image_processing.cpython-35.pyc
│ │ │ │ ├── inception_eval.py
│ │ │ │ ├── inception_model.cpython-35.pyc
│ │ │ │ ├── __init__.cpython-35.pyc
│ │ │ │ └── slim.cpython-35.pyc
│ │ │ ├── slim
│ │ │ │ ├── BUILD
│ │ │ │ ├── collections_test.py
│ │ │ │ ├── inception_model.py
│ │ │ │ ├── inception_test.py
│ │ │ │ ├── __init__.py
│ │ │ │ ├── losses.py
│ │ │ │ ├── losses_test.py
│ │ │ │ ├── ops.py
│ │ │ │ ├── ops_test.py
│ │ │ │ ├── __pycache__
│ │ │ │ │ ├── inception_model.cpython-35.pyc
│ │ │ │ │ ├── __init__.cpython-35.pyc
│ │ │ │ │ ├── losses.cpython-35.pyc
│ │ │ │ │ ├── ops.cpython-35.pyc
│ │ │ │ │ ├── scopes.cpython-35.pyc
│ │ │ │ │ ├── slim.cpython-35.pyc
│ │ │ │ │ └── variables.cpython-35.pyc
│ │ │ │ ├── README.md
│ │ │ │ ├── scopes.py
│ │ │ │ ├── scopes_test.py
│ │ │ │ ├── slim.py
│ │ │ │ ├── variables.py
│ │ │ │ └── variables_test.py
│ │ │ ├── slim.py
│ │ │ └── test.py
│ │ ├── __init__.py
│ │ ├── Notes
│ │ ├── ops
│ │ │ ├── file_ops.py
│ │ │ ├── __init__.py
│ │ │ ├── prob_to_heatmap.py
│ │ │ ├── __pycache__
│ │ │ │ ├── __init__.cpython-35.pyc
│ │ │ │ └── wsi_ops.cpython-35.pyc
│ │ │ ├── wsi_ops.py
│ │ │ └── wsi_ops_test.py
│ │ ├── postprocess
│ │ │ ├── build_heatmap_multi_thread.py
│ │ │ ├── build_heatmap.py
│ │ │ ├── build_tf_records_heatmap_multi_thread.py
│ │ │ ├── build_tf_records_heatmap.py
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│ │ │ ├── GT.csv
│ │ │ ├── __init__.py
│ │ │ ├── plot_rocs.py
│ │ │ ├── trees
│ │ │ │ ├── tree_0.dot
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│ │ │ ├── tumor_076_prob_new.png
│ │ │ ├── tumor_076_prob_old.png
│ │ │ ├── wsi_classification_modular.py
│ │ │ └── wsi_classification.py
│ │ ├── preprocess
│ │ │ ├── build_image_data.py
│ │ │ ├── build_tf_records.py
│ │ │ ├── extract_patches_old.py
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│ │ │ ├── __init__.py
│ │ │ ├── preprocess_data.py
│ │ │ └── stain_normalization.py
│ │ ├── __pycache__
│ │ │ ├── __init__.cpython-35.pyc
│ │ │ └── utils.cpython-35.pyc
│ │ ├── untitled2.py
│ │ └── utils.py
│ ├── presentation.pdf
│ ├── README.md
│ ├── report.pdf
│ └── results
│ ├── results_comparison.png
│ └── roc_proposed_system.png
├── camelyon16-grand-challenge-master.zip
└── report.pdf
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camelyon16竞赛源代码camelyon16竞赛源代码camelyon16竞赛源代码camelyon16竞赛源代码
【实例截图】
【核心代码】
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└── camelyon
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├── CAMELYON16-Challenge-master
│ ├── Camelyon2016_Release
│ │ ├── Program
│ │ │ └── Camelyon_VGGRes
│ │ │ ├── PredictWSI
│ │ │ │ ├── ClusterTest_V2.01.py
│ │ │ │ ├── Deploys
│ │ │ │ │ ├── Res-152-deploy.prototxt
│ │ │ │ │ └── VGG_16_deploy.prototxt
│ │ │ │ ├── Evaluation_Classification.py
│ │ │ │ ├── Evaluation_Classification.py~
│ │ │ │ ├── Readme.txt
│ │ │ │ ├── Readme.txt~
│ │ │ │ ├── Untitled Document~
│ │ │ │ ├── VGGResDetecter_001to130.py
│ │ │ │ └── VGGResDetecter_001to130.py~
│ │ │ ├── Readme.txt
│ │ │ ├── Readme.txt~
│ │ │ ├── TestTrainData
│ │ │ │ ├── ResDetecter
│ │ │ │ │ ├── ClusterTest_V2.01.py
│ │ │ │ │ ├── ClusterTest_V2.01.py~
│ │ │ │ │ ├── Deploys
│ │ │ │ │ │ └── Res-152-deploy.prototxt
│ │ │ │ │ ├── Evaluation_FROC.py
│ │ │ │ │ ├── Readme.txt
│ │ │ │ │ ├── Readme.txt~
│ │ │ │ │ ├── RefinedResults
│ │ │ │ │ │ ├── Tumor_001_ColorLabel.jpg
│ │ │ │ │ │ └── Tumor_001.csv
│ │ │ │ │ ├── ResResults
│ │ │ │ │ │ ├── Tumor_001_Accuracy.txt
│ │ │ │ │ │ ├── Tumor_001.csv
│ │ │ │ │ │ └── Tumor_001_pred.jpg
│ │ │ │ │ ├── ResTool_SlideTesterCrossLv_001_110.py
│ │ │ │ │ ├── ResTool_SlideTesterCrossLv_001_110.py~
│ │ │ │ │ └── VGGcsvDir
│ │ │ │ │ └── Tumor_001.csv
│ │ │ │ └── VGGDetecter
│ │ │ │ ├── CorrTxtMaker.py
│ │ │ │ ├── CorrTxtMaker.py~
│ │ │ │ ├── Deploys
│ │ │ │ │ └── VGG_16_deploy.prototxt
│ │ │ │ ├── Evaluation_FROC.py
│ │ │ │ ├── Evaluation_FROC.py~
│ │ │ │ ├── Readme.txt
│ │ │ │ ├── Readme.txt~
│ │ │ │ ├── VGGResults
│ │ │ │ │ ├── Tumor_001_Accuracy.txt
│ │ │ │ │ ├── Tumor_001_coor.txt
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│ │ │ │ ├── VGGTool_SlideTesterCrossLv_001_110.py
│ │ │ │ └── VGGTool_SlideTesterCrossLv_001_110.py~
│ │ │ └── Train
│ │ │ ├── CorrTxtMaker.py
│ │ │ ├── CorrTxtMaker.py~
│ │ │ ├── Deploys
│ │ │ │ ├── Res-152-deploy.prototxt
│ │ │ │ ├── Res_152_train_val.prototxt
│ │ │ │ ├── ResSolver.prototxt
│ │ │ │ ├── VGG_16_deploy.prototxt
│ │ │ │ ├── VGG_16_train_val.prototxt
│ │ │ │ └── VGGSolver.prototxt
│ │ │ ├── Readme.txt
│ │ │ ├── Readme.txt~
│ │ │ ├── ResRandomTrainer_L0.py
│ │ │ ├── ResRandomTrainer_L0.py~
│ │ │ ├── ResSnapshots_L0
│ │ │ │ └── Tumor_001.csv
│ │ │ ├── VGGRandomTrainer_L1.py
│ │ │ ├── VGGRandomTrainer_L1.py~
│ │ │ ├── VGGRandomTrainer.py~
│ │ │ └── VGGSnapshots_L1
│ │ │ └── Tumor_001_coor.txt
│ │ └── Readme.txt~
│ ├── Camelyon_VGG_L1
│ │ ├── Detecter and Evaluation
│ │ │ ├── ClusterTest.py
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│ ├── Camelyon_VGGRes
│ │ ├── Detecter and Evaluation
│ │ │ ├── Evaluation_Classification.py
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│ │ │ ├── Evaluation_FROC.py
│ │ │ ├── VGGTool_SlideTesterCrossLv_001_040.py~
│ │ │ └── VGGTool_SlideTesterCrossLv_001_110.py
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│ └── Scanffold Codes
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├── camelyon16-grand-challenge-master
│ └── camelyon16-grand-challenge-master
│ ├── camelyon16
│ │ ├── inception
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│ │ │ ├── image_processing.py
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│ │ │ ├── inception_train.py
│ │ │ ├── __init__.py
│ │ │ ├── model.ckpt-0.meta
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│ │ │ ├── slim
│ │ │ │ ├── BUILD
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│ │ ├── Notes
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│ │ │ ├── __init__.py
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│ │ │ └── stain_normalization.py
│ │ ├── __pycache__
│ │ │ ├── __init__.cpython-35.pyc
│ │ │ └── utils.cpython-35.pyc
│ │ ├── untitled2.py
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│ ├── presentation.pdf
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